| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | 370895 = | 1715 (0.940) | 97 (0.060) | 50/226 | 61.2 | 5.9% | intergenic (+216/+51) | JCVSYN2_01610/JCVSYN2_01615 | hypothetical protein/phosphoglycerate kinase |
| ? | CP016816 | 370925 = | 1564 (0.960) | intergenic (+246/+21) | JCVSYN2_01610/JCVSYN2_01615 | hypothetical protein/phosphoglycerate kinase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 519 total aligned reads displayed.
TTTTCATGAATTTCAACTGGCGGAGGAGCTTCGCTTGAATTTATGGAAGGAAAAGAATTATTAGGAATTTCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAGTGAGTTTTTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/371035‑370895‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agtgagttttttaATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTAAATCCC > CP016816/370925‑371051 TTTCATGAATTTCAACTGGCGGAGGAGCTTCGCTTGAATTTATGGAAGGAAAAGAATTATTAGGAATTTCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATA < 2:603603/128‑1 TTCATGAATTTCAACTGGCGGAGGAGCTTCGCTTGAATTTATGGAAGGAAAAGAATTATTAGGAATTTCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAG > 1:113333/1‑128 TTCATGAATTTCAACTGGCGGAGGAGCTTCGCTTGAATTTATGGAAGGAAAAGAATTATTAGGAATTTCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAG < 1:1344517/128‑1 CATGACTTTCAACTGGCGGAGGAGCTTCGCTTGAATTTATGGAAGGAAAAGAATTATTAGGAATTTCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAGTG < 2:1727992/128‑1 CATGAATTTCAACTGGCGGAGGAGCTTCGCTTGAATTTATGGAAGGAAAAGAATTATTAGGAATTTCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAGTG < 1:2746037/128‑1 CATGAATTTCAACTGGCGGAGGAGCTTCGCTTGAATTTATGGAAGGAAAAGAATTATTAGGAATTTCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAGTG > 1:2551326/1‑128 CATGAATTTCAACTGGCGGAGGAGCTTCGCTTGAATTTATGGAAGGAAAAGAATTATTAGGAATTTCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAGTG < 1:2465681/128‑1 CATGAATTTCAACTGGCGGAGGAGCTTCGCTTGAATTTATGGAAGGAAAAGAATTATTAGGAATTTCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAGTG < 1:3764480/128‑1 ctgtATTTCAACTGGCTGAGGAGCTTCGCTTGAATTTATGGAAGGAAAAGAATTATTAGGAATATCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAGTGA < 1:2834717/124‑1 ATGAATTTCATCTGGCGGAGGAGCTTCGCTTGAATTATTGGAAGGAAAAGAATTATTAGGAATTACTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAATAACTCACTTTATAGTGA < 2:2013237/128‑1 ATGAATTTCAACTGGCGGAGGAGCTTCGCTTGAATTTATGGAAGGAAAAGAATTATTAGGAATTTCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAGTGA > 2:446920/1‑128 ATGAATTTCAACTGGCGGAGGAGCTTCGCTTGAATTTATGGAAGGAAAAGAATTATTAGGAATTTCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAGTGA < 2:3590847/128‑1 ATGAATTTCAACTGGCGGAGGAGCTTCGCTTGAATTTATGGAAGGAAAAGAATTATTAGGAATTTCTGCAATTCAAAATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAGTGA > 1:948087/1‑128 ATGAATTGCAACTGGCTGAGGAGCTTCGCTTGAATTTAGGGAAGGACAAGAATTATTAGGAATTTCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAGTGA < 2:725563/128‑1 TGAATTTCAACTGGCGGAGGAGCTTCGCTTGAATTTATGGAAGGAAAAGAATTATTAGGAATTTCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAGTGAG < 2:3722680/128‑1 GAATTTCAACTGGCGGAGGAGCTTCGCTTGAATTTATGGAAGGAAAAGAATTATTAGGAATTTCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAAATCACTTTATAGTGAGT > 2:2104312/1‑128 AATTTCAACTGGCGGAGGAGCTTCGCTTGAATTTATGGAAGGAAAAGAATTATTAGGAATTTCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAGTGAGTT < 1:3415765/128‑1 AATTTCAACTGGCGGAGGAGCTTCGCTTGAATTTATGGAAGGAAAAGAATTATTAGGAATTTCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAGTGAGTT < 2:3855829/128‑1 AATTTCAACTGGCGGAGGAGCTTCGCTTGAATTTATGGAAGGAAAAGAATTATTAGGAATTTCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAATGAGTT > 2:1956453/1‑128 ATTTCAACTGGCGGAGGAGCTTCGCTTGAATTTATGGAAGGAAAAGAATTATTAGGAATTTCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAACATCAATTTATAGTGATTTT > 2:3291904/1‑128 ATTTCAACTGGCGGAGGAGCTTCGCTTGAATTTATGGAAGGAAAAGAATTATTAGGAATTTCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAGTGAGTTT < 1:204891/128‑1 ATTTCAACTGGCGGAGGAGCTTCGCTTGAATTTATGGAAGGAAAAGAATTATTAGGAATTTCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAGTGAGTTT > 1:2385225/1‑128 TTCAACTGGCGGAGGAGCTTCGCTTGAATTTATGGAAGGAAAAGAATTATTAGGAATTTCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAATCTCACTTTATAGTGAGTTTTT > 1:3884043/1‑128 TTCAACTGGCGGAGGAGCTTCGCTTGAATTTATGGAAGGAAAAGAATTATTAGGAATTTCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAGTGAGTTTTT > 1:221501/1‑128 TCAACTGGCGGAGGAGCTTCGCTTGAATTTATGGAAGGAAAAGAATTATTAGGAATTTCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATAATAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATACTAAGTTTTTT > 2:1564594/1‑128 ctACTGGCGGAGGAGCTTCGCTTGAATTTATGGAAGGAAAAGAATTATTAGGAATTTCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAGTGAGTTTTTTA < 1:1839048/126‑1 CAACTGGCGGAGGAGCTTCGCTTGATTTTCTGGAAGGAAAAGAATTATTAGGAATTTCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAGTGAGTTTTTTA < 2:815590/128‑1 CAACTGACGGAGGAGCTTCGCTTGAATTTATGGAAGGAAAAGAATTATTAGGAATTTCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAGTGAGTTTATTA > 2:1887355/1‑128 GGAGCTTCGCTTGAATTTATGGAAGGAAAAGAATTATTAGGAATTTCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATT < 1:1549827/128‑1 AGGAAAAGAATTATTAGGAATTTCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAGTG > 1:290022/1‑85 ATTATTAGGAATTTCTGGAATTCAAGATAAATAATTTTAATAATAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAA < 2:333166/128‑1 TTAGGAATTTCTGTAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTC > 2:52463/1‑128 AATTTCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAAT > 2:1388880/1‑128 ATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAAT > 2:3249535/1‑128 AATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTTAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAATTTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTC > 1:687935/1‑128 TTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAA > 2:3068283/1‑128 ATAGATTAAAAAACTCACTTTATAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGC > 2:2999894/1‑128 GATTAAAAAACTCACTTTATAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAG < 1:3068283/128‑1 TTAAAAAACTCACTTTATAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTT > 2:1317126/1‑128 TCACTTTATAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTACCTTCCATAAATTCAAGCGAATCTCCTCCGCCAGATGAAATTCAT > 2:1088278/1‑128 TTTATAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCAGCCAGTTGAAATTCATGAAA > 1:796897/1‑128 TATAGTGAGTTTTTTAATCTATTACTATGTATTAAAATTATTTCTCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCATCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAAT < 2:2617088/128‑1 TATAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAAT > 1:1939767/1‑128 ATAGTGAGTTTTTTAATCTATTAAATAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGATATTACTAATAATTCTTATACTTCCATAAATTCAAGTGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATT < 1:3838870/128‑1 TAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATATATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGACATTCATGAAAATTT > 2:1666627/1‑128 TAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTT > 2:646513/1‑128 TAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAAGTGCAGAAATTCCTAATTATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGACGCTCATCCGGCAGTTTAAATTCAAGAAAATTT > 2:2506778/1‑128 AGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGACGCTCCTCCGCCAGTGGAAATTCAAGAAAATTTA > 2:2182012/1‑128 AGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTA > 1:49817/1‑128 AGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTA > 1:3176557/1‑128 AGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTA > 1:200876/1‑128 AGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTA > 1:3715134/1‑128 AGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTA > 2:3466065/1‑128 AGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTATTTTCCTTACATAAATTCAAGCTAAGCTCAACCTCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTA > 2:2233372/1‑128 AGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAAATCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAACTTCAAGCGCAGCTCCTCCGCGAGTTGACAATCATGActattga > 2:1252958/1‑121 GTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGATAATTTAT > 1:1000583/1‑128 GTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTAT > 1:822115/1‑128 GTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTAT > 1:536207/1‑128 GTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTAGAATATCATGAAAATATAT > 2:1142816/1‑128 TGAGTTTTTTAATCTATTTATTAGTATTATAATTATTAATCTTGAAATGAAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATATATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATC < 1:1623116/128‑1 TGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATC < 1:21298/128‑1 TGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATC > 2:3651387/1‑128 GAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCTAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCT > 1:2666997/1‑128 GAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCT > 1:879703/1‑128 GAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCT < 2:2769730/128‑1 GAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATATATCT > 1:3126306/1‑128 AGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTT > 1:3643131/1‑128 AGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTT > 2:2939008/1‑128 GTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTT > 1:2300196/1‑128 TTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTA > 1:347197/1‑128 TTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTA < 1:2175/128‑1 TTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTA < 2:1787054/128‑1 TTTTTAATCTATTTATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTAATGAAAATTTATCTATAA > 2:3190517/1‑128 TTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTAA > 1:3375295/1‑128 TTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTAA > 2:2292229/1‑128 TTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTAA < 2:2364393/128‑1 TTTTTAATATATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTAA < 2:3126106/128‑1 TTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTAAt < 2:862451/128‑2 TTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTAAA < 1:3563419/128‑1 TTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGAGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTAAA > 2:1499324/1‑128 TTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCTAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTAAAT < 2:3807489/128‑1 TTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTAAAT < 2:2070127/128‑1 TTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTAAAT > 2:3394618/1‑128 TTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTAAAT > 2:3928731/1‑128 TTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGACAGTTGAAATTCATGATAATTTATCTTTAAAT > 1:1737610/1‑128 TTTAATATATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTAAAT < 2:2870163/128‑1 TTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGTAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTT > 1:3279110/1‑123 TTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTAAATC > 1:1431753/1‑128 TTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTAAATC < 1:1490173/128‑1 TTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTAAATC < 1:130139/128‑1 TTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTAGAAATTCATGAAAAATTATCTTTAAATC > 1:414406/1‑128 TAATCTATTAATTAGTATTAATATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTACTAATAATTCTTTTACTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATAAAAATTTATCTTTAAATCC < 2:2701289/128‑1 TAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAATTTTATCTTTAAATCC > 1:1230181/1‑128 TAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTAAATCC < 1:3217407/128‑1 TAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTAAATCC > 2:1472921/1‑128 TAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTAAATCC < 1:1395657/128‑1 TAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTATAAATCC > 1:1064868/1‑128 TAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTATTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTAAATCC < 1:2513201/128‑1 TAATCTATTAATTAGTATAAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTAAATCC < 1:2631223/128‑1 AATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTAAATCCC < 2:1695683/128‑1 TTTTCATGAATTTCAACTGGCGGAGGAGCTTCGCTTGAATTTATGGAAGGAAAAGAATTATTAGGAATTTCTGCAATTCAAGATAAATAATTTTAATACTAATTAATAGATTAAAAAACTCACTTTATAGTGAGTTTTTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/371035‑370895‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agtgagttttttaATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTAAATCCC > CP016816/370925‑371051 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |