| New junction evidence | |||||||||||
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| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1730 total aligned reads displayed.
ACCCATGCCTCCTCAGTTAGGAAAAAGATCTATTCCTGATTATTCAACAGGAGGTTCTATACTTCCTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTG > CP016816/370768‑371022 | cccATGCCTCCTCAGTTAGGAAAAAGATCTATTCCTGATTATTCAACAGGAGGTTCTATACTTCCTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATa > 2:3723872/1‑128 (MQ=255) cccATGCCTCCTCAGTTAGGAAAAAGATCTATTCCTGATTATTCAACAGGAGGTTCTATACTTCCTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATa < 1:2219307/128‑1 (MQ=255) cATGCCTCCTCAGTTAGGAAAAAGATCTATTCCTGATTATTCAACAGGAGGTTCTATACTTCCTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAAGAAAGAATATATCAAGCAATaaa > 1:2627591/1‑128 (MQ=255) aTGCCTCCTCAGTTAGGAAAAAGATCTATTCCTGATTATTCAACAGGAGGTTCTATACTTCCTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATaaaa > 2:2157708/1‑128 (MQ=255) 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aaGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGc > 1:1295727/1‑128 (MQ=255) gCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCa > 2:1864340/1‑128 (MQ=255) cAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATTAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAg > 1:3691289/1‑128 (MQ=255) aaTAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGt > 2:2856975/1‑128 (MQ=255) aTAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGtt > 1:446920/1‑128 (MQ=255) tAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTg < 2:3252732/128‑1 (MQ=255) | ACCCATGCCTCCTCAGTTAGGAAAAAGATCTATTCCTGATTATTCAACAGGAGGTTCTATACTTCCTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTG > CP016816/370768‑371022 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |