| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| MC JC | NC_000913 | 4,188,484 | Δ27 bp | coding (3136‑3162/4224 nt) | rpoC → | RNA polymerase, beta prime subunit |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| * | * | ÷ | NC_000913 | 4188484 | 4188510 | 27 | 91 [0] | [0] 90 | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 4188483 | 0 (0.000) | 87 (0.950) | 68/286 | 0.3 | 100% | coding (3135/4224 nt) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| ? | NC_000913 | 4188511 = | 0 (0.000) | coding (3163/4224 nt) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit | |||||
AGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTA > NC_000913/4188363‑4188658 | agtaccttacggtgcggtactggcgaaaggcgatggcgaacaggttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccg < 2:465689‑M2/1‑1 (MQ=255) cttacggtgcggtactggcgaaaggcgatggcgaacaggttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagacgGgtctg > 2:1334378‑M2/144‑149 (MQ=255) ttacggtgcggtactggcgaaaggcgatggcgaacaggttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGgtctgt > 2:890404‑M2/143‑149 (MQ=255) cggtgcggtactggcgaagggcgatggcgaacaggttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgacgtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCtt < 2:902850‑M2/10‑1 (MQ=255) cggtgcggtactggcgaaaggcgatggcgaacaggttggtgggggcgaaaccgttgcaagctgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaaggaagagggttggtacgctttactgacatgatcgacggcccgaccggtctgtctg > 2:1425074‑M2/140‑148 (MQ=255) cggtgcggtactggcgaaaggcgatggcgaacaggttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaaggaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCtt < 1:451642‑M2/10‑1 (MQ=255) ggtgcggtactggcgaaaggcgatggcgaacaggttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTc > 1:827662‑M2/139‑149 (MQ=255) ggtgcggtactggcgaaaggcgatggcgaacaggttgcgggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTc < 1:1239206‑M2/11‑1 (MQ=255) 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acatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAgcg > 1:1478270‑M2/21‑149 (MQ=255) acatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCGGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCCTTGGTGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAgcg > 2:1029435‑M2/21‑149 (MQ=255) atgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGGGCa > 1:820334‑M2/19‑149 (MQ=255) agatcgacggccagaccGGTCAGTCTTCGCTGGTGGTGCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAACAATATGCGTACAGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTACTGATCCCAGGCACCGATATGCCAGCGCAg > 2:942160‑M2/18‑149 (MQ=255) ccggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGAGTCCGCAGCACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTc < 2:515725‑M2/138‑1 (MQ=255) acggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGCTATGCCAGCGCAGTACTTc > 2:679855‑M2/12‑149 (MQ=255) cggccagaccGGTCGGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTcc < 1:571134‑M2/139‑1 (MQ=255) ggccagtccGGTCTGTGCTCGGTGGAGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGGAGGTGGTAAAGGTCTGAGTACGGCCTTGAAAATCGGTGATGGTCAGGGTAACGCCGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCt < 2:49965‑M2/140‑1 (MQ=255) cagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGcc > 2:1320054‑M2/7‑149 (MQ=255) gaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCgg < 2:399802‑M2/145‑1 (MQ=255) gaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCgg < 2:900733‑M2/145‑1 (MQ=255) cGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGccgggca > 1:535418‑M2/2‑147 (MQ=255) | AGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTA > NC_000913/4188363‑4188658 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |