| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 4,188,484 | Δ27 bp | 100% | coding (3136‑3162/4224 nt) | rpoC → | RNA polymerase, beta prime subunit |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 4188484 | 4188510 | 27 | 74 [0] | [0] 73 | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4188483 | 0 (0.000) | 66 (1.320) | 55/268 | NT | 100% | coding (3135/4224 nt) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| ? | NC_000913 | 4188511 = | 0 (0.000) | coding (3163/4224 nt) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit | |||||
ATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTA > NC_000913/4188368‑4188658 | cttacggtgcggtactggcgaaaggcgatggcgaacaggttgaaggcgtcgtagccgttgtaaactgggacccgcacaccctgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttccttacctgaccgacggccagaccGgtctg > 2:152592‑M2/144‑149 (MQ=255) gtccgttacttgcgaaaggcgatggcgaacaggttgctggcggcgaaacagttgcaaactggcacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgatatgatctacggccagaccGGTCTGTCTTCg < 2:627749‑M2/12‑1 (MQ=255) tgcggtactggcgaaaggcgatggcgaacaggttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgccggccagaccGGTCTGTCTTCGc < 2:336656‑M2/13‑1 (MQ=255) tgcggtactggcgaaaggcgatggcgaacaggttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGc < 2:815568‑M2/13‑1 (MQ=255) tactggcgaaaggcgatggcgaacgggttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCtggtg < 2:319910‑M2/18‑1 (MQ=255) tggcgaaaggcgatggcgaacaggttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggcccggccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGtt > 1:237877‑M2/129‑149 (MQ=255) tggcgaaaggcgatggcgaacaggttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGtt > 1:719768‑M2/129‑149 (MQ=255) ggcgaatggcggtggggaacaggttgcgggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTc < 2:24197‑M2/22‑1 (MQ=255) 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ggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCCCATGGTAACGACGTTCTGATACCCGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCt > 1:122799‑M2/10‑149 (MQ=255) ccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGc < 1:862495‑M2/142‑1 (MQ=255) ccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGGAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGAACCGGTATGCCCGCGCAGAACTTACTGc > 2:799436‑M2/8‑149 (MQ=255) gaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTACAGATCTGCGTCCGGCCCTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTAACGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCgg > 2:229857‑M2/5‑149 (MQ=255) cGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTGACGACGTTCTGATCCCAGGTAGCGATGTGCCAGCGCGTGACTTCCTGCCGGGTa > 2:712568‑M2/2‑149 (MQ=255) | ATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTA > NC_000913/4188368‑4188658 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |