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Missing coverage evidence... | ||||||||||
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TGTGGATCATAACCCTTTCCTCAAACCGCTATCATATGTAGATACAGTATATATCAATCTACATTGTAGATACGAGCAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACGCGCCCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTA > NC_000913_3_bme_pgi/2911330‑2911624 | tgtgGATCATAACCCTTTCCTCAAACCGCTATCATATGTAGATACAGTATATATCAATCTACATTGTAGATACGAGCAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCAC > 2:503417‑M1/1‑150 (MQ=255) tgtgGATCATAACCCTTTCCTCAAACCGCTATCATATGTAGATACAGTATATATCAATCTACATTGTAGATACGAGCAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCAC > 2:289049‑M1/1‑150 (MQ=255) tgtgGATCATAACCCTGTCCTCAAACCGCTATCATATGGAGATACAGTATATATCAATCTACATTGTAGATACGAGCAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCGGGTTGAGTGTACCCAGCAC > 2:951643‑M1/1‑150 (MQ=255) 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tatGTAGATACAGTATATATCAATCTACATTGTAGATACGAGCAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACttgcaggttgtaaatctcaatggtcatgtcgatg < 2:147274‑M1/150‑35 (MQ=255) gATACAGTATATATCAATCTACATTGTAGATACGAGCAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACttgcaggttgtaaatctcaatggtcatgtcgatggtcgcc < 1:684679‑M1/150‑41 (MQ=255) gATACAGTATATATCAATCTACATTGTAGATACGAGCAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACttgcaggttgtaaatctcaatggtcatgtcgatggtcgcc < 1:770313‑M1/150‑41 (MQ=255) tACAGTATATATCAATCTACATTGTAGATACGAGCAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATACGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACttgcaggttgtaattctcaatggtcatgtcgatggtcgccag > 1:235567‑M1/1‑108 (MQ=255) aGTATATATCAATCTACATTGTAGATACGAGCAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACttgcaggttgtaaatctcaatggtcatgtcgatggtcgccagttg < 2:253520‑M1/150‑46 (MQ=255) atatatCAATCTACATTGTAGATACGAGCAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGAGGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACttgcaggttgtaaatctcaatggtcatgtcgatggtcgccagttgctg < 1:951643‑M1/150‑49 (MQ=255) atatatCAATCTACATTGTAGATACGAGCAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACttgcaggttgtaaatctcaatggtcatgtcgatggtcgccagttgctg < 1:503417‑M1/150‑49 (MQ=255) ataaataaATCTACATTGTATATACGAGCAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGGCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACttgcaggttgtaaatctcaatggtcatgtcgatggtcgccagttgccg < 2:533116‑M1/150‑49 (MQ=255) tcaacatTGTAGATACGAGCAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACttgcaggttgtaaatctcaatggtcatgtcgatggtcgccagttgctgtttggtgtc > 1:397876‑M1/4‑93 (MQ=255) tCTACATTGTAGATACGAGCAAATATCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACttgcaggttgtaaatctcaatggtcatgtcgatggtcgccagttgctgtttggtgtc > 1:497063‑M1/1‑93 (MQ=255) cTACATTGTAGATACGAGCAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCCCttgcaggttgtaaatctcaatggtcatgtcgatggtcgccagttgctgtttggtgtcg > 2:690574‑M1/1‑92 (MQ=255) cTACATTGTAGATACGAGCAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACttgcaggttgcaaatctcaatggtcatgtcgatggtcgccagttgctgtttggtgtcg < 2:1735‑M1/150‑59 (MQ=255) aaattGTAGATACTAGCAAATATCGGCCTATCTCCCGTGCTACCGACGCGAGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCTCttgcaggttgtaaatctcaatggtcatgtcgatggtcgccagttgctgtttggtgtcgct < 1:889777‑M1/148‑61 (MQ=255) aCATCGTAGATACGAGCAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACttgcaggttgtaaatctcaatggtcatgtcgatggtcgccagttgctgtttggtgtcgct < 2:715820‑M1/150‑61 (MQ=255) aGATACGAGCAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACttgcaggttgtaaatctcaatggtcatgtcgatggtcgccagttgctgtttggtgtcgctacggctg < 2:297691‑M1/150‑68 (MQ=255) 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cACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACttgcaggttgtaaatctcaatggtcatgtcgatggtcgccagttgctgtttggtgtcgctacggctggcaacgccaagcacgttcaccttctcgttggcgagaatggtcgtgatatcacgtaacaa < 1:855807‑M1/150‑127 (MQ=255) tGGTTGAGTTTACCCAGCACttgcaggttgtaaatctcaatggtcatgtcgatggtcgccagttgctgtttggtgtcgctacggctggcaacgccaagcacgttcaccttctcgttggcgagaatggtcgtgatatcacgtaacaaccca > 1:186097‑M1/1‑20 (MQ=255) tACCCAGCACttgcaggttgtaaatctcaatggtcatgtcgatggtcgccagttgctgtttggtgtcgctacggctggcaacgccaagcacgttcaccttctcgtaggcgagaatggtcgtgatatcacgtaacaacccactacgatcat > 1:946177‑M1/1‑10 (MQ=255) tACCCAGCACttgcaggttgtaaatctcaatggtcatgtcgatggtcgccagttgctgtttggtgtcgctacggctggcaacgacaagcactttcaccttctcgttggcgagaatggtcgtgatatcacgtaacaacccactacgatcat > 1:638397‑M1/1‑10 (MQ=255) tACCCAGCACttgcaggttgtaaatctcaatggtcatgacgatggtcgccagttgctgtttcgtgtcgctacgcctggcaacgccaagcacgatcaccttctcgttggcgagaatggtcgtgatatcacgtaacaacccactacgatcat > 1:826510‑M1/1‑10 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |