| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 2144160 | 1 (0.010) | 40 (0.540) +TGGTTTATCT |
25/250 | 3.6 | 97.7% | coding (484/1254 nt) | sdrH | Ser‑Asp rich fibrinogen/bone sialoprotein bindin protein SdrH |
| ? | CP000730 | 2144165 = | 1 (0.010) | coding (479/1254 nt) | sdrH | Ser‑Asp rich fibrinogen/bone sialoprotein bindin protein SdrH | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
TCGAGCCACCAGAATGATTGGAATCCCCAGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000730/2144022‑2144160‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGTCTGGTTTTGGATCTGGATTTGGTTTCGGGTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTG > CP000730/2144165‑2144228 |||||||||| TCGAGCCACCAGAATGATTGGAATCCCCAGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTG > 1:689886/1‑141TCGAGCCACCAGAATGATTGGAATCCCCAGGTTGATCGGGAACTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGTATCCGGATTTGGCTTTG > 2:350190/1‑141 CGAGCCACCAGAATGATTGGAATCCCCAGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTATTCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGG < 1:16631/141‑1 gagcttctAGAATGATTGGCATCCCCAGGTTGATCGGGCTCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGT > 2:317980/9‑141 CACCAGAATGATTGGAATCCCCAGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTAT < 1:179796/141‑1 CCAGAATGATTGGAATCCCCAGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCT > 1:874652/1‑141 AGAATGATTGGAATCCCCAGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGG < 1:518523/141‑1 AGAATGATTGGAATCCCCAGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGG < 1:533879/141‑1 GAATGATTGGAATCCCCAGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGG < 1:647223/141‑1 GAATGATTGGAATCCCCAGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGG > 1:701333/1‑141 GAATGATTGGAATCCCCAGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGCATTTTTCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGG < 1:16887/141‑1 ATGATTGGAATCCCCAGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTC < 1:372038/141‑1 TGATTGGAATCCCCAGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCT > 2:639353/1‑141 tTTGGAATCCCCCGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATACGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGG < 2:833045/140‑1 ATTGGAATCCCCAGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGG > 2:146674/1‑141 ATTGGAATCCCCAGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATACGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGG < 2:833063/141‑1 TTGGAATCCCCAGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGT > 2:864905/1‑141 TGGAATCCCCAGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTT > 2:658449/1‑141 TCCCCCGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGCATTTGGCTTTGGTCTCTCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGA < 1:916107/141‑1 TCCCCAGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGA < 2:720141/141‑1 CCCCAGGTTGGTCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGAT < 2:426615/141‑1 CCCAGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGATC > 2:494727/1‑141 gatcaacctgGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGATCcg > 1:722002/11‑139 AGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGATCcgg < 1:352395/141‑4 GGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGATCCGGt > 2:379581/1‑140 TTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGATCcggttt < 2:77854/141‑7 TTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGATCcggttt < 2:43989/141‑7 TTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGATCcggttt < 1:243581/141‑7 ATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGATCCGGTTTTGG > 2:841090/1‑141 ATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGATCCGGTTTTGG < 1:658449/141‑1 ATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGATCCGGTTTTGGTTTCGG < 2:330085/141‑1 GGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGATCCGGTTTTGGTTTCGGGTTA > 1:326333/1‑141 cGACGGGTTAGGATTTGGCTCATTAGGGCCTGGTTTTGGCTTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGATAAGGATTTGGATTCGGGTTATa > 2:774597/2‑140 GACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGATCCGGTTTTGGTTTTGGGTTATCT > 2:809507/1‑141 GACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTT < 1:468224/93‑1 GACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTT > 2:468224/1‑93 CGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGATCCGGTTTTGGTTTCGGGTTATCTGG > 1:168999/1‑141 GGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGATCCGGTTTTGGTTTCGGGTTATCTGGA < 2:546520/141‑1 AGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGATCCGGTTTTGGTTTCGGGTTATCTGGATCTGG > 1:302086/1‑141 GGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGATCCGGTTTTGGTTTCGGGTTATCTGGATCTGGT < 2:722002/141‑1 GGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGATCCGGTTTTGGTTTCGGGTTATCTGGATCTGGT < 2:112535/141‑1 TTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGATCCGGTTTTGGTTTCGGGTTATCTGGATCTGGTTTa < 1:146674/141‑2 GGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGATCCGGTTTTGGTTTCGGGTTATCTGGATCTGGTTTAGGA > 1:110015/1‑141 ATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGATCCGGTTTTGGTTTCGGGTTATCTGGATCTGGTTTAGGATTCGG > 2:908325/1‑141 AGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGATCCGGTTTTGGTTTCGGGTTATCTGGATCTGGTTTAGGATTCGGAct > 1:530991/1‑139 AGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGATCCGGTTTTGGTTTCGGGTTATCTGGATCTGGTTTAGGATTCGGAct < 1:430260/141‑3 GGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGATCCGGTTTTGGTTTCGGGTTATCTGGATCTGGTTTAGGATTCGGActt < 2:588003/141‑4 GGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGGTCTGGTTTTGGATCCGGTTTTGGTTTCGGGTTATCTGGATCTGGTTTAGGATTCGGACTTG > 1:569769/1‑141 |||||||||| TCGAGCCACCAGAATGATTGGAATCCCCAGGTTGATCGGGATCTGGTGACGGGTTAGGATTTGGCTTATTAGGGTCTGGTTTTGGATTCGGATTTGGCTTTGGTTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTGGCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000730/2144022‑2144160‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGTCTGGTTTTGGATCTGGATTTGGTTTCGGGTTATCTGGATCTGGTTTTGGATCCGGATTTG > CP000730/2144165‑2144228 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |