BRESEQ :: Evidence

New junction evidence
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Only 100 of 4527 total aligned reads displayed.

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     gCTTTCTAATGGGGGATTAAATGAAAACAATACTAACTTTACTATGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAACTAATTTAAATGTAATTGGGTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑aat                                                                                                                              >  1:1506741/1‑128 (MQ=255)

       tttCTAATGGGGGATTAAATGAAAAAAATACTAACTTTACTATGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAACTAATTTAAATGTAATTGGGTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑aataa                                                                                                                            >  1:9148826/1‑128 (MQ=255)

       tttCTAATGGGGGATTAAATGAAAAAAATACTAACTTTACTATGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAACTAATTTAAATGTAATTGGGTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑aataa                                                                                                                            >  2:3844527/1‑128 (MQ=255)

         tCTAATGGGGGATTAAATGAAAAAAATACTAACTTTACTATGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAACTAATTTAAATGTAATTGGGTGCGGATCTAAACCAAATTCTAAAGTG‑‑‑aataaga                                                                                                                          >  2:8961924/1‑126 (MQ=255)

          cTAATGGGGGATTAAATGAAAAAAATACTAACTTTACTATGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAACTAATTTAAATGTAATTGGGTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑aataataa                                                                                                                         >  2:7274063/1‑128 (MQ=255)

          cTAATGGGGGATTAAATGAAAAAAATACTAACTTTACTATGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAACTAATTTAAATGTAATTGGGTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑aataataa                                                                                                                         >  1:169724/1‑128 (MQ=255)

           tAATGGGGGATTAAATGAAAAAAATACTAACTTTACTATGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAACTAATTTAAATGTAATTGGGTGCGGAAATAAACCAGATTCTAAATTG‑‑‑aataataat                                                                                                                        >  1:7528292/1‑128 (MQ=255)

           tAATGGGGGATTAAATGAAAAAAATACTAACTTTACTATGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAACTAATTTAAATGTAATTGGGTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑aataataat                                                                                                                        >  2:5649944/1‑128 (MQ=255)

            aaTGGGTGATTAAATGAAAAAAATACTAACTTTACTATGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAACTAATTTAAATGTAATTGGGTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑aataataata                                                                                                                       <  1:9017240/128‑1 (MQ=255)

            aaTGGGGGATTAAATGAAAAAAATACTAACTTTACTATGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAACTAATTTAAATGTAATTGGGTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑aataataata                                                                                                                       <  1:9294273/128‑1 (MQ=255)

            aaTGGGGGATTAAATGAAAAAAATACTAACTTTACTATGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAACTAATTTAAATGTAATTGGGTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑aataataata                                                                                                                       <  1:8849263/128‑1 (MQ=255)

                 gggATTAAATGAAAAAAATACTAACTTTACTATGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAACTAATTTAAATGTAATTGGGTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑aataataataataat                                                                                                                  <  2:4631864/128‑1 (MQ=255)

                 gggAGTAAATGAAAAAAATACTAACTTTACTATGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAAGAGGTTTAACTAATTTAAATGTAATTGGGTTCGGAAATAAACCAAAGTCTAAATTG‑‑‑aataataataataat                                                                                                                  >  1:5542752/1‑128 (MQ=255)

                  ggATTAAATGAAAAAAATACTAACTTTACTATGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAACTAATTTAAATGTAATTGGGTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑aataataataataata                                                                                                                 <  1:6700564/128‑1 (MQ=255)

                       aaaTGAAAAAAATACTAACTTTACTATGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAACTAATTTAAATGTAATTGGGTGCGGATATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑aataataataataataataat                                                                                                            >  1:1204621/1‑128 (MQ=255)

                       aaaTGAAAAAAATACTAACTTTACTATGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAACTAATTTAAATGTAATTGGGTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑aataataataataataataat                                                                                                            >  1:2167368/1‑128 (MQ=255)

                           gAAAAAAATACTAACTTTACTATGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAACTAATTTAAATGTAATTGGGTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGa                                                                                                        >  1:3753542/1‑128 (MQ=255)

                             aaaaaaTACTAACTTTACTATGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAACTAATTTAAATGTAATTGGGTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAat                                                                                                      <  2:6178123/128‑1 (MQ=255)

                              aaaaaTACTAACTTTACTATGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAACTAATTTAAATGTAATTGGGTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑aataataataataataat                                                                                                               >  2:9330199/1‑118 (MQ=255)

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                              aaaaaTACTAACTTTACTATGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAACTAATTTAAATGTAATTGGGTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAatg                                                                                                     <  2:2717173/128‑1 (MQ=255)

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                                            tACTATGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAACTAATTTAAATGTAATTGGGTGCTTAAATAAACCAAATTCTAAAATG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGAATATGaatat                                                                                       >  2:6314145/1‑124 (MQ=255)

                                            tACTATGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAACTAATTTAAATGTAATTGGGTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGAtttt                                                                                       >  1:6057265/1‑128 (MQ=255)

                                               tATGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAACTAATTTAAATGTAATTGGGTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGaa                                                                                    <  1:5718721/128‑1 (MQ=255)

                                                aTGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAACTAATTTAAATGTAATTGGGTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGaaa                                                                                   <  1:8284202/128‑1 (MQ=255)

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                                                               aataggtttaataggtttaaCTAATTTAAATGTAATTGGGTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑‑‑‑AATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACa                                                                 >  2:7621988/1‑128 (MQ=255)

                                                                  aggtttaataggtttaaCTAATTTAAATGTAATTGGGTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACa                                                                 >  2:645786/1‑128 (MQ=255)

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                                                                     tttaataggtttaaCTAATTTAAATGTAATTGGGTGCGGAAATAAAACAAATTCTAAATTG‑‑‑‑‑‑AATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAATTCTAATAAAAAAAATAGTg                                                           >  1:6866214/1‑128 (MQ=255)

                                                                      ttaataggtttaaCTAATTTAAATGTAATTGGGTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATTATTTAGTAATAAAAACTaaaaaaaaaattaa                                                             >  2:7479504/1‑122 (MQ=255)

                                                                        aataggtttaaCTAATTTAAATGTAATTTGGTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTg                                                           <  1:6410620/128‑1 (MQ=255)

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                                                                                           taTGTAATTGGGTGCTGAAATAAACCAAATTCTAAATAG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAAGACACTAAAACaaa                                        <  1:1327835/127‑1 (MQ=255)

                                                                                           aaTGTAATTGGGTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAAGACACTAAAACaaa                                        <  1:237147/128‑1 (MQ=255)

                                                                                           aaTGTAATTGGGTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAAGACACTAAAACaaa                                        >  2:7778839/1‑128 (MQ=255)

                                                                                           aaTGTAATTGGGTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAAGACACTAAAACaaa                                        <  2:6638686/128‑1 (MQ=255)

                                                                                            aTGTAATTGGGTGCGGAAAGAACCCAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAAGACACTAAAACAAAg                                       >  1:6228303/1‑128 (MQ=255)

                                                                                               tAATTGTGTGCGGAAATAATACAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAAGACACTAAAACAAAGCCt                                    <  2:5367012/128‑1 (MQ=255)

                                                                                               tAATTGGGTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAAGACACTAAAACAAAGCCt                                    <  2:866190/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                aaattggTTCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAAGACACTAAAACAAAGCCTa                                   <  2:1660601/123‑1 (MQ=255)

                                                                                                 aTTTGGTGCTGAAATAAAACAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACATTAGTGAAAAAGACACTAAACCAAAGCCTaa                                  <  1:4470218/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                  ttGGGTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAAGACACTAAAACAAAGCCTaaa                                 >  1:4668816/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                  ttGGGTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAAGACACTAAAACAAAGCCTaaa                                 <  2:5513029/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                     ggTGCGTATATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAAGACACTAAAACAAAGCCTAAaaca                              <  1:4870603/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                     ggTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAAGACACTAAAACAAAGCCTAAaaca                              <  2:4859040/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                      gagCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAAGACACTAAAACAAAGCCTAAaacaa                             <  2:9497486/126‑1 (MQ=255)

                                                                                                      gTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAAGACACTAAAACAAAGCCTAAaacaa                             >  1:977650/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                      gTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAAGACACTAAAACAAAGCCTAAaacaa                             >  2:1800084/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                       tgaggAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAAGACACTAAAACAAAGCCTAAaacaac                            <  1:1000815/125‑1 (MQ=255)

                                                                                                       tGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAAGACACTAAAACAAAGCCTAAaacaac                            <  1:4286953/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                             aaTAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAATACACTAAATCAAAGCCTAAAACAACATCTaa                      >  2:4127926/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                              aTAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATTATGACTATGATTTTTAAATAAAATCTAATAAAAAAAATAGTGAAAAATACACTAAAACAAATCATAAAACAACTACTaaa                     >  1:7178892/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                              aTAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAAGACACTAAAACAAAGCCTAAAACAACTTCTaaa                     <  2:2529067/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                aaaCCAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAAGACACTAAAACAAAGCCTAAAACAACTTCTAAAat                   <  2:8516812/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                aaaCCAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAAGACACTAAAACAAAGCCTAAAACAACTTCTAAAat                   <  1:8137467/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                    cAAATTCTAAATTGAATAATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAAGACACTAAAACAAAGCCTAAAACAACTTCTAAAata                  >  1:847117/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                       aatCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAAGACACTAAAACAAAGCCTAAAACAACTTCTAAAATATtaata            <  1:4113967/126‑1 (MQ=255)

                                                                                                                        ttCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAAGACACTAAAACAAAGCCTAAAACAACTTCTAAAATATtaataa           <  1:658894/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                         tCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAACCAATAGTGAAAAAGACACTAAAACAAAGCCTAACTCAACTTCTAAAATATTAATaaa          >  2:5989250/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                         tCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAAGACACTAAAACAAAGCCTAAAACAACTTCTAAAATATTAATaaa          >  2:50171/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                         tCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAAGACACTAAAACAAAGCCTAAAACAACTTCTAAAATATTAATaaa          >  2:2875582/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                          cTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAAGACTCTATAACAAAGACTAAAACAACTTCTATAATATTAATaaaa         >  2:2148833/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                           tAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAAAAAAATCTAATAAAAACAATAGTCAAAAAGACACTACAACAACGCCTAACACAACTTCTAAAATATTAATAAAAc        >  1:298224/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                               ttG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAAGACACTAAAACAAAGCCTAAAACAACTTCTAAAAAATAAATAAAACCAGa    >  2:5190141/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                                tG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAAGACACTAAAACAAAGCCTAAAACAACTTCTAAAATATTAATAAAACCAGaa   >  2:1499636/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                                 g‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAAGACACTAAAACAAAGCCTAAAACAACTTCTAAAATATTAATAAAACCAGaaa  <  2:1193754/128‑1 (MQ=255)

TAATCGCTTTCTAATGGGGGATTAAATGAAAAAAATACTAACTTTACTATGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAATAGGTTTAACTAATTTAAATGTAATTGGGTGCGGAAATAAACCAAATTCTAAATTG‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAAGAATGATGACTATGATTTTGAAATAAAATCTAATAAAAACAATAGTGAAAAAGACACTAAAACAAAGCCTAAAACAACTTCTAAAATATTAATAAAACCAGAAA  >  CP016816/370346‑370602

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 14 ≤` `ATCG/ATCG` `< 15 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 36 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.