| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 562 total aligned reads displayed.
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ggCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTATCTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactct < 6:550524‑M1/150‑13 (MQ=255) gCGATCTGGATATGCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctat < 4:943327‑M1/151‑15 (MQ=255) gATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCAct > 4:154838/1‑151 (MQ=255) aTCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCActc > 1:352165/1‑151 (MQ=255) cTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcc > 7:397048‑M1/1‑132 (MQ=255) 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cACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGGCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCg < 5:1177122/151‑1 (MQ=255) aCCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCg > 5:1758017/1‑150 (MQ=255) tATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtgaagagtatgcattgaatttgcctgctattgagacctatattggtcactcaattccggtaagcaaatacaatccggacgcattgatgaccgatctgccaaa > 2:1740643‑M1/1‑22 (MQ=255) tATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtgaagagtatgcattgaatttgcctgctattgagacctatattggtcactcaattccggtaagcaaatacaatccggacgcattgatgaccgatctgccaaa > 4:1347425‑M1/1‑22 (MQ=255) aTTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtgaagagtatgcattgaatttgcctgctattgagacctatattggtcactcaattccggtaagcaaatacaatccggacgcattgatgaccgatctgccaaaa < 7:1061946‑M1/150‑130 (MQ=255) aTTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtgaagagtatgcattgaatttgcctgctattgagacctatattggtcactcaattccggtaagcaaatacaatccggacgcattgatgaccgatctgccaaaa < 5:813128‑M1/150‑130 (MQ=255) tGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtgaagagtatgcattgaatttgcctgctattgagacctatattggtcactcaattccggtaagcaaatacaatccggacgcattgatgaccgatctgccaaaacc < 8:705636‑M1/150‑132 (MQ=255) cGTACAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGGCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAAc < 7:1131116/151‑1 (MQ=255) tACAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCg > 3:1405100/1‑151 (MQ=255) aGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtgaagagtatgcattgaatttgcctgctattgagacctatattggtcactcaattccggtaagcaaatacaatccggacgcattgatgaccgatctgccaaaaccgctgcgcctc > 6:1745866‑M1/1‑10 (MQ=255) 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cgcAGGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTGCGCCTc > 8:391281/1‑151 (MQ=255) aGGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTGCGCCTCAcg > 5:708838/1‑151 (MQ=255) | GAATTTACCCGTGGCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTGCGCCTCACG > DH1/4549740‑4550039 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |