| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913_3_KO_pgi | 2,977,050 | Δ46 bp | coding (452‑497/1032 nt) | galR → | galactose‑inducible d‑galactose regulon transcriptional repressor; autorepressor |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913_3_KO_pgi | 2977050 | 2977095 | 46 | 75 [2] | [0] 73 | galR | galactose‑inducible d‑galactose regulon transcriptional repressor; autorepressor |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_KO_pgi | = 2977049 | 2 (0.020) | 67 (0.820) | 52/262 | 0.9 | 98.6% | coding (451/1032 nt) | galR | galactose‑inducible d‑galactose regulon transcriptional repressor; autorepressor |
| ? | NC_000913_3_KO_pgi | 2977096 = | 0 (0.000) | coding (498/1032 nt) | galR | galactose‑inducible d‑galactose regulon transcriptional repressor; autorepressor | |||||
ACAAAAAGAGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTAC > NC_000913_3_KO_pgi/2976901‑2977195 | aCAAAAAGAGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTg > 2:817685‑M1/1‑149 (MQ=255)aCAAAAAGAGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTg > 2:286458‑M1/1‑149 (MQ=255)aCAAAAAGAGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATCCTGACTTCGCCTCATTAATGAACCAAATGCCCGGTATGGTGCCGTTCAACCGTATCCTGCCTCGCTg > 4:9940‑M1/1‑149 (MQ=255) aaaaaGAGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAAGGCTCGGTATGGTGCTGATCAACCGTAGCCTACATGGCAggc > 4:472615‑M1/1‑147 (MQ=255) gagCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgc < 2:852296‑M1/150‑9 (MQ=255) gTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtca < 2:182231‑M1/150‑13 (MQ=255) tCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcat > 2:876599‑M1/1‑137 (MQ=255) cAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatt > 1:519716‑M1/1‑136 (MQ=255) aGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcattt > 1:606825‑M1/1‑135 (MQ=255) ggCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcattta < 2:235426‑M1/150‑17 (MQ=255) gCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAAACGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaa > 4:153544‑M1/1‑133 (MQ=255) ttGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattca < 1:124993‑M1/150‑22 (MQ=255) gCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaa > 1:515524‑M1/1‑125 (MQ=255) aaCTGATCCGCCATCGCTGTTCTGCGTTGGTCGACCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttacttcagcaagg < 4:590728‑M1/150‑28 (MQ=255) aaCTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaagg < 1:733555‑M1/150‑28 (MQ=255) cTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGGTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGGATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtc < 2:247631‑M1/150‑30 (MQ=255) ccATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgc < 2:668560‑M1/150‑38 (MQ=255) cATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgca > 2:657934‑M1/1‑112 (MQ=255) aTCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGtt > 2:788631/1‑123 (MQ=255) aTCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGtt < 1:788631/123‑1 (MQ=255) ggcTGTGTTGCGTTGCTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTTATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggaaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattg < 2:303884‑M1/149‑42 (MQ=255) cGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattg < 1:408637‑M1/150‑42 (MQ=255) cGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCCGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattg < 2:417177‑M1/150‑42 (MQ=255) tgtgCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggtt > 4:461571‑M1/1‑106 (MQ=255) tgctgcGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGACCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTACCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttat < 4:501116‑M1/150‑47 (MQ=255) gctgcGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCTTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTGTCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttatc < 4:468166‑M1/150‑48 (MQ=255) cGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttatctgtg < 1:817685‑M1/150‑52 (MQ=255) cGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttatctgtg < 1:286458‑M1/150‑52 (MQ=255) ttGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttatctgtgct < 1:277164‑M1/150‑54 (MQ=255) ttGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcag > 4:204157‑M1/1‑97 (MQ=255) ttGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcag < 3:204157‑M1/119‑23 (MQ=255) gtcgtcCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttatctgtgctcta > 1:362687‑M1/1‑94 (MQ=255) tcgtcCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttatctgtgctctaa > 3:252131‑M1/1‑93 (MQ=255) tcgtcCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttatctgtgctctaa > 3:174507‑M1/1‑93 (MQ=255) cgtcCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAAGGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttatctgtgctctaac < 3:376112‑M1/150‑59 (MQ=255) tcCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCGCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatgtaattcagcaaggtcatacccgcattggttatctgtgctctaacca > 4:348496‑M1/1‑90 (MQ=255) tcCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttatctgtgctctaacca > 3:537174‑M1/1‑90 (MQ=255) ccATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttatctgtgctctaaccac > 2:27161‑M1/1‑89 (MQ=255) ccATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttatctgtgctctaaccac > 4:408462‑M1/1‑89 (MQ=255) cATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttatctgtgctctaaccact > 1:588720‑M1/1‑88 (MQ=255) aTGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttatctgtgctctaaccactc < 4:424928‑M1/150‑64 (MQ=255) aaaaTGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttatctgtgctctaaccactctattt > 1:393868‑M1/1‑82 (MQ=255) aaaaTGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttatctgtgctctaaccactctattt > 1:722076‑M1/1‑82 (MQ=255) aaaaTGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttatctgtgctctaaccactctattt < 3:579947‑M1/150‑69 (MQ=255) aaaaTGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttatctgtgctctaaccactctattt < 4:415806‑M1/150‑69 (MQ=255) 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aTTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttatctgtgctctaaccactctatttctgacgccgaagatcgtct > 2:918064‑M1/1‑63 (MQ=255) cATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcgtacccgcattggttatctgtgctctaaccactctatttctgacgccgaagatcgtctgcaagggta > 4:249321‑M1/1‑54 (MQ=255) ttAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttatctgtgctctaaccactctatttctgacgccgaagatcgtctgcaagggtatt > 3:440368‑M1/1‑52 (MQ=255) tGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttatctgtgctctaaccactctatttctgacgccgaagatcgtctgcaagggtattacga < 2:606825‑M1/150‑103 (MQ=255) gAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttatctgtgctctaaccactctatttctgacgccgaagatcgtctgcaagggtattacgat < 2:588720‑M1/150‑104 (MQ=255) aaaCAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttatctgtgctctaaccactctatttctgacgccgaagatcgtctgcaagggtattacgatg > 1:25860‑M1/1‑46 (MQ=255) aaaCAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttatctgtgctctaaccactctatttctgacgccgaagatcgtctgcaagggtattacgatg > 2:197117‑M1/1‑46 (MQ=255) aaCAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttatctgtgctctaaccactctatttctgacgccgaagaccgtctgcaagggtattacgatgc > 3:492319‑M1/1‑45 (MQ=255) ccGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttatctgtgctctaaccactctatttctgacgccgaagatcgtctgcaagggtattacgatgcccttgctga > 2:640257‑M1/1‑36 (MQ=255) ccGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttatctgtgctctaaccactctatttctgacgccgaagatcgtctgcaagggtattacgatgcccttgctga < 2:505792‑M1/150‑115 (MQ=255) 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ctggctggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttatctgtgctctaaccactctatttctgacgccgaagatcgtctgcaagggtattacgatgcccttgctgaaagtggtattgcggccaatgaccggctggt < 1:372587‑M1/150‑145 (MQ=255) ggctggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttatctgtgctctaaccactctatttctgacgctgaagatcgtctgcaagggtattacgatgcccttgctgaaagtggtattgcggccaatgaccggctggtga < 1:561291‑M1/150‑147 (MQ=255) tggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttatctgtgctctaaccactctatttctgacgccgaagatcgtctgcaagggtattacgatgcccttgctgaaagtggtattgcggc < 1:655500‑M1/130‑130 (MQ=255) tggcaacgcgtcatttaattcagcaaggtcatacccgcattggttatctgtgctctaaccactctatttctgacgccgaagatcgtctgcaagggtattacgatgcccttgctgaaagtggtattgcggc > 2:655500‑M1/1‑1 (MQ=255) | ACAAAAAGAGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTAC > NC_000913_3_KO_pgi/2976901‑2977195 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |