Predicted mutation | ||||||
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MC JC | NC_000913 | 4,188,484 | Δ27 bp | coding (3136‑3162/4224 nt) | rpoC → | RNA polymerase, beta prime subunit |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | 4188511 = | 0 (0.000) | coding (3163/4224 nt) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
AAGTACCTTACGGTGCGGTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATA > NC_000913/4188335‑4188631 | aaGTACCTTACGGTGCGGTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACC > 2:71530‑M1/1‑149 (MQ=255) aGTACCTTACGGTGCGGTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCg < 2:465689‑M1/149‑2 (MQ=255) cTTACGGTGCGGTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACGggtctg > 2:1334378‑M1/1‑143 (MQ=255) 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ccgGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggagtccgcagcacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttctgatcccaggtaccgatatgccagcgcagtacttc < 2:515725‑M1/148‑139 (MQ=255) aCGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttctgatcccaggtaccgctatgccagcgcagtacttc > 2:679855‑M1/1‑11 (MQ=255) cGGCCAGACCggtcggtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttctgatcccaggtaccgatatgccagcgcagtacttcc < 1:571134‑M1/149‑140 (MQ=255) ggCCAGTCCggtctgtgctcggtggaggttctggattccgcagaacgtaccggaggtggtaaaggtctgagtacggccttgaaaatcggtgatggtcagggtaacgccgttctgatcccaggtaccgatatgccagcgcagtacttcct < 2:49965‑M1/149‑141 (MQ=255) cAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttctgatcccaggtaccgatatgccagcgcagtacttcctgcc > 2:1320054‑M1/1‑6 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |