| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | CP016816 | 311,173 | Δ4 bp | intergenic (‑96/‑215) | JCVSYN2_01300 ← / → JCVSYN2_01305 | hypothetical protein/30S ribosomal protein S21 |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | CP016816 | 311153 = | 448 (0.120) | 1666 (0.550) | 204/208 | 0.8 | 82.0% | intergenic (‑76/‑238) | JCVSYN2_01300/JCVSYN2_01305 | hypothetical protein/30S ribosomal protein S21 |
| ? | CP016816 | = 311148 | 363 (0.120) | intergenic (‑71/‑243) | JCVSYN2_01300/JCVSYN2_01305 | hypothetical protein/30S ribosomal protein S21 | |||||
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TTTAATAATTTTTCAAATTACTTTTTTAAATAAAAATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTATTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCATTATATATATATATATATATATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/311301‑311153‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tatatatatatatatatatataATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAATTTTAAGTTCATTTGGATTAGTTATTACAACTGGTAC < CP016816/311148‑311022 TTAATAATTTTTCAAATTACTTTTTTAAATAAAAATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTATTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCATTA > 2:7698022/1‑128 TAATTTTTCAAATTACTTTTTTAAATAAAAATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTATTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCATTATATA > 1:4616443/1‑128 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TTTAATAATTTTTCAAATTACTTTTTTAAATAAAAATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTATTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCATTATATATATATATATATATATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/311301‑311153‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tatatatatatatatatatataATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAATTTTAAGTTCATTTGGATTAGTTATTACAACTGGTAC < CP016816/311148‑311022 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |