| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 36462 | 67 (1.810) | 3 (0.090) | 3/232 | NT | 3.4% | coding (90/675 nt) | tpn | IS431mec transposase |
| ? | CP000730 | 76234 = | 109 (3.280) | intergenic (+292/‑842) | USA300HOU_0072/USA300HOU_0075 | universal stress protein/lysophospholipase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTGATGTACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000730/36310‑36462‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tatttcagatataAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAA > CP000730/76234‑76373 TTGATATACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAAT < 1:66246/141‑1TTGATATACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAAT < 1:262707/141‑1 gataTACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATAT > 1:453325/5‑141 gataTACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATAT > 2:97579/5‑141 gataTACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATAT > 1:211830/5‑141 gataTACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATAT > 1:162924/5‑141 gataTACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATAT > 2:17369/5‑141 GATGTACGTCTCATCANTACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATAT > 1:255036/1‑141 GATGTACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATAT > 2:280953/1‑141 GATGTACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATAT > 1:142773/1‑141 GATATACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATAT < 1:258450/141‑1 ATGTACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATT < 2:195410/141‑1 ATGTACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TGTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTATACACCACGTTCCCTTAATATT > 1:378815/1‑141 taTACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTT > 2:37859/3‑141 taTACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTT > 1:44977/3‑141 TACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCGAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCA > 1:275144/1‑141 TACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCA < 1:63753/141‑1 TACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCA < 1:378087/141‑1 TACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTACCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCGCGTTCCCTTAATATTTCA < 2:328786/141‑1 ACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCACATTTGATATAAAATTGTGGCATATTCTTGATCCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAATGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAG > 2:239241/1‑141 ACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAACTTTGATATCAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGACTGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAG < 2:188319/141‑1 ACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACCACACGTTCCCTTAATATTTCAG > 1:346410/1‑141 ACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAG > 1:158296/1‑141 CGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATTC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGA > 2:46353/1‑141 CGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGGATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTTAGA > 2:199918/1‑141 CGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTAAAACACGTTCTCTTAATATTTCAGA > 2:418828/1‑141 CGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGA > 1:146007/1‑141 GTCTCCTAAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCACATTTGATATAACATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGTTCGTTGAATGATGAAGCTTTACACCACGTTCTCTTCATATTTCCGAT < 2:323366/141‑1 GTCTCATCAATACGCCATTTGTAATATGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGAT < 1:334207/141‑1 GTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTTTTCTTTTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGACTGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCA > 2:436257/1‑141 GTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGAT < 1:48749/141‑1 GTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGAT < 2:414867/141‑1 GTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGAT < 2:277027/141‑1 GTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGAT < 1:247863/141‑1 GTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGAT < 1:61089/141‑1 TCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATA < 2:311483/141‑1 TCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATA < 2:209943/141‑1 TCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATA < 2:138316/141‑1 TCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATA > 1:347233/1‑141 CTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATAT > 2:306239/1‑141 TCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATA > 2:129507/1‑141 TCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATA < 1:408707/141‑1 TCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATA < 2:106617/141‑1 ATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATCTTTCAGATATAtaactatcgctca > 2:108226/1‑128 GAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATC < 1:1692/141‑1 AACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAAT < 2:275144/141‑1 ACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATA < 1:17157/141‑1 tCTTAATATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGa < 1:393823/107‑2 tCTTAATATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGACCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGa > 2:393823/2‑107 TATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGT < 1:217045/141‑1 TATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGT < 1:446628/141‑1 TATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGT < 2:265866/141‑1 TATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGT < 1:263532/141‑1 ATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCTGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTT > 1:36234/1‑141 ATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTT > 1:280837/1‑141 ATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTT > 2:411949/1‑141 ATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTT > 1:280830/1‑141 ATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTT > 1:48300/1‑141 TTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCTGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTG > 1:84034/1‑141 TTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTG > 1:287355/1‑141 TCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCTGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGG < 1:39948/141‑1 TCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGG > 2:113904/1‑141 CAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGT < 2:423237/141‑1 AGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCTGTTCGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGATGGGTT > 2:218252/1‑141 AGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTT > 2:119045/1‑141 GATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCTGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCA > 1:62162/1‑118 GATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCTGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCA < 2:62162/118‑1 GATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTC > 1:224997/1‑141 GATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTC > 1:425307/1‑141 ATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCA < 2:199555/141‑1 TATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCTGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTCAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCCACGGTCTACCGTCGGGCTCAc > 2:217656/1‑140 ATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAG > 1:132701/1‑141 AAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAA > 1:130577/1‑141 TTGATGTACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGC‑‑‑TTTTTCTTCCAAATTTGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000730/36310‑36462‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tatttcagatataAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAA > CP000730/76234‑76373 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |