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| ? | CP016816 | 20216 = | 1 (0.000) | intergenic (‑937/‑200) | JCVSYN2_00065/JCVSYN2_00070 | hypothetical protein/tetracycline resistance ribosomal protection protein Tet(M) | |||||
Only 100 of 2335 total aligned reads displayed.
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AGATAAAAGGTAGTATTTGTTGGCGATCCCCCTAGAGTCTTTTACATCTTCGGAAAACAAAAACTATTTTTTCTTTAATTTCTTTTTTTACTTTCTATTTTTAATTTATAATTTTATATTAAAAAATTTAAATTATAATTATTTTTATAGCACGTGATAATTAAAAGTTAGTGAACAAGAAAACAGTGAAGCACCAGTTTCTGAACCAAAAGAAGACGAAAAAACAAAAAAAGATTAAGCAATTTATTTGGAAAA > CP016816/19913‑20167 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |