| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| MC JC | NC_000913_3_pae_pgi | 1,678,015 | Δ73 bp | intergenic (‑112/‑340) | pntA ← / → ydgH | pyridine nucleotide transhydrogenase, alpha subunit/DUF1471 family periplasmic protein |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | * | ÷ | NC_000913_3_pae_pgi | 1678015 | 1678087 | 73 | 157 [0] | [0] 160 | pntA/ydgH | pyridine nucleotide transhydrogenase, alpha subunit/DUF1471 family periplasmic protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913_3_pae_pgi | = 1678014 | 0 (0.000) | 156 (1.110) | 104/262 | 0.2 | 100% | intergenic (‑111/‑413) | pntA/ydgH | pyridine nucleotide transhydrogenase, alpha subunit/DUF1471 family periplasmic protein |
| ? | NC_000913_3_pae_pgi | 1678088 = | 0 (0.000) | intergenic (‑185/‑339) | pntA/ydgH | pyridine nucleotide transhydrogenase, alpha subunit/DUF1471 family periplasmic protein | |||||
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
CCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGCCGGATAAAGACTGATAATTGTCTTCGACGGTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATACAATTCAGTTGCTTC > NC_000913_3_pae_pgi/1677941‑1678237 | attggttaaccgttctcttggtatgccaattcgcatgatattcccttccatcggttttattgatgatggtttgcctgtgtcaggagccacacaagctgctcatgtacgagctaaatgttactccgttaaaataaattagtaacaaacTAt > 3:500577‑M2/148‑150 (MQ=255) accgttctcttggtatgccaattcgcatgatattcccttccatcggttttattgatgatggtttgcctgtgtcaggagccacacaagctgctcatgtacgagctaaatgttactccgttaaaataaattagtaacaaacTATTAACGAtt < 3:596137‑M2/11‑1 (MQ=255) cgttctcttggtatgccaattcgcatgatattcccttccatcggttttattgatgatggtttgcctgtgtcaggagccacacaagctgctcatgtacgagctaaatgttactccgttaaaataaattagtaacaaacTATTAACGATTCa > 1:1203991‑M2/138‑150 (MQ=255) cgttctcttggtatgccaattcgcatgatattcccttccatcggttttattgatgatggtttgcctgtgtcaggagccacacaagctgctcatgtacgagctaaatgttactccgttaaaataaattagtaacaaacTATTAACGATTCa > 2:1015465‑M2/138‑150 (MQ=255) ctcttggtatgccaattcgcatgatattcccttccatcggttttattgatgatggtttgcctgtgtcaggagccacacaagctgctcatgtacgagctaaatgttactccgttaaaataaattagtaacaaacTATTAACGATTCAGCCg > 4:117523‑M2/134‑150 (MQ=255) atgccaattcgcatgatattcccttccatcggttttattgatgatggtttgcctgtgtcaggagccacacaagctgctcatgtacgagctaaatgttactccgttaaaataaattagtaacaaacTATTAACGATTCAGCCGTGATAGTg < 3:326614‑M2/25‑1 (MQ=255) tgccaattcgcatgatattcccttccatcggttttattgatgatggtttgcctgtgtcaggagccacacaagctgctcatgtacgagctaaatgtgactccgttaaaataaattagtaacaaacTATTAACGATTCAGCCGTGATAGTgg > 1:952462‑M2/125‑150 (MQ=255) ccaattcgcatgatattcccttccatcggttttattgatgatggtttgcctgtgtcaggagccacacaagctgctcatgtacgagctaaatgttactccgttaagataaattagtaacaaacTATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGa > 3:569054‑M2/123‑150 (MQ=255) ccaattcgcatgatattcccttccatcggttttattgatgatggtttgcctgtgtcaggagccacacaagctgctcatgtacgagctaaatgttactccgttaaaataaattagtaacaaacTATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGa > 1:599826‑M2/123‑150 (MQ=255) gatattcccttccatcggttttattgatgatggtttgcctgtgtcaggagccacacaagctgctcatgtacgagctaaatgttactccgttaaaataaattagtaacaaacTATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTa < 3:968503‑M2/39‑1 (MQ=255) attcccttccatcggttttattgatgatggtttgcctgtgtcaggagccacacaagctgctcatgtacgagctaaatgttactccgttaaaataaattagtaacaaacTATTAACGATTCAGCCGTGATAGTg > 2:134885‑M2/109‑133 (MQ=255) ttcccttccatcggttttattgatgatggtttgcctgtgtcaggagccacacaagctgctcatgtacgagctaaatgttactccgttaaaataaattagtaacaaacTATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAac < 3:771372‑M2/33‑1 (MQ=255) ttcccttccatcggttttattgatgatggtttgcctgtgtcaggagccacacaagctgctcatgtacgagctaaatgttactccgttaaaataaattagtaacaaacTATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAac > 4:771372‑M2/108‑140 (MQ=255) ccttccatcggttttattgatgatggtttgcctgtgtcaggagccacacaagctgctcatgtacgagctaaatgttactccgttaaaataaattagtaacaaacTATTAACGCTTCAGCCGTGATAGTGGCATAAACACCTTAGAACGcc > 4:509989‑M2/105‑150 (MQ=255) ccttccatcggttttattgatgatggtttgcctgtgtcaggagccacacaagctgctcatgtacgagctaaatgttactccgttaaaataaattagtaacaaacTATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGcc > 1:630724‑M2/105‑150 (MQ=255) cttccatcggttttattgatgatggtttgcctgtgtcaggagccacacaagctgctcatgtacgagctaaatgttactccgttaaaataaattagtaacaaacTATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGCCg < 1:841717‑M2/47‑1 (MQ=255) ttccatcggttttattgatgatggtttgcctgtgtcaggagccacacaagctgctcatgtacgagctaaatgttactccgttaaaataaattagtaacaaacTATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGCCgg < 3:938647‑M2/48‑1 (MQ=255) tccatcggttttattgatgatggtttgcctgtgtcaggagccacacaagctgctcatgtacgagctaaatgttactccgttaaaataaattagtaacaaacTATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGCCGGa < 4:500577‑M2/49‑1 (MQ=255) 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tggtttgcctgtgtcaggagccacacaagctgctcatgtacgagctaaatgttactccgttaaaataaattagtaacaaacTATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGCCGGATAAAGACTGATAATTGTCtt > 4:560512‑M2/82‑150 (MQ=255) tgcctgtgtcaggagccacacaagctgctcatgtacgagctaaatgttactccgttaaaataaattagtaacaaacTATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGCCGGATAAAGACTGATAATTGTCTTCGACg < 3:243559‑M2/74‑1 (MQ=255) ctgtgtcaggagccacacaagctgctcatgtacgagctaaatgttactccgttaaaataaattagtaacaaacTATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGCCGGATAAAGACTGAt < 2:585975‑M2/60‑1 (MQ=255) ctgtgtcaggagccacacaagctgctcatgtacgagctaaatgttactccgttaaaataaattagtaacaaacTATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGCCGGATAAAGACTGATAATTGTCTTCGACGGTc > 2:397762‑M2/74‑150 (MQ=255) ctgtgtcaggagccacacaagctgctcatgtacgagctaaatgttactccgttaaaataaattagtaacaaacTATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGCCGGATAAAGACTGATAATTGTCTTCGACGGTc < 4:27169‑M2/77‑1 (MQ=255) 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NC_000913_3_pae_pgi/1677941‑1678237 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |