BRESEQ :: Evidence

New junction evidence
		seq id	position	reads (cov)	reads (cov)	score	skew	freq	annotation	gene	product
*	?	CP016816	131178 =	3331 (0.910)	91 (0.030)	68/200	57.2	3.0%	intergenic (+4/+96)	JCVSYN2_00525/JCVSYN2_00530	hypoxanthine phosphoribosyltransferase/glycerol kinase
*	?	CP016816	131204 =	3303 (1.140)	91 (0.030)	68/200	57.2	3.0%	intergenic (+30/+70)	JCVSYN2_00525/JCVSYN2_00530	hypoxanthine phosphoribosyltransferase/glycerol kinase
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff.
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold.

Only 100 of 3333 total aligned reads displayed.

TTTGTTTTACAATTGATCCATGTTTTGTTATTGGGTATGGATTAGATTATCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTACTCATTTAAATGTTC  >  CP016816/131053‑131305

                           ttATTGGGTATGGATTAGATTATCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGcttttcttt                                                                                                    <  1:180121/128‑1 (MQ=255)

                             aTTGGGTATGGATTAGATTATCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTACTTTTg                                                                                                  >  1:1686524/1‑128 (MQ=255)

                                gggTATGGATTAGATTATCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTATGCtt                                                                                               >  1:3156461/1‑128 (MQ=255)

                                    aTGGATTAGATTATCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAAtt                                                                                           >  1:113499/1‑128 (MQ=255)

                                    aTGGATTAGATTATCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAAtt                                                                                           >  2:4698611/1‑128 (MQ=255)

                                    aTGGATTAGATTATCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAAtt                                                                                           >  2:499300/1‑128 (MQ=255)

                                    aTGGATTAGATTATCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAAATAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGAACATCAATAAATGAGCTTTTCATATACTTAAtt                                                                                           >  1:7114974/1‑128 (MQ=255)

                                     tgtattagattaTCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGAAAAAAAAAAAGCACATCAATTGAATAGCTTTTCATTATCTAAAttt                                                                                          >  1:6975942/4‑128 (MQ=255)

                                     tGGATTAGATTATCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAAttt                                                                                          >  2:4860994/1‑128 (MQ=255)

                                     tGGATTAGATTATCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAAttt                                                                                          >  2:5512428/1‑128 (MQ=255)

                                       gattagattaTCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATttat                                                                                        >  1:6150590/1‑128 (MQ=255)

                                       gattagattaTCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATttat                                                                                        <  2:3668091/128‑1 (MQ=255)

                                        attagattaTCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATttatt                                                                                       <  2:7158731/128‑1 (MQ=255)

                                        attagattaTCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATttatt                                                                                       <  1:3473976/128‑1 (MQ=255)

                                         ttagattaTCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATttatta                                                                                      >  2:2129006/1‑128 (MQ=255)

                                         ttagattaTCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATAGATGAGCATTTCTTTTGCTTAATttatta                                                                                      >  1:4018187/1‑128 (MQ=255)

                                         ttagattaTCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTAAAAATTATAATAAAAAAGCTCATAAATTTATTAGCTTTTCTTTTGGTTAATttatta                                                                                      >  1:332227/1‑128 (MQ=255)

                                          tagattaTCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTTCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTaa                                                                                     >  1:6285096/1‑128 (MQ=255)

                                          tagattaTCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTaa                                                                                     >  2:6698884/1‑128 (MQ=255)

                                          tagattaTCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTaa                                                                                     <  1:4316689/128‑1 (MQ=255)

                                           agattaTCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAg                                                                                    >  2:2552903/1‑128 (MQ=255)

                                           agattaTCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGAAGATAGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATAAATTGATGAGCTTTTCTATTGCTTAATTTATTAAg                                                                                    >  1:4140763/1‑128 (MQ=255)

                                            gattaTCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGt                                                                                   >  2:2818181/1‑128 (MQ=255)

                                              ttaTCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTta                                                                                 >  1:6810187/1‑128 (MQ=255)

                                               taTCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTtat                                                                                <  2:5972217/128‑1 (MQ=255)

                                                aTCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTtata                                                                               <  2:3097715/128‑1 (MQ=255)

                                                aTCAAGAAAAAATTAGAAACTCACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTtata                                                                               >  1:7219181/1‑128 (MQ=255)

                                                 tCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATaa                                                                              >  1:1402517/1‑128 (MQ=255)

                                                  cAAGAAAAATATAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATaaa                                                                             <  1:2377280/128‑1 (MQ=255)

                                                   aaGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATaaaa                                                                            <  2:7314421/128‑1 (MQ=255)

                                                    aGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAAt                                                                           >  2:228291/1‑128 (MQ=255)

                                                    aGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAAt                                                                           >  2:7044479/1‑128 (MQ=255)

                                                     gAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAAtt                                                                          >  1:483695/1‑128 (MQ=255)

                                                      aaaaaaTTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTg                                                                         >  2:7583569/1‑128 (MQ=255)

                                                      aaaaaaTTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTg                                                                         <  2:5229178/128‑1 (MQ=255)

                                                      aaaaaaTTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTg                                                                         >  2:1134296/1‑128 (MQ=255)

                                                       aaaaaTTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGt                                                                        >  2:5113787/1‑128 (MQ=255)

                                                        aaatTTAGAAACTTACCTTATGATGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGtt                                                                       <  1:1558909/128‑1 (MQ=255)

                                                           aTTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATttatta                                                                                      >  2:4025712/1‑110 (MQ=255)

                                                             tAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCt                                                                  >  1:5275454/1‑128 (MQ=255)

                                                               gAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAAATGATGAGCTTTTCTTTTGCTGAATTTATTAAGTTATAAAATTTTAATCCttt                                                                >  2:3249638/1‑128 (MQ=255)

                                                                 aaCTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCa                                                              <  2:242275/128‑1 (MQ=255)

                                                                  aCTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCat                                                             >  1:7727571/1‑128 (MQ=255)

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                                                                   attAACATATGTTGCAGTTTGTTATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTAATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCatt                                                            <  1:300619/127‑1 (MQ=255)

                                                                    ttAGCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCatta                                                           <  2:1382014/128‑1 (MQ=255)

                                                                    ttACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCatta                                                           >  2:1568595/1‑128 (MQ=255)

                                                                    ttACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCatta                                                           <  1:5154878/128‑1 (MQ=255)

                                                                      aCCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCattatt                                                         >  2:434006/1‑128 (MQ=255)

                                                                      aCCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCattatt                                                         >  2:5851995/1‑128 (MQ=255)

                                                                       ccATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCattatta                                                        <  2:1822541/128‑1 (MQ=255)

                                                                       ccATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCattatta                                                        >  1:1909683/1‑128 (MQ=255)

                                                                        cATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCattattat                                                       <  2:7846052/128‑1 (MQ=255)

                                                                         atatGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCattattatt                                                      >  2:4176032/1‑128 (MQ=255)

                                                                          tatGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTAttt                                                     <  1:2770659/128‑1 (MQ=255)

                                                                              ttGCAGTTTGTGATAAAACTAAATTAGATGATTTAAAATTATAATAAAAAAGCTCAACAATTGATAAGCTTTACTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATACTTTCATTATTATATAAtt                                                 >  1:3879479/1‑128 (MQ=255)

                                                                                   gTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTa                                            >  2:6259708/1‑128 (MQ=255)

                                                                                    tttGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTaa                                           >  1:3770772/1‑128 (MQ=255)

                                                                                     ttGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTaaa                                          <  1:1271658/128‑1 (MQ=255)

                                                                                           tACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTa                                    <  1:5707974/128‑1 (MQ=255)

                                                                                            aCAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTaa                                   >  1:7531299/1‑128 (MQ=255)

                                                                                             cAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTaaa                                  <  1:5413773/128‑1 (MQ=255)

                                                                                             cAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTaaa                                  <  1:3625740/128‑1 (MQ=255)

                                                                                              aaCTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAat                                 <  1:2223570/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                cTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCACTTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAatta                               <  1:5847670/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                 tAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAattat                              >  1:4438525/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                  aaaTTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAattatt                             >  1:2888062/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                    aTTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCa                           >  1:1000149/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                     ttAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCaa                          >  1:5570841/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                      tAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAAt                         <  2:124152/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                        gatgatTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATTTATATTATTCAAttt                       >  2:3396123/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                        gatgatTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAAttt                       <  2:871976/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                        gatgatTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGAGGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAAttt                       >  1:5011755/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                         atgatTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATttc                      <  1:2634457/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                          tgatTTTAAATGATAATTAAAATGCTCATCATTTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATttct                     <  1:6624876/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                          tgatTTAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATttct                     <  2:2947881/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                          tgatTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATttct                     <  2:2689055/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                          tgatTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATttct                     <  2:1963820/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                          tgatTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATttct                     <  1:4696694/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                          tgatTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATttct                     >  2:6405646/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                            atTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATttcttc                   <  2:3799863/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                            atTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATttcttc                   >  1:873878/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                            atTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATttcttc                   >  2:6903561/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                            atTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATttcttc                   <  1:6430415/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                              tGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTa                 >  2:3532297/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                              tGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTa                 >  1:2079468/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                               gAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTAc                <  2:7729055/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                               gAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTAc                >  2:45862/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                 aaaTGATAATAAAAAAGCTCATCAAGTGATGAGATTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTACTc              <  2:6135244/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                  aaTGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTACTCa             <  2:1690242/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                  aaTGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGAGGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTACTCa             <  1:5983661/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                   aTGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTACTCAt            <  2:5381290/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                   aTGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTACTCAt            <  2:7430616/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                   aTGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTACTCAt            >  1:2505950/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                      ataataAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTTTTTAATTTTTTAATAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTAATCAtttt         >  2:5688207/1‑127 (MQ=255)

                                                                                                                        aataaAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTACTCATTTaaa       <  1:7381522/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                          taaAAAATCTCATCAATTGATGAGCTTTTCATTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTACTCATTTAAATg     <  1:4566968/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                          taaAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTACTCATTTAAATg     >  2:6532257/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                           aaaaaaGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTACTCATTTAAATGt    >  2:1013086/1‑128 (MQ=255)

TTTGTTTTACAATTGATCCATGTTTTGTTATTGGGTATGGATTAGATTATCAAGAAAAAATTAGAAACTTACCATATGTTGCAGTTTGTGATACAACTAAATTAGATGATTGAAAATGATAATAAAAAAGCTCATCAATTGATGAGCTTTTCTTTTGCTTAATTTATTAAGTTATAAAATTGTTATCCTTTCATTATTATTTAATTTTTTAAAAATGTAAATTATTCAATTTCTTCTACTCATTTAAATGTTC  >  CP016816/131053‑131305

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 14 ≤` `ATCG/ATCG` `< 21 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 36 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.