| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 36462 | 67 (1.810) | 3 (0.090) | 3/232 | NT | 3.4% | coding (90/675 nt) | tpn | IS431mec transposase |
| ? | CP000730 | 76234 = | 109 (3.280) | intergenic (+292/‑842) | USA300HOU_0072/USA300HOU_0075 | universal stress protein/lysophospholipase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
TCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCAACA > CP000730/36322‑36602 | tcatcaATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATA > 2:129507‑M1/1‑141 (MQ=255)tcatcaATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATA < 2:106617‑M1/141‑1 (MQ=255)tcatcaATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATA < 1:408707‑M1/141‑1 (MQ=255) catcaATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTTTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGatatat > 2:256445/1‑141 (MQ=11) catcaATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACCCCACGTTCTCTTAATATTTCAGatatat < 1:456661/141‑1 (MQ=255) catcaATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGatatat > 1:86204/1‑141 (MQ=255) catcaATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGatatat < 2:38158/141‑1 (MQ=255) catcaATACGCCATTTGTAATAAGCTGTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTTAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGatatat < 2:348434/141‑1 (MQ=255) atcaATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGTGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCACTTAATATTTCAGatatatt > 2:11342/1‑140 (MQ=255) atcaATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATc < 1:241384/141‑1 (MQ=255) atcaATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATc > 1:362035/1‑141 (MQ=21) atcaATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATc > 2:230083/1‑141 (MQ=21) tcaATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCa < 2:358875/141‑1 (MQ=21) caATACGCCATTTGTAATAAGCTTGTTTGTGCCTTTTCTACCAAATTTGATATGAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGGTTAATGATGAACGTTTACAACACGTTCTCTTATTATTTTAGatctagaaa > 2:431239/1‑137 (MQ=11) aaTACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACg < 1:118317/141‑1 (MQ=255) aTACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGa > 2:159831/1‑141 (MQ=255) aTACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGa < 2:417601/141‑1 (MQ=255) tACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGAt < 1:370344/141‑1 (MQ=255) tACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGAt > 2:129192/1‑141 (MQ=255) cGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATag > 1:67183/1‑140 (MQ=255) gCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCACATTTGATACAAAATTTGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAAc > 2:214991/1‑141 (MQ=255) ccATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATagct > 1:452165/1‑138 (MQ=11) ccATTTGTAATAAGCCTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACt > 1:430511/1‑141 (MQ=17) cagtttGTAATAAGCTTTTTTCTGCTTTTTCTTCCAAGTTTGATACAAACTTGGGGCATATTCTTGACCCCAGCCGTAGAACGCTGAATAATGACCCTTTACACCACGTCACCTTAATTTTTCAGATATATCACGATAACt < 2:37082/138‑1 (MQ=14) tctttGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTc < 1:418551/139‑1 (MQ=21) cATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTc < 1:427244/141‑1 (MQ=11) cATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTc < 2:420011/141‑1 (MQ=21) ttttGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCCAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTTAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCa < 1:177574/140‑1 (MQ=255) aTTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATCTTTCAGATATAtaactatcgctca > 2:108226‑M1/1‑128 (MQ=255) aTTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCa < 2:327012/141‑1 (MQ=21) tttGTNATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCANGTTNTCTTAATNTTTCAGATATATCACGATAGCTCaa < 1:162759/141‑1 (MQ=11) tttGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCaa < 2:408315/141‑1 (MQ=18) ttGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAAt < 1:449779/141‑1 (MQ=11) ttGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAAt < 2:143819/141‑1 (MQ=21) ttGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAAt > 2:424370/1‑141 (MQ=25) tttaataaGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATg < 2:171939/139‑1 (MQ=11) tGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATg < 1:6533/141‑1 (MQ=255) tGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAAAGGTAGACAGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATg > 2:238853/1‑141 (MQ=255) gTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATgc < 1:428207/141‑2 (MQ=11) gTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATgc > 1:138234/1‑140 (MQ=11) taataaGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATgca < 1:411175/141‑3 (MQ=11) taataaGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATgca > 1:25874/1‑139 (MQ=11) taataaGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATgca < 1:151174/141‑3 (MQ=17) taataaGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATGGGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATgca < 1:318834/141‑3 (MQ=255) aataaGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATgcat > 1:208122/1‑138 (MQ=11) aataaGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATgcat > 1:317118/1‑138 (MQ=11) aataaGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATgcat > 2:279354/1‑138 (MQ=11) aataaGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATgcat > 2:312100/1‑138 (MQ=11) aataaGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGtat > 1:378802/1‑141 (MQ=255) aGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCt < 1:118097/141‑1 (MQ=39) tttttATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGa < 2:396714/141‑1 (MQ=35) tttATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGAta < 1:362772/141‑1 (MQ=35) tGCTTTTTCTTCCAAATTTGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGAtagtag > 2:35125/1‑141 (MQ=35) cTTTTTCTTCCAAATTTGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACTCCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGcc < 1:104217/141‑1 (MQ=25) tttttCTTCCAAATTTGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCCa < 1:408245/141‑1 (MQ=35) ccAAATTTGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTAc > 1:274089/1‑141 (MQ=35) cAAATTTGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACa > 1:284187/1‑141 (MQ=34) tGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATa > 2:69157/1‑141 (MQ=35) aCAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACAt > 2:340178/1‑141 (MQ=34) aaaTTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCGCGTTCCCTTAATATTTCTGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCt < 2:343887/141‑1 (MQ=17) aaaTTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCt < 2:228812/141‑1 (MQ=32) aTTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTg < 1:402714/141‑1 (MQ=32) ttGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTAAATGTATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGt < 1:123556/141‑1 (MQ=17) gggCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGGTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTaa > 1:447634/1‑141 (MQ=17) gCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACACAATGTACGACTTAGATAGTAGCTTATGGTTTAAGTGATAACATTATTGTTattt < 2:147413/141‑4 (MQ=11) gAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATAaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctactatctaagatatgcattgagttatcgtgatatatc < 1:1692‑M1/141‑77 (MQ=255) gAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATc > 2:5317/1‑141 (MQ=32) aaCCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCt > 1:116683/1‑141 (MQ=32) aaCTGTATACCGTTGAATTATGAACTTTTACACCACGTTCCCTTAATATTACAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAAt < 2:244594/141‑1 (MQ=11) aaCGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATAaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctactatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaat < 2:275144‑M1/141‑83 (MQ=255) aaCGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAAt < 2:363022/141‑1 (MQ=32) aCGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATAaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctactatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaata < 1:17157‑M1/141‑84 (MQ=255) aCGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATa > 1:391708/1‑141 (MQ=32) ccGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATAc > 1:90360/1‑141 (MQ=32) aaTGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACagaaga < 1:195108/141‑1 (MQ=32) caccacGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTaaa < 1:445758/141‑1 (MQ=32) acGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATta < 1:128760/141‑1 (MQ=32) ttCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCCAACAGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGCAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATAc < 2:353262/141‑1 (MQ=17) tctTAATATTTCAGATATAaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctactatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaaga < 1:393823‑M1/107‑90 (MQ=255) tctTAATATTTCAGATATAaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctactatctaagatatgcattgacctatcgtgatatatctgaaatattaaga > 2:393823‑M1/2‑19 (MQ=255) tatTTCAGATATAaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctactatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgt < 1:446628‑M1/141‑129 (MQ=255) tatTTCAGATATAaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctactatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgt < 2:265866‑M1/141‑129 (MQ=255) tatTTCAGATATAaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctactatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgt < 1:217045‑M1/141‑129 (MQ=255) tatTTCAGATATAaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctactatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgt < 1:263532‑M1/141‑129 (MQ=255) atTTCAGATATAaacaatttaacaaggatgttatcactgtagctgttggctactatctaagatatgcattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacggtctaccgtt > 1:36234‑M1/1‑12 (MQ=255) atTTCAGATATAaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctactatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgtt > 1:280830‑M1/1‑12 (MQ=255) atTTCAGATATAaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctactatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgtt > 1:48300‑M1/1‑12 (MQ=255) atTTCAGATATAaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctactatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgtt > 1:280837‑M1/1‑12 (MQ=255) tttCAGATATAaacaatttaacaaggatgttatcactgtagctgttggctactatctaagatatgcattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacggtctaccgttg > 1:84034‑M1/1‑11 (MQ=255) tttCAGATATAaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctactatctaagatatgcattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacggtctaccgttg > 1:287355‑M1/1‑11 (MQ=255) cAGATATAaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctactatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggt < 2:423237‑M1/141‑134 (MQ=255) aGATATAaacaatttaacaaggatgttatcactgtagctgttcgctactatctaagatatgcattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacggtctaccgatgggtt > 2:218252‑M1/1‑7 (MQ=255) aGATATAaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctactatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggtt > 2:119045‑M1/1‑7 (MQ=255) gATATAaacaatttaacaaggatgttatcactgtagctgttggctactatctaagatatgcattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgtaaacgttcatca > 1:62162‑M1/1‑6 (MQ=255) gATATAaacaatttaacaaggatgttatcactgtagctgttggctactatctaagatatgcattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgtaaacgttcatca < 2:62162‑M1/118‑113 (MQ=255) gATATAaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctactatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttc > 1:425307‑M1/1‑6 (MQ=255) atatAaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctactatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttca < 2:199555‑M1/141‑137 (MQ=255) tataaacaatttaacaaggatgttatcactgtagctgttggctactatctaagatatgcattgagttatcgtgatatatctgaaatattcagggaacgtggtgtaaacgttcatcattccacggtctaccgtcgggctcac > 2:217656‑M1/1‑4 (MQ=255) ataaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctactatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaag > 1:132701‑M1/1‑3 (MQ=255) aaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctactatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaa > 1:130577‑M1/1‑1 (MQ=255) | TCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCAACA > CP000730/36322‑36602 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |