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| JC | CP016816 | 311,173 | Δ4 bp | intergenic (‑96/‑215) | JCVSYN2_01300 ← / → JCVSYN2_01305 | hypothetical protein/30S ribosomal protein S21 |
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| ? | CP016816 | = 311148 | 363 (0.120) | intergenic (‑71/‑243) | JCVSYN2_01300/JCVSYN2_01305 | hypothetical protein/30S ribosomal protein S21 | |||||
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CAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCATTATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACTAATAAAATCTATTTTTATTTAAAAAA > CP016816/311026‑311280 | accagttgtaataactaatccaaatgaacttaaaattgtaattaactttttcattttacacaccccttattaaaaaataaaatacttgttacatacgattcaaaacatatataacatacattcattat < 1:2198485‑M1/3‑1 (MQ=255) cagttgtaataactaatccaaatgaacttaaaattgtaattaactttttcattttacacaccccttattaaaaaataaaatacttgttacatacgattcaaaacatatataacatacattcattatat < 1:1902359‑M1/5‑1 (MQ=255) cagttgtaataactaatccaaatgaacttaaaattgtaattaactttttcattttacacaccccttattaaaaaataaaatacttgttacatacgattcaaaacatatataacatacattcattatat < 2:6347552‑M1/5‑1 (MQ=255) gTAATATATAATATAAATGAAATTAAAATTTTATTTAATTTTTTCATTTTAAAAACAAATTATTAAAAAATAAAATAATTGTTTTATAATATTAAAAAAATATATAACATATATTCTTtatatatata < 1:4322646/128‑1 (MQ=255) 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CAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCATTATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACTAATAAAATCTATTTTTATTTAAAAAA > CP016816/311026‑311280 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |