| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 2935222 | 123 (1.090) | 3 (0.030) | 3/578 | 17.0 | 2.5% | coding (988/1317 nt) | fucP | L‑fucose transporter |
| ? | NC_000913 | = 2935361 | 116 (1.060) | coding (1127/1317 nt) | fucP | L‑fucose transporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
GCTGGAGCTATTTGATTCGCTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCGCCTTTATGTCGATTCAGTACCCAACAATCTTCTCGCTGGGCATTAAGAATCTCGGCCAGGACACCAAATATGGTTCGTCCTTCATCGTTATGACCATTATTGGCGGCGGTATTGTCACTCCGGTCATGGGTTTTGTCAGTGACGCGGCGGGCAACATCCCCACTGCTGAACTGATCCCCGCACTCTGCTTCGCGGTCATCTTTATCTTTGCCCGTTTCCGTTCTCAAACGGCAACTAACTGAACATATTTTCCGAATAAAGTGAGGAATCTGTAATGAAAAAAATCAGCTTACCGAAAATTGGTATCCGCCCGGTTATTGACGGTCGTCGCATGGGTGTTCGTGAGTCG > NC_000913/2935064‑2935658 | gctgGAGCTATTTGATTCGCTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCTCCTTTATGTCGATTCATTACCCAACAATCTTCTCGCTGGGCCTTAAGAATCTCgg > 1:611796/1‑301 (MQ=255) tATTTGATTCGCTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCGCCTTTATGTCGATTCAGTACCCAACAATCTTCTCGCTGGGCATTAAGAATCTCGGCCAGGac > 1:502637/1‑300 (MQ=255) aTTTGATTCGCTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCGCCTTTATGTCGATTCAGTACCCAACAATCTTCTCGCTGGGCATTAAGAATCTCGGCCAGGaca > 2:635366/1‑300 (MQ=255) tttGATTCGCTACGCTGTAGTAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCCCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCTCCTACGCTTTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGTGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCTCCTTTATGTCGATTCCTTACCCGACAATCTTCTCGCTGGGCATTAAGAATCCCTGACAGGacac > 1:338034/1‑300 (MQ=255) tGATTCGCTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCGCCTTTATGTCGATTCAGTACCCAACAATCTTCTCGCTGGGCATTAAGAATCTCGGCCAGGACACCaa > 2:628033/1‑301 (MQ=255) cGCTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCGCCTTTATGTCGATTCAGTACCCAACAATCTTCTCGCTGGGCATTAAGAATCTCGGCCAGGACACCaagatcg > 1:201505/1‑296 (MQ=255) gCTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCGCCTTTATGTCGATTCAGTACCCAACAATCTTCTCGCTTGGCATTAAGAATCTCGGCCAGGACACCACATCTgg > 1:881586/1‑301 (MQ=255) cTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCGCCTTTATGTCGATTCAGTACCCAACAATCTTCTCGCTGGGCATTAAGAATCTCGGCCAGGACACCAAATATGGt < 2:1108760/301‑1 (MQ=255) aagCTGTAGAAGAAATTCCAGTTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGGACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCGCCTTTATGTCGATTCAGTACCCAACAATCTTCTCGCTGGGCATTAAGAATCTCGGCCAGGACACCAAATATGGTTc < 1:971394/299‑1 (MQ=255) gCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCGCCTTTATGTCGATTCAGTACCCAACAATCTTCTCGCTGGGCATTAAGAATCTCGGCCAGGACACCAAATATGGTTCGt > 2:470052/1‑301 (MQ=255) 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aTTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCGCCTTTATGTCGATTCAGTACCCAACAATCTTCTCGCTGGGCATTAAGAATCTCGGCCAGGACACCAAATATGGTTCGTCCTTCATCGTTa < 2:139392/301‑1 (MQ=255) aGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCGCCTTTATGTCGATTCAGTACCCAACAATCTTCTCGCTGGGCATTAAGAATCTCGGCCAGGACACCAAATATGGTTCGTCCTTCATCGTTATGAc > 2:823629/1‑300 (MQ=255) ttATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCGCCTTTATGTCGATTCAGTACCCAACAATCTTCTCGCTGGGCATTAAGAATCTCGGCCAGGACACCAAATATGGTTCGTCCTTCATCGTTATGAc < 2:647481/297‑1 (MQ=255) tATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCTCCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCGCCTTTATGTCGATTCAGTACCCAACAATCTTCTCGCTGGGCATTAAGAATCTCGGCCAGGACACCAAATATGGTTCGTCCTTCATCGTTATGACCat < 1:996367/300‑1 (MQ=255) gACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCGCCTTTATGTCGATTCAGTACCCAACAATCTTCTCGCTGGGCATTAAGAATCTCGGCCAGGACACCAAATATGGTTCGTCCTTCCTCGTTATGACCattatt > 1:110197/1‑301 (MQ=255) cAGGCTTTACCGATAACTATGTAACCGGAACCAGTGTGTGCTTCTGTATTGGTCGTTTGACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCGCCTTTATGTCGATTCAGTACCCAACAATCTTCTCGCTGGGCATTAAGAATCTCGGCCAGGACACCAAATATGGTTCGTCCTTCATCGTTATGACCATTATTggcg < 1:626657/300‑1 (MQ=255) cTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCGCCTTTATGTCGATTCAGTACCCAACAATCTTCTCGCTGGGCATTAAGAATCTCGGCCAGGACACCAAATATGGTTCGTCCTTCATCGTTATGACCATTATTGGcggcgg < 2:323395/300‑1 (MQ=255) cTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGGGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCGCCTTTATGTCGATTCAGTACCCAACAATCTTCTCGCTGGGCATTAAGAATCTCGGCCAGGACACCAAATATGGTTCGTCCTTCATCGTTATGACCATTATTGGcggcgg < 2:612446/300‑1 (MQ=255) ttGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCGCCTTTATGTCGATTCAGTACCCAACAATCTTCTCGCTGGGCATTAAGAATCTCGGCCAGGACACCAAATATGGTTCGTCCTTCATCGTTATGACCATTATTGGCGGCGGTAt < 2:1099747/301‑1 (MQ=255) 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aaTCTCGGCCAGGACACCAAATATGGTTCGTCCTTCATCGTTATGACCATTATTGGCGGCGGTATTGTCACTCCGGTCATGGGTTTTGTCAGTGACGCGGCGTGCAACATCCCCACTGCTGAACTGATCCCCGCACTCTGCTTCGCGGTCATCTTTATCTTTGCCCGTTTCCGTTCTCAAACGGCAACTAACTGAACATATTTTCCGAATAAAGTGAGGAATCTGTAATGAAAAAAATCAGCTTACCGAAAATTGGTATCTGCCCGGTTATTGACGGTCGTCGCATGGGTGTTCGTGAg < 2:828852/299‑1 (MQ=255) aTCTCGGCCAGGACACCAAATATGGTTCGTCCTTCATCGTTATGACCATTATTGGCGGCGGTATTGTCACTCCGGTCATGGGTTTTGTCAGTGACGCGGCGGGCAACATCCCCACTGCTGAACTGATCCCCGCACTCTGCTTCGCGGTCATCTTTATCTTTGCCCGTTTCCGTTCTCAAACGGCAACTAACTGAACATATTTTCCGTATAAAGTGAGGAATCTGTAATGAAAAAAATCAACTTAACGAAAATTGGTATCCGACCGGTTATTGACGGTCGTCGCATGGGTGTTCGTGAGTc > 2:630971/1‑300 (MQ=255) aTCTCGGCCAGGACACCAAATATGGTTCGTCCTTCATCGTTATGACCATTATTGGCGGCGGTATTGTCACTCCGGTCATGGGTTTTGTCAGTGACGCGGCGGGCAACATCCCCACTGCTGAACTGATCCCCGCACTCTGCTTCGCGGTCATCTTTATCTTTGCCCGTTTCCGTTCTCAAACGGCAACTAACTGAACATATTTTCCGAATAAAGTGAGGAATCTGTAATGAAAAAAATCAGCTTACCGAAAATTTGTATCAGCCCGGTTATTGACGGTCGTCTCATGGGTGTTCGTGAGTCg > 1:751415/1‑301 (MQ=255) | GCTGGAGCTATTTGATTCGCTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCGCCTTTATGTCGATTCAGTACCCAACAATCTTCTCGCTGGGCATTAAGAATCTCGGCCAGGACACCAAATATGGTTCGTCCTTCATCGTTATGACCATTATTGGCGGCGGTATTGTCACTCCGGTCATGGGTTTTGTCAGTGACGCGGCGGGCAACATCCCCACTGCTGAACTGATCCCCGCACTCTGCTTCGCGGTCATCTTTATCTTTGCCCGTTTCCGTTCTCAAACGGCAACTAACTGAACATATTTTCCGAATAAAGTGAGGAATCTGTAATGAAAAAAATCAGCTTACCGAAAATTGGTATCCGCCCGGTTATTGACGGTCGTCGCATGGGTGTTCGTGAGTCG > NC_000913/2935064‑2935658 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |