| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | 117946 = | 2115 (1.180) | 75 (0.050) | 54/212 | 44.2 | 4.1% | intergenic (+67/+792) | JCVSYN2_00460/JCVSYN2_00465 | ABC transporter substrate‑binding protein/spermidine/putrescine ABC transporter permease |
| ? | CP016816 | = 117942 | 1745 (1.160) | intergenic (+63/+796) | JCVSYN2_00460/JCVSYN2_00465 | ABC transporter substrate‑binding protein/spermidine/putrescine ABC transporter permease | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 614 total aligned reads displayed.
TTGTAGTTAAACCAAGTTGTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAATAATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/118091‑117946‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taataataataataataataTTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCTCTTCAATTTCCT < CP016816/117942‑117816 TGTAGTTAAACCAAGTTGTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAA > 2:1553723/1‑128 GTAGTTAAACCAAGTTGTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATATTTATATTAAAACTCTTATTTCATTTTAAACACCTAAAATAGTTATATCATAATAAATTTATATGCTTGATAAATAAT > 1:1680337/1‑128 AGTTAAACCAAGTTGTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAA > 2:740441/1‑128 AGTTAAACCAAGTTGTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAA > 2:1196515/1‑128 TTAAACCAAGTTGTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTTAATTTATATGCTTGATAATTAATAATA > 1:3304119/1‑128 TTAAACCAAGTTGTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATTCTTGATAATTAATAATA > 2:1616500/1‑128 AAACCAAGTTGTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAAT < 1:3439207/128‑1 AAACCAAGTTGTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAAT > 2:3392291/1‑128 AACCAAGTTGTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATA < 1:607827/128‑1 AACCAAGTTGTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATA > 2:622556/1‑128 CAAGTTGTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATA < 1:3380660/128‑1 AAGTTGTTTAAATTTAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAA < 1:1610742/128‑1 AAGTTGTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAA < 2:3249972/128‑1 AAGTTGTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAA > 2:1989431/1‑128 AGTTGTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAAT > 1:839903/1‑128 AGTTGTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAAT > 1:1413791/1‑128 GTTGTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAATA > 2:2756373/1‑128 GTTGTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAATA < 2:2242819/128‑1 GTTGTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAATA > 2:279408/1‑128 GTTGTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAAGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAATA < 2:1686779/128‑1 GTTGTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTATAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAATA > 1:136709/1‑128 GTTGTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTAGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAATA < 1:376873/128‑1 GTTGTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTAGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAATA < 1:1188979/128‑1 TTGTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTTATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATACTTGATAATTAATAATAATAATAATAA > 2:1514451/1‑128 TTGTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAATAt > 2:535963/1‑127 TTGTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAATAA < 1:740299/128‑1 TGTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAATAAT < 1:1507706/128‑1 GTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAATAATA < 1:198457/128‑1 GTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAATAATA < 1:986633/128‑1 GTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAATAATA < 2:349625/128‑1 GTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTAGTTTTAAATCATTATATTAAAACTCTTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAATAATA < 1:1813761/128‑1 TATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAATAATATTGTTGC < 1:3222620/128‑1 AGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAATAATATTGTTGCTGT > 2:3845882/1‑128 TTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTA > 1:2185687/1‑128 TTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAATAATATTGTTG‑‑GTTTAAAATTTGTATTTTTA > 1:1059025/1‑128 TCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAATAATAATGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAA > 2:3342891/1‑128 AAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAATAATATTGTTGATGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACC > 2:1883554/1‑128 GTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGG < 1:2584804/128‑1 TCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTG > 2:2657687/1‑128 TTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTT > 1:1232607/1‑128 TAATCACCTAAAATATGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATA < 2:344559/128‑1 AATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAA < 1:1105570/128‑1 TAAAATAGTTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATT < 1:194014/128‑1 AATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTAT > 2:1264776/1‑128 ATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTAT > 2:1133706/1‑128 AATTAATAATAATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTT < 1:2398382/128‑1 attATAATAATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAATATTTGTATTTTTATAAAAAAGCTATAGCTTGATGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTC < 1:2136794/125‑1 TAATAATAATTATTATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCA < 2:1483652/128‑1 TAATAATAATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCA > 1:2044581/1‑128 TAATAATAATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCA < 2:3721503/128‑1 TAATAATAATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCA > 1:3022465/1‑128 ATAATAATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATT > 2:798950/1‑128 ATAATAATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATAACTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAG‑TTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTC < 2:1352464/128‑1 TAATAATAATAATTATATTGTTGCTGTTTAAAATTTTTATTTTTATAAAAAATCAATACCTTGAGGTTTTGATTATAAAATTATTTATTTATTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTC < 1:1143890/128‑1 TAATAATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTC > 2:2590624/1‑128 TAATAATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTC < 1:2441132/128‑1 TAATAATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTC < 1:1554385/128‑1 TAATAATAATAATAATATGGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTCTAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTC < 1:2866757/128‑1 AATAATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCT < 1:3113913/128‑1 AATAATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCT < 1:3154646/128‑1 AATAATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCT < 2:3630134/128‑1 ATATTAATAATAATATTGTTTCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTT < 1:2968373/128‑1 ATAATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTT > 1:1026106/1‑128 TAATATTAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTC < 2:2710287/128‑1 TAATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTTTATTTTTATAAAAAAGCAATACATTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTC > 2:3171664/1‑128 TAATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTC < 1:1289593/128‑1 TAATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTT > 1:664072/1‑118 TAATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTT < 2:664072/118‑1 AATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCT < 1:1738411/128‑1 AATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCT > 1:2517365/1‑128 AATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCT > 2:2363371/1‑128 ATAATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCTC > 2:2493233/1‑128 tATAATAATATTGTTGCTGTTTTAATTTTGTATTATTATAATAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCTCTT < 2:2968873/127‑1 tATAATAATATTGTTGCTGTTTATTATTTTTATTTTTATATAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCTCTT < 1:520592/127‑1 AATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCTCTT < 2:3110308/128‑1 AATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCTCTT < 2:1101351/128‑1 AATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCTCTT > 2:1435086/1‑128 AATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCATCTCTT < 2:907439/128‑1 AATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATATGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTAATGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCTCTT < 1:3500050/128‑1 AATAATAATATTGATGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATAGCTTGAGGTATTGCTTATATAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCTCTT < 1:3590167/128‑1 ATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCTCTTC < 2:2092713/128‑1 ATAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTATTTTCATTCTTCTCTTC > 1:907197/1‑128 TAATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAATATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCTCTTCA > 2:2870398/1‑128 TAATAATATTGTTGCGGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCTCTTCA < 2:398253/128‑1 AATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCTCTTCAA < 2:1746328/128‑1 AATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTAATTTTCTAAAAAAGCAATACCTTGAGGTAATGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCTCTTCAA < 2:3008753/128‑1 ATAATATTGTTGCTGTTTTAAATTTTTATTTTTATAAAAAAGCAAGACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCTCTTCAAT < 1:3054987/128‑1 ATAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCTCTTCAAT < 1:2294804/128‑1 TAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCTCTTCAATT < 1:3558170/128‑1 TAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCTCTTCAATT > 2:3563625/1‑128 TAATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCTCTTCAATT < 1:2781599/128‑1 AATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCTCTTCAATTT < 1:2713154/128‑1 AATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCTCTTCAATTT < 2:70459/128‑1 AATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCTCTTCAATTT < 1:436398/128‑1 AATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCTCTTCAATTT < 1:2657687/128‑1 ATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAATAAAGCAATACCTTGAGGTTTTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCTCTTCAATTTC < 2:1804931/128‑1 ATATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCTCTTCAATTTC < 1:3844744/128‑1 TATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCTCTTCAATTTCC > 1:248705/1‑128 ATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCTCTTCAATTTCCT < 2:217380/128‑1 ATTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATAACTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCTCTTCAATTTCCT < 1:370167/128‑1 TTGTAGTTAAACCAAGTTGTTTAAATATAGTTTCAGCTTGTTGTTTTAAATCTTTATATTAAAACTCGTTTTTCATTTTAATCACCTAAAATAGGTATATCATATTAAATTTATATGCTTGATAATTAATAATAATAATAATAATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/118091‑117946‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taataataataataataataTTGTTGCTGTTTAAAATTTGTATTTTTATAAAAAAGCAATACCTTGAGGTATTGCTTATAAAATTATTTATTTAGTTTTTTATTTTTACTCTCGTACTCTTTTTTTCATTCTTCTCTTCAATTTCCT < CP016816/117942‑117816 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |