New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | DH1 | = 4549889 | 276 (0.570) | 268 (0.570) | 174/290 | 1.8 | 50.1% | coding (1050/1266 nt) | rhlB | ATP‑dependent RNA helicase RhlB |
? | DH1 | 4549896 = | 266 (0.560) | coding (1057/1266 nt) | rhlB | ATP‑dependent RNA helicase RhlB |
Only 100 of 309 total aligned reads displayed.
TTGATGAATTTACCCGTGGCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > DH1/4549735‑4549889 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTGCGCCTCACGCGCCCG > DH1/4549896‑4550045 TTGATGAATTTACCCGTGGCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCG > 6:787312/1‑151 TGATGAATTTACCCGTGGCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCG < 6:485248/150‑1 GATGAATTTACCCGTGGCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCG < 4:1879834/151‑1 ATGAATTTACCCGTGGCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGC < 1:89572/151‑1 TGAATTTACCCGTGGCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGC > 1:807649/1‑150 GAATTTACCCGTGGCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGC > 6:1545313/1‑149 GAATTTACCCGTGGCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGC > 7:1945572/1‑149 ATTTAACCGAGGCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCCGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCCTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAAGC > 2:240428/1‑151 TTACCCGTGGCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAAGCGG > 4:973662/1‑151 ACCCGTGGCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAAGCGGTC < 2:1780339/151‑1 CCGTGGCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAAGCGGTCAC > 7:1772898/1‑151 TGGCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAAGCGGTCACTCT > 7:1042123/1‑151 GGCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAAGCGGTCACTCT > 1:233112/1‑150 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3:1421430/151‑1 CGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTt > 8:615557/1‑150 TTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGA > 1:104436/1‑150 GCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATT < 1:554750/151‑1 GCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAAT < 3:537762/150‑1 GCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAAT < 2:1664211/150‑1 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> 2:1452697/1‑151 ACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGA < 6:853605/151‑1 GTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGAac > 8:1896927/1‑149 TTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTAAGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCT > 1:759438/1‑151 TCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTG > 6:745543/1‑151 TCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCT < 6:578980/150‑1 CCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCC > 6:661898/1‑150 CGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCA > 2:129539/1‑150 GTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAA < 1:376673/151‑1 GTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAA > 4:87198/1‑150 TATTGGTCGTACAGGTCGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAA > 4:1347425/1‑150 ATTGGTCGTACAGGTCGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAA < 5:813128/150‑1 ATTGGACGTACAGGTCGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTCAATTTGCCTGCTATAGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAAC < 2:1036273/151‑1 TGGTCGTACAGGTCGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACC < 8:705636/150‑1 TGGTCGTACAGGTCGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACC < 5:26345/150‑1 GTACAGGTCGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTGCG > 2:939959/1‑151 CAGGTCGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTGCGCCT < 4:560738/151‑1 CAGGTCGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTGCGCCT < 4:447455/151‑1 AGGTCGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTGCGCCTC > 5:1337645/1‑151 GTCGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTGCGCCTCAC > 4:401802/1‑151 GCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTGCGCCTCACGCG < 5:584605/151‑1 CGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATCTTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCTCTGCGCCTCACGCGC < 4:1696576/151‑1 GCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTGCGCCTCACGCGCC > 6:1643191/1‑151 CAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTGCGCCTCACGCGCCC > 7:1156417/1‑151 CAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTGCGCCTCACGCGCCC < 1:1280565/151‑1 AAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTGCGCCTCACGCGCCCG > 5:495220/1‑151 AAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTGCGCCTCACGCGCCCG > 4:698742/1‑151 TTGATGAATTTACCCGTGGCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > DH1/4549735‑4549889 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTGCGCCTCACGCGCCCG > DH1/4549896‑4550045 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |