BRESEQ :: Evidence

New junction evidence
		seq id	position	reads (cov)	reads (cov)	score	skew	freq	annotation	gene	product
*	?	CP016816	131178 =	3331 (0.910)	91 (0.030)	68/200	57.2	3.0%	intergenic (+4/+96)	JCVSYN2_00525/JCVSYN2_00530	hypoxanthine phosphoribosyltransferase/glycerol kinase
*	?	CP016816	131204 =	3303 (1.140)	91 (0.030)	68/200	57.2	3.0%	intergenic (+30/+70)	JCVSYN2_00525/JCVSYN2_00530	hypoxanthine phosphoribosyltransferase/glycerol kinase
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff.
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold.

Only 100 of 3383 total aligned reads displayed.

TTGTTATTGGGTATGGATTAGATTATCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTACTCATTTAAATGTTCTTTGAACAGCTACTTTTCAACCTTTA  >  CP016816/131077‑131331

ttGTTATTGGGTATGGATTAGATTATCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTTATTAGctattc                                                                                                                                 >  1:7205020/1‑128 (MQ=255)

  gTTATTGGGTATGGATTAGATTATCAAGAAAAAATTAGACACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGcttttctt                                                                                                                               <  1:680341/128‑1 (MQ=255)

   ttATTGGGTATGGATTAGATTATCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGcttttcttt                                                                                                                              <  1:4848312/128‑1 (MQ=255)

    tATTGGGTATGGATTAGATTATCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGcttttctttt                                                                                                                             <  1:4567549/128‑1 (MQ=255)

    tATTGGGTATGGATTAGATTATCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGcttttctttt                                                                                                                             >  2:6235702/1‑128 (MQ=255)

     aTTGGGTATGGATTAGATTATCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTg                                                                                                                            >  2:1352864/1‑128 (MQ=255)

       tGGGTATGGATTAGATTATCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCt                                                                                                                          <  2:3646191/128‑1 (MQ=255)

        gggTATGGATTAGATTATCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCtt                                                                                                                         >  2:1805540/1‑128 (MQ=255)

          gTATGGATTAGATTATCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTaa                                                                                                                       <  2:2086666/128‑1 (MQ=255)

             tGGATTAGATTATCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTATTTTGCTTAAttt                                                                                                                    >  2:6510409/1‑128 (MQ=255)

             tGGATTAGATTATCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATCGATGAGCTTTTCTTTTGCGTAAttt                                                                                                                    >  2:6892745/1‑128 (MQ=255)

              ggATTAGATTATCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTATATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGACCTTTTCGTTTGCTTATTtta                                                                                                                   >  1:5143431/1‑128 (MQ=255)

              ggATTAGATTATCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATAAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATtta                                                                                                                   >  2:4573837/1‑128 (MQ=255)

              ggATTAGATTATCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCAACAATTTATGAGATTTTCTTTTGCTTAATtta                                                                                                                   >  1:3894310/1‑128 (MQ=255)

               gattagattaTCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATttat                                                                                                                  <  1:1691040/128‑1 (MQ=255)

               gattagattaACAAGAAAAAATTAGAAACTTAAAATATGTTGCAGTTTGTTATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATTATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATttat                                                                                                                  <  2:5094666/128‑1 (MQ=255)

               gatgagattaTCAAGAAAAAATTAGACACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAAGTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATttat                                                                                                                  <  2:1923755/128‑1 (MQ=255)

                       taTCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTtaatttattaatttat                                                                                                          >  1:5827873/1‑128 (MQ=255)

                         tCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATaa                                                                                                        >  1:6944078/1‑128 (MQ=255)

                            aGAAAAAATAAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAAt                                                                                                     <  2:335192/128‑1 (MQ=255)

                             gAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAAtt                                                                                                    >  2:6112552/1‑128 (MQ=255)

                             gAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAAtt                                                                                                    <  2:2251040/128‑1 (MQ=255)

                             gAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGATTAATTTATTAAGTTATAAAAtt                                                                                                    >  2:4152645/1‑128 (MQ=255)

                             gAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTT‑CTTAATTTATTAAGTTATAAAATTg                                                                                                   >  2:2646947/1‑128 (MQ=255)

                             gAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAAAGATAATAAAAAAGCTCAACAATTGAAGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATAAAGTTATAAAAtt                                                                                                    >  1:4702435/1‑128 (MQ=255)

                              aaaaaaTTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTg                                                                                                   >  2:7583569/1‑128 (MQ=255)

                              aaaaaaTTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTg                                                                                                   >  1:7362209/1‑128 (MQ=255)

                               aaaaaTTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGt                                                                                                  <  1:363955/128‑1 (MQ=255)

                                ataaTTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGtt                                                                                                 <  2:5961979/126‑1 (MQ=255)

                                  aaTTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGATTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTAt                                                                                               >  1:3779400/1‑128 (MQ=255)

                                   aTTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATc                                                                                              <  2:7152416/128‑1 (MQ=255)

                                      aGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCtt                                                                                           >  2:520449/1‑128 (MQ=255)

                                         aaCTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCa                                                                                        <  1:991912/128‑1 (MQ=255)

                                         aaCTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCa                                                                                        >  2:4834436/1‑128 (MQ=255)

                                          aCTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCat                                                                                       >  2:375258/1‑128 (MQ=255)

                                           cTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCatt                                                                                      <  2:7305414/128‑1 (MQ=255)

                                           cTTACCATAAGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATTAGCTTATCTATATCTAAATTTAATAAGTAATAAAAATCTAATCCATTCata                                                                                      >  2:1115313/1‑127 (MQ=255)

                                            ttACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCatta                                                                                     >  2:2764851/1‑128 (MQ=255)

                                            ttACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCatta                                                                                     >  2:7726179/1‑128 (MQ=255)

                                             tACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATTAGCATTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTTTAAAATTGTTATCCTTTCattat                                                                                    >  1:4319132/1‑128 (MQ=255)

                                              aCCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCattatt                                                                                   <  2:4318829/128‑1 (MQ=255)

                                               ccATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCattatta                                                                                  <  1:2083656/128‑1 (MQ=255)

                                               ccATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCattatta                                                                                  >  1:1909683/1‑128 (MQ=255)

                                                cATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCattattat                                                                                 <  2:7846052/128‑1 (MQ=255)

                                                  tatGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTAttt                                                                               >  2:2922114/1‑128 (MQ=255)

                                                    tGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTaa                                                                             <  1:2770410/128‑1 (MQ=255)

                                                      ttGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAAtt                                                                           >  2:496495/1‑128 (MQ=255)

                                                      ttGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAAtt                                                                           >  1:1554425/1‑128 (MQ=255)

                                                        gCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAAtttt                                                                         <  1:2231460/128‑1 (MQ=255)

                                                        gCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCATTTGCTTAATTAATTAAGTTATAAAATTTTTATCATTTCATTATTATTTAAtttt                                                                         >  2:667874/1‑128 (MQ=255)

                                                        gCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGATTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAAtttt                                                                         >  2:4460326/1‑128 (MQ=255)

                                                          aGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGtt                                                                                                 <  1:348782/102‑1 (MQ=255)

                                                           gTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAAtttttt                                                                       >  2:2516771/1‑127 (MQ=255)

                                                            tttGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTaaa                                                                     >  1:6603546/1‑128 (MQ=255)

                                                                  aTACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGt                                                               <  1:1402869/128‑1 (MQ=255)

                                                                    aCAACTAAATTAGATGATTGATAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTaa                                                             <  1:7102563/128‑1 (MQ=255)

                                                                    aCAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAATAATGTaa                                                             >  2:5361236/1‑128 (MQ=255)

                                                                     cAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTaaa                                                            <  1:7529430/128‑1 (MQ=255)

                                                                     cAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTaaa                                                            <  1:26304/128‑1 (MQ=255)

                                                                     aaaCTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTaaa                                                            >  1:5543591/2‑128 (MQ=255)

                                                                      aaCTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAat                                                           <  2:4682659/128‑1 (MQ=255)

                                                                      aaCTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAat                                                           >  2:3497350/1‑128 (MQ=255)

                                                                        cTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAatta                                                         <  2:5814313/128‑1 (MQ=255)

                                                                          aaaTTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAattatt                                                       >  1:2888062/1‑128 (MQ=255)

                                                                           aaTTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTc                                                      <  1:7714473/128‑1 (MQ=255)

                                                                            aTTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCa                                                     >  1:1000149/1‑128 (MQ=255)

                                                                               aGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAAtt                                                  <  2:6401507/128‑1 (MQ=255)

                                                                                gatgatTTAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAAttt                                                 <  1:3165003/128‑1 (MQ=255)

                                                                                gatgatTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAAttt                                                 <  2:871976/128‑1 (MQ=255)

                                                                                gatgatTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAAttt                                                 >  2:2405857/1‑128 (MQ=255)

                                                                                gatgatTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTAATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAAttt                                                 >  2:322752/1‑128 (MQ=255)

                                                                                 atgatTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATttc                                                >  1:4438618/1‑128 (MQ=255)

                                                                                 atgatTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATttc                                                >  1:7883696/1‑128 (MQ=255)

                                                                                 atgatTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATttc                                                >  1:5263482/1‑128 (MQ=255)

                                                                                  ttatTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATttct                                               <  1:5012115/126‑1 (MQ=255)

                                                                                  tgatTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATttct                                               <  1:3343753/128‑1 (MQ=255)

                                                                                  tgatTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATttct                                               >  1:859463/1‑128 (MQ=255)

                                                                                  tgatTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATttct                                               <  1:1806310/128‑1 (MQ=255)

                                                                                  tgatTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGATTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATttct                                               <  2:3066073/128‑1 (MQ=255)

                                                                                    atTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATttcttc                                             >  2:5503474/1‑128 (MQ=255)

                                                                                       gaaaatgaaaatAAACACGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTAc                                          <  1:4160353/128‑1 (MQ=255)

                                                                                       gAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTAc                                          <  1:2496963/128‑1 (MQ=255)

                                                                                         aaaTGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTACTc                                        <  2:566777/128‑1 (MQ=255)

                                                                                           aTGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTACTCAt                                      <  2:4011983/128‑1 (MQ=255)

                                                                                            tGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTACTCAtt                                     >  2:1551603/1‑128 (MQ=255)

                                                                                             gATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTACTCAttt                                    <  1:6138375/128‑1 (MQ=255)

                                                                                             gATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTACTCAttt                                    >  2:1237642/1‑128 (MQ=255)

                                                                                              ataataAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTACTCATTTa                                   >  1:1272178/1‑128 (MQ=255)

                                                                                              ataataAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTACTCATTTa                                   <  1:5399166/128‑1 (MQ=255)

                                                                                              ataataAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCATTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTATTATAATCATTTa                                   >  1:6424658/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                aataaAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTACTCATTTaaa                                 <  1:6267837/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                aataaAAAAGAGAATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTACTCATTTaaa                                 <  1:4021107/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                 ataaAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTACTCATTTAAAt                                <  1:1134562/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                  taaAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAAATTCTTCTACTCATTTAAATg                               >  1:5969067/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                   aaaaaaGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTACTCATTTAAATGt                              >  2:1676400/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                    aaaaaGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATACAATTTCTTCTACTCATTTAAATGtt                             >  1:5691887/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                     aaaaGCTCATCAATTGATCAGCTTATCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATAATTTAATTTTTAAAAAATGTAAATTATACATTATCATAAACTCAAATAAATGATc                            >  1:2369049/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                       gatcttttcttttGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTATAAATGTAAATTATTCAATTTATTCTACTCATTTATATGTTCTTTGAACAGCTACTTTTc          <  2:7031620/125‑1 (MQ=255)

                                                                                                                               cttttGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTACTCATTTAAATGTTCTTTGAACAGCTACTTTTCATCCTtta  >  1:3008224/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                               cttttGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTACTCATTTAAATGTTCTTTGAACAGCTACTTTTCAACCTtta  >  2:7426804/1‑128 (MQ=255)

TTGTTATTGGGTATGGATTAGATTATCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTACTCATTTAAATGTTCTTTGAACAGCTACTTTTCAACCTTTA  >  CP016816/131077‑131331

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 14 ≤` `ATCG/ATCG` `< 15 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 36 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.