| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2935222 | 123 (1.090) | 3 (0.030) | 3/578 | 17.0 | 2.5% | coding (988/1317 nt) | fucP | L‑fucose transporter |
| ? | NC_000913 | = 2935361 | 116 (1.060) | coding (1127/1317 nt) | fucP | L‑fucose transporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
AAATTCCCGGCATTGCAGAGTGATAATCACAGTGACGCCAAACAAGGATCGTTCTCCGCATCGCTTTCTCGCCTGGCGCGTATTCGCCACTGGCGCTGGGCGGTATTAGCGCAATTCTGCTATGTCGGCGCACAAACGGCCTGCTGGAGCTATTTGATTCGCTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCGCCTTTATGTCGATTCAGTACCCAACAATCTTCTCGCTGGGCATTAAGAATCTCGGCCAGGACACCAAATATGGTTCGTCCTTCATCGTTATGACCATTATTGGCGGCGGTATTGTCACTCCGGTCATGGGTTTTGTCAGTGACGCGGCGGGCAACATCCCCACTGCTGAACTGATCCCCGCACTCTGCTTCGCGGTCATCTTTATCTTTGC > NC_000913/2934922‑2935520 | aaaTTCCCGGCATTGCAGAGTGATAATCACAGTGACGCCAAACAAGGATCGTTCTCCGCATCGCTTTCTCGCCTGGCGCGTATTCGCCACTGGCGCTGGGCGGTATTAGCGCAATTCTGCTATGTCGGCGCACAAACGGCCTGCTGGAGCTATTTGATTCGCTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGgccg < 1:354877/301‑1 (MQ=255) aTTCCCGGGATTGCAGCGTGGTAATCACAGTGACGCCAAACAAGGATCGTTCTCCGGATCGCTTTCTCGCCTGGCGCGTATTCGCCACTGGCGCTGGGCGGTATTAGCGCAATTCTGCTATGTCGGCGCACAAACGGCCTGCTGGAGCTATTTGATTCGCTACGCTGTAGAAGAAAATCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGgccgcc < 1:381672/301‑1 (MQ=255) tttGCAGAGTGATAATCACAGTGACGCCAAACAAGGATCGTTCTCCGCATCGCTTTCTCGCCTGGCGCGTATTCGCCACTGGCGCTGGGCGGTATTAGCGCAATTCTGCTATGTCGGCGCACAAACGGCCTGCTGGAGCTATTTGATTCGCTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTa < 1:809722/300‑1 (MQ=255) ttgaatagagcaaaacacaGTGACGCCAAGCCAGTCTCGTTTTCCGCCTCTCTTTCTATCCTGTCGCGTATTCGCCACTGGCGCTGGTCGGTATTAGCGCAATTCTGCTAGGTCGGCGCACAAACGGCCTGCTGGAGCTATTTGATTCGCAACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGATTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTaa < 1:775007/286‑1 (MQ=255) gCAGAGTGATAATCACAGTGACGCCAAACAAGGATCGTTCTCCGCATCGCTTTCTCGCCTGGCGCGTATTCGCCACTGGCGCTGGGCGGTATTAGCGCAATTCTGCTATGTCGGCGCACAAACGGCCTGCTGGAGCTATTTGATTCGCTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACTGGTACCTGGCACATCAGTCTCTTCTCACCACACAAAGTCCTGGCAGCCTACGCATTaac > 1:607450/1‑299 (MQ=255) gCAGAGTGATAATCACAGTGACGCCAAACAAGGATCGTTCTCCGCATCGCTTTCTCGCCTGGCGCGTATTCGCCACTGGCGCTGGGCGGTATTAGCGCAATTCTGCTATGTCGGCGCACAAACGGCCTGCTGGAGCTATTTGATTCGCTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAAt > 2:972585/1‑300 (MQ=255) agTGATAATCACAGTGACGCCAAACAAGGATCGTTCTCCGCATCGCTTTCTCGCCTGGCGCGTATTCGCCACTGGCGCTGGGCGGTATTAGCGCAATTCTGCTATGTCGGCGCACAAACGGCCTGCTGGAGCTATTTGATTCGCTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGc < 2:264369/299‑1 (MQ=255) agTGATAATCACAGTGACGCCAAACAAGGATCGTTCTCCGCATCGCTTTCTCGCCTGGCGCGTATTCGCCACTGGCGCTGGGCGGTATTAGCGCAATTCTGCTATGTCGGCGCACAAACGGCCTGCTGGAGCTATTTGATTCGCTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCt < 2:74509/300‑1 (MQ=255) cGCCAAACAAGGATCGTTCTCCGCATCGCTTTCTCGCCTGGCGCGTATTCGCCACTGGCGCTGGGCGGTATTAGCGCAATTCTGCTATGTCGGCGCACAAACGGCCTGCTGGAGCTATTTGATTCGCTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGAt > 2:228788/1‑300 (MQ=255) ccaaccaaGGATCGTCCTCCGCATCGCTTTCTCGCCTGGCGCGTATTCGCCACTGGCGCTGGGCGGTATTAGCGCAATTCTGCTATGTCGGCGCACAAACGGCCTGCTGGAGCTATTTGATTCGCTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGAtctc < 1:228527/301‑1 (MQ=255) 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gcgcGTATTCGCCACTGGCGCTGGGCGGTATTAGCGCAATTCTGCTATGTCGGCGCACAAACGGCCTGCTGGAGCTATTTGATTCGCTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTg < 2:615597/300‑1 (MQ=255) tATTCGCCAATGGCGCTGGGCGGTATTAGCGCAATTCTGCTATGTCGGCGCAAAAAAGGCCTGCTGGAGCTATTTGATTCGCTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTa < 1:641783/301‑1 (MQ=255) agttcagacgtgtgctcttccgatctAGCGCAATTCTGCTATGTCGGCGCACAAACGGCCTGCTGGAGCTATTTGATTCGCTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTa < 2:803487/275‑1 (MQ=255) 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gCCACTGGCGCTGGGCGGTATTAGCGCAATTCTGCTATGTCGGCGCACAAACGGCCTGCTGGAGCTATTTGATTCGCTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTACTCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGCCATGTGGGCTTCATAGCCCTGACTTTTTTCAg > 2:31217/1‑301 (MQ=255) aCTGGCGCTGGGCGGTATTAGCGCAATTCTGCTATGTCGGCGCACAAACGGCCTGCTGGAGCTATTTGATTCGCTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTTCGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGGCGGCGGTCATGTGGGCTTTATAGCCCTGCATTTATGCAgcg > 1:390012/1‑300 (MQ=255) cTGGCGCTGGGCGGTATTAGCGCAATTCTGCTATGTCGGCGCACAAACGGCCTGCTGGAGCTATTTGATTCGCTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTTTGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCTGTCATGTGGGCTTACTAGCCCTGACTTTATGCCgccc > 1:437743/1‑298 (MQ=255) 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tATGTCGGCGCACAAACGGCCTGCTGGAGCTATTTGATTCGCTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCGCCTTTATGTCGATTCAGTACCCAACAAtctt > 2:666209/1‑299 (MQ=255) tCGGCGCACAAACGGCCTGCTGGAGCTATTTGATTCGCTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCGCCTTTATGTCGATTCAGTACCCAACAATCTTCTCGc < 2:900916/300‑1 (MQ=255) cgcACAAACGGCCTGCTGGAGCTATTTGATTCGCTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCGCCTTTATGTCGATTCAGTACCCAACAATCTTCTCGCTGGGc < 2:461984/301‑1 (MQ=255) 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gCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCGCCTTTATGTCGATTCAGTACCCAACAATCTTCTCGCTGGGCATTAAGAATCTCGGCCAGGACACCAAATATGGTTCGTCCTTCATCGTTATGACCATTATTGGCGGCGGTATTGTCACTCCGGTCATGGGTTTTGTCAGTGACGCGGCAGGCAACATCCCCACTGCTGAACTGATCCCCGCAct > 2:735623/1‑298 (MQ=255) tctCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCGCCTTTATGTCGATTCAGTACCCAACAATCTTCTCGCTGGGCATTAAGAATCTCGGCCAGGACACCAAATATGGTTCGTCCTTCATCGTTATGACCATTATTGGCGGCGGTATTGTCACTCCGGTCATGGGTTTTGTCAGTGACGCGGCGGGCAACATCCCCACTGCTGAACTGATCCCCGCACTCTGc < 2:136614/299‑1 (MQ=255) cGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCGCCTTTATGTCGATTCAGTACCCAACAATCTTCTCGCTGGGCATTAAGAATCTCGGCCAGGACACCAAATATGGTTCGTCCTTCATCGTTATGACCATTATTGGCGGCGGTATTTTCACTCCGGTCATGGGTTTTGTCAGTGACGCGGCGGGCAACATCCCCACTGCTGAACTGATCCCCGCAccttgcagg > 1:136475/1‑293 (MQ=255) cGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCGCCTTTATGTCGATTCAGTACCCAACAATCTTCTCGCTGGGCATTAAGAATCTCGGCCAGGACACCAAATATGGTTCGTCCTTCATCGTTATGACCATTATTGGCGGCGGTATTGTCACTCCGGTCATGGGTTTTGTCAGTTACGCGGCGGGCAACATCCCCACCTCTGAACTGATCCCCTCACTCTGCtt > 1:1107414/1‑300 (MQ=255) ccacACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCGCCTTTATGTCGATTCAGTACCCAACAATCTTCTCGCTGGGCATTAAGAATCTCGGCCAGGACACCAAATATGGTTCGTCCTTCATCGTTATGACCATTATTGGCGGCGGTATTGTCACTCCGGTCATGGGTTTTGTCAGTGACGCGGCGGGCAACATCCCCACTGCTGAACTGATCCCCGCACTCTGCTTCGCgg < 1:907186/301‑1 (MQ=255) ccgccTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCGCCTTTATGTCGATTCAGTACCCAACAATCTTCTCGCTGGGCATTAAGAATCTCGGCCAGGACACCAAATATGGTTCGTCCTTCATCGTTATGACCATTATTGGCGGCGGTATTGTCACTCCGGTCATGGGTTTTGTCAGTGACGCGGCGGGCAACATCCCCACTGCTGAACTGATCCCCGCACTCTGCTTCGCGGTCATCTTTATCTTTGc < 2:335437/301‑1 (MQ=255) | AAATTCCCGGCATTGCAGAGTGATAATCACAGTGACGCCAAACAAGGATCGTTCTCCGCATCGCTTTCTCGCCTGGCGCGTATTCGCCACTGGCGCTGGGCGGTATTAGCGCAATTCTGCTATGTCGGCGCACAAACGGCCTGCTGGAGCTATTTGATTCGCTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCATGTGGGCTTAATAGCCCTGACTTTATGCAGCGCCTTTATGTCGATTCAGTACCCAACAATCTTCTCGCTGGGCATTAAGAATCTCGGCCAGGACACCAAATATGGTTCGTCCTTCATCGTTATGACCATTATTGGCGGCGGTATTGTCACTCCGGTCATGGGTTTTGTCAGTGACGCGGCGGGCAACATCCCCACTGCTGAACTGATCCCCGCACTCTGCTTCGCGGTCATCTTTATCTTTGC > NC_000913/2934922‑2935520 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |