| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913_3_pae_pgi | 3,440,077 | Δ11 bp | coding (943‑953/990 nt) | rpoA ← | RNA polymerase, alpha subunit |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913_3_pae_pgi | 3440077 | 3440087 | 11 | 70 [0] | [0] 70 | rpoA | RNA polymerase, alpha subunit |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_pae_pgi | = 3440076 | 0 (0.000) | 68 (1.160) | 56/274 | 0.1 | 100% | coding (954/990 nt) | rpoA | RNA polymerase, alpha subunit |
| ? | NC_000913_3_pae_pgi | 3440088 = | 0 (0.000) | coding (942/990 nt) | rpoA | RNA polymerase, alpha subunit | |||||
CATATTGCGGAACATAGCCTGGCGATGGCTGCTGTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGC > NC_000913_3_pae_pgi/3439928‑3440216 | cATTTTGCGGAACAGAGCCTGGCGATGGCTGCTGTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAATCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCC < 2:473625‑M1/149‑1 (MQ=255)cATATTGCGGAACAGACGCTGGCGATGGCTGCTGTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCC < 2:435977‑M1/149‑1 (MQ=255) gattGCGGAAAATAGCCTGGCGATGGCTGCTGTTGCGTTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCca < 2:174302‑M1/148‑3 (MQ=255) aCATAGCCTGGCGATGGCTGCTGTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCCTTACCTTTCATAAGCAGCCAGGGCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtc < 1:780070‑M1/149‑12 (MQ=255) gCCTGGCGATGGCTGCTGTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgg < 1:375020‑M1/149‑17 (MQ=255) ggCTGCTGTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagca < 2:109548‑M1/149‑27 (MQ=255) gctgctGTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcac > 1:962232‑M1/1‑122 (MQ=255) tgctgTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACGTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtgcacgggaagccagcacgt > 1:6707‑M1/1‑120 (MQ=255) ttGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtcttta < 2:962232‑M1/149‑35 (MQ=255) gacgacCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagag < 1:347777‑M1/149‑48 (MQ=255) acgacCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatcccagtaagaga > 1:50991‑M1/1‑101 (MQ=255) gacCACTTGTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagatt < 2:767085‑M1/149‑51 (MQ=255) acCACTCTTACGATGGTGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattt < 2:837828‑M1/149‑52 (MQ=255) acCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgg > 2:676249‑M1/1‑98 (MQ=255) acCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgg < 1:676249‑M1/114‑17 (MQ=255) tctTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctca > 1:973894‑M1/1‑93 (MQ=255) tctTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctca < 2:973894‑M1/133‑41 (MQ=255) ctTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccag < 2:678834‑M1/116‑25 (MQ=255) ctTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccag > 1:678834‑M1/1‑92 (MQ=255) aCGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagatttttta > 1:859417‑M1/1‑89 (MQ=255) aCGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagatttttta < 2:859417‑M1/144‑56 (MQ=255) gATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacggctttaatctcagtaagaggttttttaccaaggt > 1:348830‑M1/1‑87 (MQ=255) gATGGCGCATGACCTTATCCTTCTAAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccactggaagccagcacgtctttaatctcagtgagagcttttttgccaaggt > 2:192093‑M1/1‑87 (MQ=255) gATGGCGCAAGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTCACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagtcagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggt < 1:301610‑M1/149‑63 (MQ=255) aTGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagactgtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttacccaggtt > 2:480024‑M1/1‑86 (MQ=255) cTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaag > 1:994677‑M1/1‑74 (MQ=255) ttATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaagg > 1:316713‑M1/1‑73 (MQ=255) tacccttcTCAGTAAGACTTTAACCTGTGATCCGGTTACTCATTAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaagga < 2:576621‑M1/146‑78 (MQ=255) tATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctca > 1:33370‑M1/1‑72 (MQ=255) tATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctca < 2:33370‑M1/112‑41 (MQ=255) tCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGAAGCCAGCTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggcgc > 1:420371‑M1/1‑70 (MQ=255) ccTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggagct > 2:901654‑M1/1‑69 (MQ=255) cAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggagctcaacct < 1:604359‑M1/149‑87 (MQ=255) aGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagaaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggagctcaacctc > 1:718423‑M1/1‑62 (MQ=255) gTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagtcagcacgtctttaatct < 2:752334‑M1/99‑39 (MQ=255) gTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagtcagcacgtctttaatct > 1:752334‑M1/1‑61 (MQ=255) gTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggagctcaacctcg < 1:901654‑M1/149‑89 (MQ=255) tAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggag < 2:829156‑M1/138‑79 (MQ=255) tAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggag > 1:829156‑M1/1‑60 (MQ=255) aaCCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaag < 1:42209‑M1/132‑76 (MQ=255) aaCCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaag > 2:42209‑M1/1‑57 (MQ=255) ttAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggagctcaacctcggtacgctg > 1:1036598‑M1/1‑53 (MQ=255) tgtgATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggagctcaacctcggtacgctgtaccag > 1:380308‑M1/1‑47 (MQ=255) aTCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGCTTTCCcagagacagtccacgaaaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggagctcaacctcggtacgctgtaccagatca > 1:334325‑M1/1‑43 (MQ=255) ccGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttaccatcttctcaacctcggtacgctgtaccagatcacc < 1:1039524‑M1/149‑109 (MQ=255) ggTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggagctcaacctcggtacgctgtaccagatcaccga < 1:162393‑M1/149‑111 (MQ=255) gTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaag < 1:992173‑M1/113‑76 (MQ=255) gTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaag > 2:992173‑M1/1‑38 (MQ=255) aCTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggagctcaacctcggtacgctgtaccagatcaccgatata < 2:994677‑M1/149‑115 (MQ=255) aCTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtacacatgaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggagctcaacctcggtacgctgtaccagatcaccgatata < 1:1027148‑M1/149‑115 (MQ=255) tCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggagctcaacctcggtacgctgtaccagatcaccgatatagt > 1:537986‑M1/1‑33 (MQ=255) tCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggagctcaacctcggtacgctgtaccagatcaccgatatagt > 2:438208‑M1/1‑33 (MQ=255) tCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacaggccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggagctcaacctcggtacgctgtaccagatcaccgatatagt < 1:382833‑M1/149‑117 (MQ=255) gTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggagctcaacctcggtacgctgtaccagatcaccgatatagtgg > 2:185259‑M1/1‑31 (MQ=255) gTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggagctcaacctcggtacgctgtaccagatcaccgatatagtgg > 2:716448‑M1/1‑31 (MQ=255) aGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagggattttttaccaaggttaggcgttttaaggagctcaacctcggtacgctttaccagatgaccgatagagtggatg > 1:37655‑M1/1‑28 (MQ=255) aGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggagctcaacctcggtacgctgtaccagatcaccgatatagtggata < 1:438208‑M1/149‑122 (MQ=255) aGCGACGCTTGCCGGTTGCAAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggagctcaacctcggtacgctgtaccagatcaccgatatagtggata < 2:6707‑M1/149‑122 (MQ=255) gCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggcgctaaccctcggtacgctgtaccagatcaccgatatagtggatag > 1:725487‑M1/1‑27 (MQ=255) gCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggagctcaacctcggtacgctgtaccagatcaccgatatagtggatag > 1:936504‑M1/1‑27 (MQ=255) gATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggagctcaacctcggtacgctgtaccagatcaccgatatagtggatagct < 2:380308‑M1/149‑125 (MQ=255) gCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggagctcaacctcggtacgctgtaccagatcaccgatatagtggatagcttct > 1:975549‑M1/1‑22 (MQ=255) gCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggagctcaacctcggtacgctgtaccaga < 2:348960‑M1/125‑104 (MQ=255) gCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggagctcaacctcggtacgctgtaccaga > 1:348960‑M1/1‑22 (MQ=255) cgtgcCGGTGGCCAGTTTTCTcacagacagtcaacgggaagccagcatgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggagctcaacctcggtacgctgtaccagatcaccgatatagtggatagcttctg < 1:889863‑M1/147‑129 (MQ=255) ttGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggagctcaacctcggtacgctgtaccagatcaccgatatagtggatcgcttctgc > 2:387234‑M1/1‑20 (MQ=255) ttGCCGGTGGCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggagctcaacctcggtacgctgtaccagatcaccgatatagtggatagcttctgc > 2:926913‑M1/1‑20 (MQ=255) gCCAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggagctcaacctcggtacgctgtaccagatcaccgatatagtggatagcttctgctttaaggca < 2:537986‑M1/149‑139 (MQ=255) cAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggagctcaacctcggtacgctgtaccagatcaccgatatagtggatagcttctgctttaaggcagt > 2:202728‑M1/1‑9 (MQ=255) cAGTTTTCCcagagacagtccacgggaagccagcacgtctttaatctcagtaagagattttttaccaaggttaggcgttttaaggagctcaacctcggtacgctgtaccagatcaccgatatagtggatagcttctgctttaaggcagt > 2:599157‑M1/1‑9 (MQ=255) | CATATTGCGGAACATAGCCTGGCGATGGCTGCTGTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGC > NC_000913_3_pae_pgi/3439928‑3440216 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |