| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | 437887 = | 1233 (0.580) | 288 (0.160) | 71/208 | 25.2 | 23.3% | intergenic (‑191/+231) | JCVSYN2_01985/JCVSYN2_01990 | glycosyl transferase/ABC transporter permease |
| ? | CP016816 | = 437880 | 881 (0.500) | intergenic (‑184/+238) | JCVSYN2_01985/JCVSYN2_01990 | glycosyl transferase/ABC transporter permease | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 851 total aligned reads displayed.
ATGTTAAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATATATATATATAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/438035‑437887‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atatatatatatatatatatatCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAGTTTC < CP016816/437880‑437754 TGTTAAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAACTTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑AT > 1:799626/1‑128 AAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATAT > 1:3567359/1‑128 AAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATAT > 2:2644280/1‑128 AAAAAATAGTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAAATACAAATTTAAGACAAACTCAGATCTAAATATCACCATTTTATGCGGCTCGCTTG‑‑C‑‑ATATtt > 1:1139625/1‑126 AAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATATAAACTACAAATTTAAGACAAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATA > 2:1834380/1‑128 AAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAATACCAACTCAGATCTAAATTTCAACATATTATGATTATAGAATG‑‑C‑‑ATATATA > 1:1726228/1‑128 AAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATA > 2:3824599/1‑128 AAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATA > 1:89718/1‑128 AAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATA > 1:2048953/1‑128 AATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATAT < 1:167968/128‑1 ATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATt > 1:707538/1‑127 ATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATA > 2:1130403/1‑128 TATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATAT > 1:369848/1‑128 ATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATATA > 1:3487451/1‑128 ATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATATA > 1:410752/1‑128 ATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATATA > 1:1386478/1‑128 ATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATATAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATATA < 1:3863273/128‑1 ATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAAATATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATATA < 2:327558/128‑1 TTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATAAAAGACCAACTCAGATCTAAATATCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATATAT < 2:525311/128‑1 TAATTTATAAAATATAAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAAAATAAGACAAACTCAGATATAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATATATA < 2:3065412/128‑1 TAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACAAACTCAGATCTAAATTTCACAATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATATATA > 1:2934544/1‑128 AAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATATATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATATAAATTTCACCATTTTATGCTGAGCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATATATAT < 2:4070506/128‑1 AGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATATATATA < 2:246832/128‑1 tataTAAAATATAAAAAATCTAAATAATAAACTTAATAAACTATAAATAAAAAATACAAAATTAACACAAACTCAGATCTAAATTTCACCAATTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATATATATAT < 2:729865/124‑1 GTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATATATATAT > 2:2259074/1‑128 GTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATATATATAT < 2:3469161/128‑1 GTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATATATATAT > 1:1071570/1‑128 GTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATATATATAT > 1:2733585/1‑128 TTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTT‑‑C‑‑ATATATATATATATATATA > 2:3534196/1‑128 TTTAAAATATTAAATATATAAAATATTAATTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATATAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATATATATATAT < 1:4199474/128‑1 TTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATATATATATAT < 1:3921322/128‑1 TTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAAATTAAGACCATCTCAGATCTAAATATCTCCATTTTATGGTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATATATATATAT < 1:1842438/128‑1 TTAAAATATTAAAAATCTAATTTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGATGATCGCTTG‑‑C‑‑TTATATATATATATATATATA > 2:2566555/1‑128 TTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATATATATATATA > 2:3366612/1‑128 TTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATATATATATATA > 1:4608647/1‑128 TTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTATATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATATCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATATATATATATA < 2:4626271/128‑1 TAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATATATATATATAT > 2:1223919/1‑128 TAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑CATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAG > 1:510183/1‑128 AAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑CATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGG < 1:1493518/128‑1 AAATAATTAACTATATAAACAATAAATAAAAACTACAAATTAAAGACACACTCAGATCTAAATATCACCAATTTATGCTGATCGCTAG‑‑CATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGG < 1:1313494/128‑1 TATTTACTTTATAAAATATATATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACAATTTTATGCTGATAGCTAG‑‑CATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAAT < 2:4539073/128‑1 TAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATATATAT > 2:1549929/1‑98 TATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑CATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATCGAGGTg > 2:3317269/1‑127 ATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATAGCTTG‑‑CATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTT < 1:2162212/128‑1 TAAACTATAAATAAAAACTACATATTATAGACCAACTCAGATCTAAATATAACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTG < 2:3700359/128‑1 ATAAATTAACACTACAAATTTAAGACCAACTCTGATCTAAAATTCACCATTTTTTGCTGATGGCTTG‑‑A‑‑ATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGC < 1:2559375/128‑1 ATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑CATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTT > 2:2117032/1‑128 ATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATATCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑CATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTT < 1:2846488/128‑1 TAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑CATATATATATATATATATATATATCAATAACTCTATAGGTAATATGGATGTTTTTTCTTTGCTTC > 1:3153912/1‑128 AAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑CATATATATATATATATATATATATCATTATCTCTATATGTAATATGGAGGTTTTTGATTTGGTTCA > 1:3222825/1‑128 AAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑CATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCA < 2:3759823/128‑1 AACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCC < 1:1963113/128‑1 AAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCAACATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑CATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAA < 2:1437998/128‑1 taTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATT < 1:3278989/126‑1 TTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑CATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGTTAATATGTAGTTTTTTGATTTGCTTCATTTCCTAAAATA > 2:646813/1‑128 AAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑CATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATTGAGTTTTTTGATTTGATTCATTTACTAAAATATTT > 1:2694072/1‑128 AAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTAT > 2:930267/1‑128 CTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑CATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAA < 1:2447644/128‑1 CTATATTTCACAATTATATGCTGATAGCTTGTAT‑‑ATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAA < 2:2392901/128‑1 TAAATTTCACCATTATCTGCTGATCGCTGG‑‑C‑‑ATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTT < 1:3339632/128‑1 TTTTATGCTGATCGCTTG‑‑CAGATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTGTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAA < 1:3105130/128‑1 TTTTATGCTGATCGATTG‑‑C‑‑ATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATA < 2:4587811/128‑1 TTTATGCTGATCGCTTG‑‑CATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAAT > 2:4349253/1‑128 CTGATCGCTTG‑‑CATATATATATATATATATATATATCATTAACTATATATGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTAT > 2:830262/1‑128 GATCGCTTG‑‑CATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTA > 1:401574/1‑128 GATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGATGTTTTTGGTTTGATTCATTTACTAAAATATTTATTTTATATATACAATTTTTATTAATAATATTTATTAAA > 1:621124/1‑128 ATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATTAAACTT > 1:212408/1‑128 ATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTT < 2:3610504/128‑1 TATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCATAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTA > 1:4283637/1‑128 ATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTAC > 2:3160260/1‑128 ATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTAC < 2:4150375/128‑1 ATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTATAATATTTATTAAAAATGAAACTTAC > 1:1569445/1‑128 ATATATATATATATATATATCATTAACTATATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTAC < 2:1771870/128‑1 TATATATATATATATATTTCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACA < 1:232950/128‑1 TATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGATGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACA < 1:3431884/128‑1 TATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACA > 2:2807344/1‑128 TATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACA < 2:3791231/128‑1 TATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAAAATTTATTAAAAATAAAACTTACA < 1:1003583/128‑1 TATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAAC > 2:1969800/1‑128 TATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATT > 2:1008243/1‑106 ATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACT < 2:4229530/128‑1 ATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTAACAACT > 2:2319263/1‑128 ATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTAATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACT > 2:1720279/1‑128 TATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTT < 2:1578025/76‑1 ATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATAC < 2:594228/84‑1 ATATATATATATATCATTAAATCTATATGTAATATGGATGTTTTTTCTTTGCTTCATTTCATAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTAC < 2:138114/128‑1 TATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGATGTGCTTCATTTCCTAATATATTTATTTTAAAAATACATTTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACA > 2:3231984/1‑128 ATATATATATATCATTAACTCTATAGGTATTATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAA < 2:4018250/128‑1 ATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAA < 2:218473/128‑1 TATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAA < 1:3764811/128‑1 agATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGATTTAGATTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAAT < 2:2075693/126‑1 ATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAAT < 1:4401303/128‑1 ATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAAT < 1:301574/128‑1 ATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAA < 1:4466327/128‑1 ATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAA > 2:2972896/1‑128 TATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAG < 2:1071570/128‑1 ATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAGT < 1:2212591/128‑1 ATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAGTTT < 1:4530817/128‑1 TCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAGTTTC < 2:4452908/128‑1 TCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAGTTTC < 2:1285017/128‑1 ATGTTAAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTG‑‑C‑‑ATATATATATATATATATATAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/438035‑437887‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atatatatatatatatatatatCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAGTTTC < CP016816/437880‑437754 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |