| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP016816 | 370479 = | 4551 (1.020) | 145 (0.040) | 93/212 | 18.3 | 3.7% | coding (109/309 nt) | JCVSYN2_01610 | hypothetical protein |
| ? | CP016816 | = 370475 | 3784 (1.010) | coding (105/309 nt) | JCVSYN2_01610 | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1328 total aligned reads displayed.
TTTGACATCCAATTTAGGTTTTATTTCTGGTTTTATTAATATTTTAGAAGTTGTTTTAGGCTTTGTTTTAGTGTCTTTTTCACTATTGTTTTTATTAGATTTTATTTCAAAATCATAGTCATCATTCTTATTATTATTATTATTATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/370625‑370479‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttattattattattattattCAATTTAGAATTTGGTTTATTTCCGCACCCAATTACATTTAAATTAGTTAAACCTATTAAACCTATTAAACCTATTAAACATAGTAAAGTTAGTATTTTTTTCATTTAATCCCCCATTAGAAAGCGA < CP016816/370475‑370349 taTGACATCCAATTTAGGTTTTATTTCAGGTTGTATTACTATTTTAGAAGTTGTTTTAGGCTTTGTTTTAGTGGCTTTTTCACTTTTGTTTTTATTAGATTTTATTTCAAAATCATAGTCATCATTCT < 2:4622751/126‑1TTTGACATCCAATTTAGGTTTTATTTCTGGTTTTATTAATATTTTAGAAGTTGTTTTAGGCTTTGTTTTAGTGTCTTTTTCACTATTGTTTTTATTAGATTTTATTTCAAAATCATATTCATCATTCT > 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |