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Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
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tCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACAGGAAAAGATCGCAATTGTTCAGCAGAGCTTTGAACCGGGGATGACGGTCTCCCTCGTTGCCCGGCAACATGGTGTAGCAGCCAGCCAGTTATTTCTCTGGCGTAAGCAATACCAGGAAGGAAGTCTTACTGCTGTCGCCGCCGGAGAACAGgttg > 2:43601/1‑301 (MQ=32) ttattaGACTGGCCCACTGAATCTCCAGACAACCAATATCACGTAAATAAGTGAGAGTCTTAAGACTAGTTTTTAGACTAGTCAATGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGGGAAACGCAGACGGCGTACCACACAGGAAAAGATCGCAATTGTTCAGCAGAGCTTTGAACCGGGGATGACGGTCTCCCTCGTTGCCCGGCAACATGGTGTAGCAGCCAGCCAGTTATTTCTCTGGCGTAAGCAATACCAGGAAGGAAGTCTTACTGCTGTCGCCGCCGGAGAACAGGTTGTTcc < 1:48218/301‑1 (MQ=2) tattaGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACAGGAAAAGATCGCAATTGTTCAGCAGAGCTTTGAACCGGGGATGACGGTCTCCCTCGTTGCCCGGCAACATGGTGTAGCAGCCAGCCAGTTATTTCTCTGGCGTAAGCAATACCAGGAAGGAAGTCTTACTGCTGTCGCCGCCGGAGAACAGGTTGTTCCt < 2:29507/301‑1 (MQ=11) | TGGACAGCCAGAGCGGCGAAGTAACTTTAGGTACTCCGGTAGTAATTACGTTCAACAATACCAACAGCTATCAGGAACTGAATTTCAAAGCTCGTATGGAATCCCCAAGCAAAGATGCCACCCCGGGCAACGTTTACGCTCAGGCTGACTACAAGATTGCTTACGAGTAATCGCATTTGGCCGGGTTCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACAGGAAAAGATCGCAATTGTTCAGCAGAGCTTTGAACCGGGGATGACGGTCTCCCTCGTTGCCCGGCAACATGGTGTAGCAGCCAGCCAGTTATTTCTCTGGCGTAAGCAATACCAGGAAGGAAGTCTTACTGCTGTCGCCGCCGGAGAACAGGTTGTTCCT > NC_000913/3185796‑3186393 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |