BRESEQ :: Evidence

New junction evidence
		seq id	position	reads (cov)	reads (cov)	score	skew	freq	annotation	gene	product
*	?	CP016816	496355 =	4154 (1.140)	212 (0.060)	84/232	57.0	5.4%	intergenic (‑55/+29)	JCVSYN2_02275/JCVSYN2_02280	HPr(Ser) kinase/phosphatase/ECF transporter S component
*	?	CP016816	496379 =	3670 (1.090)	212 (0.060)	84/232	57.0	5.4%	intergenic (‑79/+5)	JCVSYN2_02275/JCVSYN2_02280	HPr(Ser) kinase/phosphatase/ECF transporter S component
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff.
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold.

Only 100 of 4169 total aligned reads displayed.

CTAGTTTATCTTGTCCTGAAATAATTTCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTATTTTTTGTATTTAAATCTTTTTTAATTAAAATATAGATCACTCTTATTGAAGCATAAGT  >  CP016816/496228‑496482

cTAGTTTATCTTGTCCTGAAATAATTTCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATaaa                                                                                                                                 >  1:4456560/1‑128 (MQ=255)

 tAGTTTATCTTGTCCTGAAATAATTTCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATaaaa                                                                                                                                <  1:2617193/128‑1 (MQ=255)

   gTTTATCTTGTCCTGAAATAATTTCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATaaaaaa                                                                                                                              >  2:5080292/1‑128 (MQ=255)

   gTTTATCTTGTCCTGAAATAATTTCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATaaaaaa                                                                                                                              >  2:2590148/1‑128 (MQ=255)

   gTTTATCTTGTCCAGAAATAATTTCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATaaaaaa                                                                                                                              <  2:5248676/128‑1 (MQ=255)

    tttATCTTGTCCTGAAATAATTTCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACTTTAATATAATTTTACTATATTAATGATTAAACATaaaaaaa                                                                                                                             >  2:3113315/1‑128 (MQ=255)

     ttATCTTGTCCTGAAATAATTTCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAg                                                                                                                            >  2:3002543/1‑128 (MQ=255)

       aTCTTGTCCTGAAATAATTTCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGtg                                                                                                                          <  1:3368440/128‑1 (MQ=255)

       aTCTTGTCCTGAAATAATTTCAAATTTTAGATTATCAGTAACATCTTTTATGGTAATTTTTTCCATATCATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGtg                                                                                                                          <  1:2339205/128‑1 (MQ=255)

        tattGTACTGAAATAATTTCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGtgc                                                                                                                         <  1:7693912/126‑1 (MQ=255)

        tCTTGTCCTTAAATAATTTCAAATTATAGATTATCAGTAAGATCTTTTATTGTAAATTTTTCCATATAATCTACTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGtgc                                                                                                                         <  1:1590539/128‑1 (MQ=255)

        tCTTGTCCTGAAATAATTTCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGtgc                                                                                                                         <  1:5418483/128‑1 (MQ=255)

         cTTGTCCTGAAATAATTTCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGtgct                                                                                                                        >  1:4308763/1‑128 (MQ=255)

         cTTGTCCTGAAATAATTTCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGtgct                                                                                                                        <  2:1078723/128‑1 (MQ=255)

          ttGTCCTGAAATAATTTCAAATTTTTGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGtgcta                                                                                                                       <  2:5375312/128‑2 (MQ=255)

          ttGTCCTGAAATAATTTCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGtgctt                                                                                                                       <  2:3905813/128‑1 (MQ=255)

          ttGTCCTGAAATAATTTCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGtgctt                                                                                                                       >  2:6336480/1‑128 (MQ=255)

          ttGTCCTGAAATAATTTCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGtgatt                                                                                                                       >  1:2852446/1‑128 (MQ=255)

           tGTCCTGAAATAATTTCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGtgcttg                                                                                                                      <  1:7167636/128‑1 (MQ=255)

           tGTCCTGAAATAATTTCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGtgcttg                                                                                                                      <  1:3864602/128‑1 (MQ=255)

           tGTCCTGAAATAATTTCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGtgctag                                                                                                                      <  1:5720131/128‑3 (MQ=255)

           tGTCCTGAAATAATTTCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGtgctag                                                                                                                      <  2:857040/128‑3 (MQ=255)

             tCCTGAATTAATTTCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGtgcttgct                                                                                                                    <  1:4154854/128‑1 (MQ=255)

             tCCTGAAATAATTTCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGtgcttgct                                                                                                                    >  2:233540/1‑128 (MQ=255)

               cTGAAATAATTTCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAg                                                                                                                  <  1:6416173/128‑1 (MQ=255)

               cTGAAATAATTTCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAg                                                                                                                  <  1:187549/128‑1 (MQ=255)

                tGAAATAATTTCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGc                                                                                                                 >  1:1164909/1‑128 (MQ=255)

                tGAAATAATTTCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTACATATAATCTCCTTATAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATCTATAAACATAAAAAAAGTTCTTGATAGc                                                                                                                 >  1:5064077/1‑128 (MQ=255)

                 gAAATAATTTCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCa                                                                                                                >  1:969117/1‑128 (MQ=255)

                   aataatTTCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACt                                                                                                              <  2:6927509/128‑1 (MQ=255)

                    ataatTTCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACtt                                                                                                             <  1:7454454/128‑1 (MQ=255)

                        tttCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTa                                                                                                         >  2:1378360/1‑128 (MQ=255)

                         ttCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTAt                                                                                                        <  1:3676922/128‑1 (MQ=255)

                         ttCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTAt                                                                                                        <  2:4050946/128‑1 (MQ=255)

                           cAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCa                                                                                                      >  2:3633373/1‑128 (MQ=255)

                           cAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCa                                                                                                      >  2:5602817/1‑128 (MQ=255)

                            caaatttAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATAAAATCTCCTTTTAAACGATAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACAAAAAAAAAGTTCTTGCTAACACTTTTTATCaa                                                                                                     >  1:6576473/5‑128 (MQ=255)

                            aaaTTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCaa                                                                                                     <  1:354870/128‑1 (MQ=255)

                            aaaTTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCaa                                                                                                     >  1:6717782/1‑128 (MQ=255)

                             aaTTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAAt                                                                                                    <  1:3991759/128‑1 (MQ=255)

                             aaTTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAAt                                                                                                    >  1:2039272/1‑128 (MQ=255)

                             aaTTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAAt                                                                                                    >  1:5969094/1‑128 (MQ=255)

                              aTTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAAtt                                                                                                   >  2:4632436/1‑128 (MQ=255)

                              aTTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAAtt                                                                                                   >  2:4497682/1‑128 (MQ=255)

                                tttAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAg                                                                                                 >  2:1210541/1‑128 (MQ=255)

                                 ttAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGa                                                                                                <  1:627993/128‑1 (MQ=255)

                                     aTTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAatat                                                                                            <  2:4351316/128‑1 (MQ=255)

                                      ttATCAGTAAGATCTTTTATGGTATATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATAtt                                                                                           <  2:572484/128‑1 (MQ=255)

                                       tATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTa                                                                                          <  2:49691/128‑1 (MQ=255)

                                        aTCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTAc                                                                                         >  2:2089621/1‑128 (MQ=255)

                                        aTCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTAc                                                                                         <  2:4800321/128‑1 (MQ=255)

                                        aTCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTAc                                                                                         >  2:5471682/1‑128 (MQ=255)

                                        aTCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACAT‑AAAAAATTTCATTCTAGCACATTTTAAAAATTatcataattac                                                                                        >  1:3077746/1‑118 (MQ=255)

                                         tCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAATCATAAAAAAAGTTCTTGATAGCACTTATAATCAATAAGAATATTACa                                                                                        >  1:851945/1‑128 (MQ=255)

                                         tCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACa                                                                                        <  2:7239605/128‑1 (MQ=255)

                                           aGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGc                                                                                      >  2:6479243/1‑128 (MQ=255)

                                              aaGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGcatc                                                                                   <  2:2211260/128‑1 (MQ=255)

                                                gATATTTTATTGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGcatcat                                                                                 <  2:1649299/128‑1 (MQ=255)

                                                   cTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTTCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACATAATCATTTc                                                                              >  1:2466719/1‑128 (MQ=255)

                                                         tGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAata                                                                        <  2:3494962/128‑1 (MQ=255)

                                                         tGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAata                                                                        >  1:2736580/1‑128 (MQ=255)

                                                            tAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTc                                                                     <  2:6619395/128‑1 (MQ=255)

                                                            tAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTc                                                                     <  1:1705880/128‑1 (MQ=255)

                                                            tAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAAAGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTc                                                                     <  1:4930660/128‑1 (MQ=255)

                                                             taaTTTTTCAATTTAATCTCCTTTTAAAAGTTAATATAATTTTACTATATTATTGTTTTAACATAATAATAGTGCTTGCTAGGACTTTTTATCAATTTGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCa                                                                    <  1:1305452/127‑1 (MQ=255)

                                                                    tacATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTa                                                             <  2:1795809/126‑1 (MQ=255)

                                                                    tCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTa                                                             <  2:6013212/128‑1 (MQ=255)

                                                                      cATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTAtt                                                           <  2:1927132/128‑1 (MQ=255)

                                                                         ataATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTAttttt                                                        >  1:4745562/1‑128 (MQ=255)

                                                                         ataATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTAttttt                                                        >  2:7112335/1‑128 (MQ=255)

                                                                            aTCTCCTATTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTATTTTTTGt                                                     >  2:3755101/1‑128 (MQ=255)

                                                                               tcCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTATTTTTTGTAtt                                                  >  2:2843224/1‑128 (MQ=255)

                                                                               tcCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTATTTTTTGTAtt                                                  <  1:3224993/128‑1 (MQ=255)

                                                                               tcCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGATAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTATTTTTTGTAtt                                                  <  2:3372422/128‑1 (MQ=255)

                                                                                    ttAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAATAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTATTTTTTGTATTTAAAt                                             <  1:7844862/128‑1 (MQ=255)

                                                                                     tAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTATTTTTTGTATTTAAATc                                            >  1:6886370/1‑128 (MQ=255)

                                                                                        aCGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTATTTTTTGTATTTAAATCttt                                         <  2:2712073/128‑1 (MQ=255)

                                                                                         cGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTATTTTTTGTATTTAAAtatatt                                        >  2:7704578/1‑123 (MQ=255)

                                                                                          gttaaatttaTTTTACTATATTAATGTTTAAAAATAAAAAAATTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTATTTTTTGTATTTAAATCttttt                                       <  1:5251785/119‑1 (MQ=255)

                                                                                                ataATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTATTTTTTGTATTTAAATCtt                                          >  2:5826952/1‑119 (MQ=255)

                                                                                                  aaTTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTATTTTTTGTATTTAAATCTTTTTTAATTaaa                               <  2:7589110/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                  aaTTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTATTTTTTGTATTTAAATCTTTTTTAATTaaa                               >  1:5830998/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                  aaTTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGAATCATTTCTTAATATTCATTGTATATTTTTTGTATTTAAATCTTTTTTAATTaaa                               >  1:4609903/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                    ttttACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGTTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTATTTTTTGTATTTAAATCTTTTTTAATTAAAat                             <  2:7447902/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                         cTATATTAATGTTTTAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTGTTAATATTCATTGTCTATTTTTTGTATTTAAATCTTTTTTAATTAAAATATAGa                        <  2:4188802/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                           atatTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTATTTTTTGTATTTAAATCTTTTTTAATTAAAATATAGATc                      <  1:2974422/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                             cttAATGTTTATAGATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTATTTTTTGTATTTAAATCTTTTTTAATTAAAATATAGATCAc                    <  1:2182735/127‑1 (MQ=255)

                                                                                                             atTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTATTTTTTGTATTTAAATCTTTTTTAATTAAAATATAGATCAc                    >  1:758609/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                               tAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGACTATTTTTTGTATTTAAATCTTTTTTAATTAAAATATAGATCActc                  <  1:142940/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                   gTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGAACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGAATAATTTCTTAATATTCTTTGTCTATTTTTTGTATTTAAATCTTTTTTAATTAAAATATAGATCACTCTTAt              <  1:7294876/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                      tAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTATTTTTTGTATTTAAATCTTTATTAATTAAAATATAGATCACTCTTATTGa           >  2:7846444/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                       aaaCATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTATTTTTTGTATTTAAATCTTTTTTAATTAAAATATAGATCACTCTAATTGaa          >  1:5554441/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                         aCATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTATTTTTTGTATTTAAATCTTTTTTAATTAAAATATAGATCACTCTTATTGAAGc        <  2:2456694/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                         aCATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTATTTTTTGTATTTAAATCTTTTTTAATTAAAATATAGATCACTCTTATTGAAGc        <  2:152415/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                           aTAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTATTTTTTGTATTTAAATCTTTTTTAATTAAAATATAGATCACTCTTATTGAAGCAt      >  2:6180965/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                            tAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTATTTTTTGTATTTAAATCTTTTTTAATTAAAATATAGATCACTCTTATTGAAGCATa     >  1:6090766/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                             aaaaaaaGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTATTTTTTGTATTTAAATCTTTTTTAATTAAAatat                           >  2:6800090/1‑105 (MQ=255)

                                                                                                                             aaaaaaaGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTATTTTTTGTATTTAAATCTTTTTTAATTAAAATATAGATCACTCTTATTGAAGCATaa    <  2:3244971/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                             aaaaaaaGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGAATCATTTATTAATATTCATTGTCTATTTTTTGTATTTAAATCTTTTTTAATTAAAATATAGATCACTCTTATTGAAGCATaa    <  1:7014835/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                              aaaaaaGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTATTTTTTGTATTTAAATCTTTTTTAATTAAAATATAGATCACTCTTATTGAAGCATAAg   <  1:1000174/128‑1 (MQ=255)

CTAGTTTATCTTGTCCTGAAATAATTTCAAATTTTAGATTATCAGTAAGATCTTTTATGGTAAATTTTTCCATATAATCTCCTTTTAAACGTTAATATAATTTTACTATATTAATGTTTAAACATAAAAAAAGTGCTTGCTAGCACTTTTTATCAATTAGAATATTACAGCATCATTTCTTAATATTCATTGTCTATTTTTTGTATTTAAATCTTTTTTAATTAAAATATAGATCACTCTTATTGAAGCATAAGT  >  CP016816/496228‑496482

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 14 ≤` `ATCG/ATCG` `< 15 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 36 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.