| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | CP016816 | 20,041 | Δ175 bp | intergenic (‑762/‑201) | JCVSYN2_00065 ← / → JCVSYN2_00070 | hypothetical protein/tetracycline resistance ribosomal protection protein Tet(M) |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | CP016816 | 20041 | 20215 | 175 | 2335 [0] | [5] 2340 | JCVSYN2_00065/JCVSYN2_00070 | hypothetical protein/tetracycline resistance ribosomal protection protein Tet(M) |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | = 20040 | 0 (0.000) | 2122 (1.090) | 223/232 | 0.5 | 100.0% | intergenic (‑761/‑376) | JCVSYN2_00065/JCVSYN2_00070 | hypothetical protein/tetracycline resistance ribosomal protection protein Tet(M) |
| ? | CP016816 | 20216 = | 1 (0.000) | intergenic (‑937/‑200) | JCVSYN2_00065/JCVSYN2_00070 | hypothetical protein/tetracycline resistance ribosomal protection protein Tet(M) | |||||
Only 100 of 2340 total aligned reads displayed.
AGAAAACAGTGAAGCACCAGTTTCTGAACCAAAAGAAGACGAAAAAACAAAAAAAGATTAAGCAATTTATTTGGAAAATCTTTTTTTGTTTTTTTAAGAAATATTTATTGTTTTTTTTAAAAAATTATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCAATTAATAATTATTATTAATGTTATTTTTCTCTTATATATTCAATGTAATTTTAATTA > CP016816/20090‑20343 | ataaaaggtagtatttgttggcgatccccctagagtcttttacatcttcggaaaacaaatactattttttctttaatttcttttgttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattat > 2:4256464‑M2/127‑128 (MQ=255)ataaaaggtagtatttgttggcgatccccctagagtcttttacatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattat < 2:1701912‑M2/2‑1 (MQ=255)ataaaaggtagtattagttggcgatccccctagagtcttttacatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattat < 1:3192860‑M2/2‑1 (MQ=255) taaaaggtagtatttgttggcgatccccctagagtcttttacatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattatt > 2:1313551‑M2/126‑128 (MQ=255) aaaaggtagtatttgttggcgatccccctagagtcttttacatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTg < 1:28526‑M2/4‑1 (MQ=255) aaaggtaggatttgttggctatccctctagagtcttttacatcttaggaaaacaaaaactaatttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGt < 1:1344950‑M2/5‑1 (MQ=255) ggtagtatttgttggcgatccccctagagtcttttacatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACa < 2:4463896‑M2/8‑1 (MQ=255) ggtagtataagttggcgatcccactagagtcttttacatattcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACa < 1:3485027‑M2/8‑1 (MQ=255) ggtagtagttgtgggcgatcccactagagtcttttacatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACa < 1:2277199‑M2/8‑1 (MQ=255) gtagtatttgttggcgatccccctagagtcttttacatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAg < 1:3707792‑M2/9‑1 (MQ=255) tagtatttgttggcgatcccactagagtcttttacatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGt < 2:3422098‑M2/10‑1 (MQ=255) gtatttgttggcgatccccctagagtcttttacatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTg > 2:1800230‑M2/117‑128 (MQ=255) gtatttgttggcgatccccctagagtcttttacatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTg > 2:3948038‑M2/117‑128 (MQ=255) gtatttgttggcgatccccctagagtcttttacatcttcggaaaacaaaaactatattttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTg > 2:3340413‑M2/117‑128 (MQ=255) gtatttgttggcgatccccctagagtcttttacatcttcggaaaacaaaaaatattttttctttaattcctttttttactatctatttttaatttatatatttatattaataaataATTTTACAgttt > 1:354606‑M2/117‑127 (MQ=255) atttgttggcgatccccctagagtcttttacatcttcggaaaacaaaaactattttttcttcaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGct > 1:408057‑M2/115‑128 (MQ=255) gttggcgatccccctagagtcttttacatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGctacta < 1:221571‑M2/18‑1 (MQ=255) gttggcgatccccctagagtcttttacatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGctacta > 2:3238113‑M2/111‑128 (MQ=255) tggcgatccccctagagtcttttacatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACtata > 1:1613069‑M2/109‑128 (MQ=255) gcgatccccctagagtcttttacatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAg > 2:3802004‑M2/107‑128 (MQ=255) cgatccccctagagtcttttacatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAgg < 1:676288‑M2/23‑1 (MQ=255) gatcaccctagagtattttacatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAggg < 1:3996542‑M2/24‑1 (MQ=255) atccccctagagtcttttacatcttcggaaaacaaaaactattttttcttcaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGga < 1:744464‑M2/25‑1 (MQ=255) tccccctagagtcttttacatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGATGCTACTATAAGGtaa > 1:3043974‑M2/103‑128 (MQ=255) ccctagagtcttttacaacttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTAAAGTTGATTCTATAAGGgaaaga > 2:2883194‑M2/100‑128 (MQ=255) ctagagtcttttacatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttttattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGgaaagaaa > 1:1134957‑M2/98‑128 (MQ=255) ctagagtcttttacatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGgaaagaaa > 1:60148‑M2/98‑128 (MQ=255) ctagagtcttttacatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGgaaagaaa > 1:4248861‑M2/98‑128 (MQ=255) ctagagtcttttacatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGgaaagaaa > 2:2402810‑M2/98‑128 (MQ=255) tagagtcttttacaacatcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaatttATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGaaaa > 2:1226573‑M2/97‑128 (MQ=255) agagtcttttacatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGaaaaa > 2:4173163‑M2/96‑128 (MQ=255) agagtcttttacatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatctttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGTGAAAGaaaaa > 2:1600553‑M2/96‑128 (MQ=255) agagtcttatacatcttaggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGaaaaa < 2:3010316‑M2/33‑1 (MQ=255) gagtcttttacatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGaaaaaa < 1:1823268‑M2/34‑1 (MQ=255) agtcttttacatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGaaaaaaa > 1:840747‑M2/94‑128 (MQ=255) tcttttacatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAaaaga < 1:1419170‑M2/37‑1 (MQ=255) cttttacatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAtaagaa > 2:860428‑M2/91‑128 (MQ=255) tacatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGat > 2:388446‑M2/87‑128 (MQ=255) acatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGTGAAAGAAAAAAAGAAAGata > 1:3933557‑M2/86‑128 (MQ=255) acatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGATAAAAAGAAAGata > 2:7654‑M2/86‑128 (MQ=255) acatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGata > 2:4110666‑M2/86‑128 (MQ=255) acatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGata < 1:1994925‑M2/43‑1 (MQ=255) acatcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGata > 2:4568204‑M2/86‑128 (MQ=255) catcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGatat > 2:2505463‑M2/85‑128 (MQ=255) catcttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGatat > 1:1049402‑M2/85‑128 (MQ=255) cttcgtaaaaaaaaaactattttttctttaatttatttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATaaa < 2:3496152‑M2/47‑1 (MQ=255) cttcggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATaaa < 2:2233623‑M2/47‑1 (MQ=255) cggaaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTg > 2:4028054‑M2/79‑128 (MQ=255) aaaacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTTATACTATAAGTGAAAGAAATAAAGAAAGATATAAATTGtat > 1:1737785‑M2/76‑128 (MQ=255) aaacaaatactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGtata < 1:3283010‑M2/54‑1 (MQ=255) aacaaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatattaatattaaaaaattATTGTACAGTTTCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTG‑ATaaa > 2:269317‑M2/74‑128 (MQ=255) aaaaactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGt > 2:3700847‑M2/71‑128 (MQ=255) aaactattttttctttaatttctttttttactttctattttaaatatagatatttatattaaaaaaatATTGTACAGTTGCAACTATAAGTGAATGAATAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAATTAg > 1:1208314‑M2/69‑128 (MQ=255) aactattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAgg < 2:2957938‑M2/61‑1 (MQ=255) actattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAggg > 2:1492772‑M2/67‑128 (MQ=255) actattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAggg < 2:1888111‑M2/62‑1 (MQ=255) ctattttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGt < 2:2600448‑M2/63‑1 (MQ=255) ttttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAg < 2:1158969‑M2/66‑1 (MQ=255) tttttctttaatttctttttttactttctatttttaatttaaatatttatattaataaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGa < 1:901235‑M2/67‑1 (MQ=255) ttctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGc < 1:4151935‑M2/70‑1 (MQ=255) ctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTTGAAGCaa > 1:2067117‑M2/57‑128 (MQ=255) ctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCaa < 1:2632576‑M2/72‑1 (MQ=255) ctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCaa > 1:3396927‑M2/57‑128 (MQ=255) ctttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCaa > 1:2707629‑M2/57‑128 (MQ=255) tttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCAAt < 1:4331408‑M2/73‑1 (MQ=255) ttaatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACTGTTGCTACTATAAGGGAATGAAAAAAATAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGTTTAGAAGAAAtt > 2:1986704‑M2/55‑128 (MQ=255) taatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCAATta < 1:51718‑M2/75‑1 (MQ=255) taatttctttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGATACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCAATta < 1:3873259‑M2/75‑1 (MQ=255) ttttttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCAATTAATAattat > 1:3118479‑M2/46‑128 (MQ=255) ttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTATGGTTAGAAGCAATTAATAattattatt > 1:1907580‑M2/42‑128 (MQ=255) ttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCAATTAATAattattatt < 1:3613077‑M2/87‑1 (MQ=255) ttactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCAATTAATAattattatt < 2:52116‑M2/87‑1 (MQ=255) atactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGTTAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCAATTAATAattattatt > 2:1381254‑M2/42‑128 (MQ=255) tactttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCAATTAATAAttattatta > 1:2331276‑M2/41‑128 (MQ=255) actttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCAATTAATAATTATTATTaa > 2:2141145‑M2/40‑128 (MQ=255) ctttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCAATTAATAATTATTATTAAt < 2:603745‑M2/90‑1 (MQ=255) ttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCAATTAATAATTATTATTAATGt < 2:205663‑M2/92‑1 (MQ=255) ttctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGAAATTAATAATTATTATTAATGt > 1:2574533‑M2/37‑128 (MQ=255) ttctatttttaattaatatatttatattaaaaaattATTGGACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGTATGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCAATTAATAATTATTATTAATGt < 1:2416506‑M2/92‑1 (MQ=255) tctatttttaatttatatatttatattaaataattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAATTTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCAATTAATAATTATTATTAATGtt < 2:362582‑M2/93‑1 (MQ=255) ctatttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGTTTAGAAGCAATTAATAATTATTATTAATGTTa > 2:906866‑M2/35‑128 (MQ=255) tttttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCAATTAATAATTATTATTAATGTTAttt > 1:277204‑M2/32‑128 (MQ=255) tttaatttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAATATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAATCAATTAATAATTATTATTAATGTTAttttt > 2:693915‑M2/30‑128 (MQ=255) ttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCTATTAATAATTATTATTAATGTTATTTTTCTCTta < 1:4484311‑M2/105‑1 (MQ=255) ttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCAATTAATAATTATTATTAATGTTATTTTTCTCTta > 2:4365865‑M2/24‑128 (MQ=255) ttatatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCAATTAATAATTATTATTAATGTTATTTTTCTCTta < 2:1061098‑M2/105‑1 (MQ=255) tatatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCAATTAATAATTATTATTAATGTTATTTTTCTCTtatat < 1:460264‑M2/108‑1 (MQ=255) atatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCAATTAATAATTATTATTAATGTTATTTTTCTCTtatata > 1:3795994‑M2/20‑128 (MQ=255) tatttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGTAAGATATATATTGTATAAAGAAGGGTTAGAAGCAATTAATAATTATTATTAATGTTATTTTTCTCTTatatat < 1:2979252‑M2/110‑1 (MQ=255) atttatattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCAATTAATAATTATTATTAATGTTATTTTTCTCTTATATAtt < 1:969923‑M2/111‑1 (MQ=255) atattaaaatattATTGGACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCAAATAATAATTATTATTAATGTTATTTTTCTCTTATATATTCAAt < 2:3161983‑M2/115‑1 (MQ=255) tattaaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCAATTAATAATTATTATTAATGTTATTTTTCTCTTATATATTCAATg < 1:1516732‑M2/116‑1 (MQ=255) taaaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCAATTAATAATTATTATTAATGTTATTTTTCTCTTATATATTCAATGTaa > 1:4418871‑M2/10‑128 (MQ=255) aaaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAATGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCAATTAATAATTATTATTAATGTTATTTTTCTCTTATATATTCAATGTAAtt < 2:3083237‑M2/121‑1 (MQ=255) aaaattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCAATTAATAATTATTATTAATGTTATTTTTCTCTTATATATTCAATGTAatta < 1:2144532‑M2/122‑2 (MQ=255) aattATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCAATTAATAATTATTATTAATGTTATTTTTCTCTTATATATTCAATGTAATTTTa < 1:2496004‑M2/124‑1 (MQ=255) ttATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCAATTAATAATTATTATTAATGTTATTTTTCTCTTATATATTCAATGTAATTTTAAt > 2:2782751‑M2/3‑128 (MQ=255) ttATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCAATTAATAATTATTATTAATGTTATTTTTCTCTTATATATTCAATGTAATTTTAAt < 1:1276819‑M2/126‑1 (MQ=255) tATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCAATTAATAATTATTATTAATGTTATTTTTCTCTTATATATTCAATGTAATTTTAAtt < 1:1000478‑M2/127‑1 (MQ=255) attGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGTGTTAGAAGCAATTAATAATTATTATTAATGTTATTTTTCTCTTATATATTCAATGTAATTTTAATTa < 2:2300381/128‑1 (MQ=255) | AGAAAACAGTGAAGCACCAGTTTCTGAACCAAAAGAAGACGAAAAAACAAAAAAAGATTAAGCAATTTATTTGGAAAATCTTTTTTTGTTTTTTTAAGAAATATTTATTGTTTTTTTTAAAAAATTATTGTACAGTTGCTACTATAAGGGAAAGAAAAAAAGAAAGATATAAATTGTATAAAGTAGGGTTAGAAGCAATTAATAATTATTATTAATGTTATTTTTCTCTTATATATTCAATGTAATTTTAATTA > CP016816/20090‑20343 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |