| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,299,499 | Δ1,199 bp | intergenic (+254/‑485) | ychE → / → oppA | UPF0056 family inner membrane protein/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1299499–1300697 | 1300697 | 1–1199 | 117 [0] | [0] 119 | ychE/oppA | UPF0056 family inner membrane protein/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1299498 | 0 (0.000) | 110 (1.530) | 76/274 | 0.0 | 100% | intergenic (+253/‑1684) | ychE/oppA | UPF0056 family inner membrane protein/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein |
| ? | NC_000913 | 1300698 = | 0 (0.000) | intergenic (+1453/‑484) | ychE/oppA | UPF0056 family inner membrane protein/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
ATAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACGGT > NC_000913/1300557‑1300840 | attacagttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaat < 1:540052‑M2/2‑1 (MQ=255) ttacagttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaata < 2:860245‑M2/3‑1 (MQ=255) cagttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataata < 2:746660‑M2/6‑1 (MQ=255) agttagttataaggatttccttaactgcttctcctccccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataa < 2:145065‑M2/7‑1 (MQ=255) agttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccatatcattatcctgggattgctgaagaataattgaaatgatattatttattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataa < 1:326721‑M2/7‑1 (MQ=255) agttagttataaggatttccttaactgctagtcctgaccatcatgttatttttgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataa < 1:315087‑M2/7‑1 (MQ=255) taaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgacgaataattgaaatgatattattaattccactgccttttgtagatgaaagtgctacATACTTATCAATTGtt > 2:630293‑M2/128‑143 (MQ=255) taaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtataggaaagtgctaaATAATAATCAATTGtt > 1:1039819‑M2/128‑143 (MQ=255) aaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTa > 2:269983‑M2/127‑143 (MQ=255) aggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATtgttta < 2:479359‑M2/18‑3 (MQ=255) gtctttccttaactgcttctcctcaccatcatgttactttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaaa < 1:1293388‑M2/19‑1 (MQ=255) attgcttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAatta > 2:944014‑M2/122‑143 (MQ=255) ttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattat > 2:1175093‑M2/121‑143 (MQ=255) ttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattat > 2:905979‑M2/121‑143 (MQ=255) ttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAAACAATGGTTAAattat > 2:170672‑M2/121‑143 (MQ=255) tccttaactgttgctcctcaccatcatgttattttcgccacatcatactcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattatt < 1:1172997‑M2/24‑1 (MQ=255) tccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattatt < 1:1222031‑M2/24‑1 (MQ=255) tccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattatt < 2:359269‑M2/24‑1 (MQ=255) tcctgaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatccttggcttgctgaagtataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattatt < 1:617640‑M2/24‑1 (MQ=255) cttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgacgaatacttgaaatgatattattaattccactccctttgatagagaaaagtgctaaATAATAATAAATTGTTAAATTATtgt > 2:1251303‑M2/118‑143 (MQ=255) ttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgtg < 2:396660‑M2/27‑1 (MQ=255) ttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgtg > 2:556868‑M2/117‑143 (MQ=255) taactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGc < 1:707326‑M2/28‑1 (MQ=255) atggcttctcctccccatcatgttatttccgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattatttattccactggctttggtagaggaaagtgctaaTTAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAt < 2:951549‑M2/30‑1 (MQ=255) tgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAttt < 2:835739‑M2/32‑1 (MQ=255) tgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAttt > 1:451006‑M2/112‑143 (MQ=255) cttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattacactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCa > 1:1120615‑M2/110‑143 (MQ=255) cctctcctcaccttcattttattttcgccacatcataatccttggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCa < 1:514279‑M2/34‑1 (MQ=255) ttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCac > 2:1098635‑M2/109‑143 (MQ=255) cctctccgtcatgttattttcgtcacatcataaccctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccaatgactttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCactact < 1:773961‑M2/39‑1 (MQ=255) cctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCactact > 1:485001‑M2/105‑143 (MQ=255) ctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagagggaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTg > 2:1081066‑M2/104‑143 (MQ=255) tcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTTTTGTGCATTTCACTTCTgg > 2:197854‑M2/103‑143 (MQ=255) accatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGaa < 1:928153‑M2/43‑1 (MQ=255) cgtcaggttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACt < 2:76539‑M2/45‑1 (MQ=255) catcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACt > 2:579623‑M2/99‑143 (MQ=255) catcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACt < 2:711046‑M2/45‑1 (MQ=255) atcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagcataattgaaatgctattattaattccactgcctttggtagaggacagtgctacATAATAATCAATTGTTACATTATTGTGCATTTCTCTCCTGGgaccg > 2:331451‑M2/98‑141 (MQ=255) tcatgttattttcgcaatatcagaatcctgggcttgctgcagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttgatagaggaaagtgctaaTTAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGt < 1:1169748‑M2/47‑1 (MQ=255) tgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAt > 2:25606‑M2/94‑143 (MQ=255) tgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgactgtggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATCATTGTGCATTACACTACTGGAACTGTAAt > 1:622976‑M2/94‑143 (MQ=255) gttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATc < 1:1178336‑M2/51‑1 (MQ=255) ccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggacagtgctaaCTAATAATCAATTGTTAATTTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑a > 2:130853‑M2/83‑143 (MQ=255) ccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑a > 2:818359‑M2/83‑143 (MQ=255) catcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGAc > 2:1198352‑M2/80‑143 (MQ=255) catcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGAc < 1:954028‑M2/64‑1 (MQ=255) atcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattcccctgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTAGAACTGTAATCAGAAACGAT‑AGACa > 1:862258‑M2/79‑143 (MQ=255) atattccttggcttgttgaagaataattgaaatgatattagtgattccactgctttttgtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAGTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGc < 1:704269‑M2/68‑1 (MQ=255) aatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCtt > 2:1059802‑M2/74‑143 (MQ=255) atcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTa < 1:1010038‑M2/71‑1 (MQ=255) accctgtgcttgctgaatactaaatgaaatgatattatcaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATTATAATCAATTGTTAACTTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTa < 1:237663‑M2/71‑1 (MQ=255) tcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagagctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACAACTGGAACAGTAATCAGTAAAGAT‑AGACACTCTTAg > 1:606277‑M2/72‑143 (MQ=255) tgggcttgctgaataataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCa < 1:63188‑M2/75‑1 (MQ=255) gcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAAtc > 1:1212905‑M2/66‑143 (MQ=255) cttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAAtct < 1:1243727‑M2/79‑1 (MQ=255) gctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAACTTATTGTGCATTTCACTACTGGCACTGTAATCAGAAAAGAT‑AAACATGCTTAGCCAATCTCTa > 2:632496‑M2/62‑143 (MQ=255) tgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTAtt < 2:675137‑M2/84‑1 (MQ=255) tgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTAtt > 2:655978‑M2/60‑143 (MQ=255) tgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGAAATGCTTAGCCAATCTCTCtt > 1:650148‑M2/60‑143 (MQ=255) aagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGCATTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATttg > 2:287893‑M2/58‑143 (MQ=255) aagaataattgaaatgatattattaattccactgcctgtggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATAGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAG‑AGACATGCGTAGCCAGTCTCTAtgtg > 2:254982‑M2/58‑143 (MQ=255) agaataattgaaattatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATttga < 1:341649‑M2/87‑1 (MQ=255) agaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATttga < 1:1041763‑M2/87‑1 (MQ=255) gtgtctgtcaaaagagattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATttgat < 1:1175093‑M2/88‑1 (MQ=255) attgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGattgaat > 2:850441‑M2/51‑143 (MQ=255) aatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCAATTTGATTGAATTGaaa > 2:92662‑M2/46‑143 (MQ=255) attattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTACTCCGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATATCTCTTTAATTGAATTGAAAGAggtt > 1:527225‑M2/40‑143 (MQ=255) ttattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGAtgttt < 2:634454‑M2/105‑1 (MQ=255) ttattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGAtgttt < 2:1087802‑M2/105‑1 (MQ=255) ttattaatcccactgcctgtgggagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGAtgttt < 2:26063‑M2/105‑1 (MQ=255) gtattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGAtgttt < 1:1292382‑M2/105‑1 (MQ=255) attaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGAtgtttgt < 1:1198352‑M2/107‑1 (MQ=255) ttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑CGCCATGCTTAGCCAATATCTCTTTGATTGAATTGAAAGAtgtttgtt < 2:953851‑M2/108‑1 (MQ=255) ttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGAtgtttgtt > 2:516023‑M2/36‑143 (MQ=255) aattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTaa < 2:323120‑M2/110‑1 (MQ=255) aatgccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAAGAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTaa < 1:167411‑M2/110‑1 (MQ=255) attccactgctgttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAg < 1:943976‑M2/111‑1 (MQ=255) ccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGGATTGACAGATGTTCGTTACGGCa > 1:1200702‑M2/30‑143 (MQ=255) cttttttgtttgtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCAt < 1:1106815‑M2/115‑1 (MQ=255) cactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCAt < 2:794023‑M2/115‑1 (MQ=255) cactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGACAt > 1:1096553‑M2/29‑143 (MQ=255) cactgcccttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCAt < 2:1064002‑M2/115‑1 (MQ=255) tgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGa > 2:173103‑M2/26‑143 (MQ=255) tgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACACGCTTAGCCAACCACTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTCGTTCAGGCATGGa > 1:1189010‑M2/26‑143 (MQ=255) cctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATg > 2:129631‑M2/24‑143 (MQ=255) ctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTAGAACTGTAATAAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGc > 1:833604‑M2/23‑143 (MQ=255) tagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAGGctc > 2:547773‑M2/17‑142 (MQ=255) gaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGAt > 1:233243‑M2/12‑143 (MQ=255) aagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTGTTGTGGACAACACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTc < 1:908310‑M2/134‑1 (MQ=255) aagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTc < 2:661704‑M2/134‑1 (MQ=255) agtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCt > 1:772298‑M2/9‑143 (MQ=255) agtgctaaATAACAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATACAAGCTATAGATTCt < 2:1182332‑M2/135‑1 (MQ=255) gtgctaaATCATAGTCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGATCTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTg < 1:268218‑M2/136‑1 (MQ=255) tgctccataatactCAATTGTTAAAGTATTGTGCATTTCACTACTGGCACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGa < 1:197854/137‑1 (MQ=255) ctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATa < 2:1212905‑M2/139‑1 (MQ=255) taaATAATAATTAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATCCGGTTTG‑AAAGCCAGTCTCTATTTGATTCAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATAc < 2:947003‑M2/140‑1 (MQ=255) taaATAATAATCAATTGTTAAATTTTTGTGGTTGTAAATACTAAAACGGGAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATAc < 2:534879‑M2/140‑1 (MQ=255) taaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGAtaa > 1:754275‑M2/4‑142 (MQ=255) aATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAACTATAGATTCTGATACgg < 2:689663‑M2/142‑1 (MQ=255) ataataatCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACGGt < 1:29311/143‑1 (MQ=255) | ATAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACGGT > NC_000913/1300557‑1300840 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |