New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 3845530 = | 47 (0.780) | 58 (1.030) | 51/262 | 0.1 | 57.2% | coding (1568/1767 nt) | adeD | cryptic adenine deaminase |
? | NC_000913 | = 3992759 | 43 (0.760) | coding (1608/2547 nt) | cyaA | adenylate cyclase |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
ATAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTGGATGTCTTCAGCTTTG > NC_000913/3992617‑3992901 | atcaaCCGGTGGCGTGGGCTCGGTTTAACGGCCTGCCGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGCTAACGGCCTTGTCCATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCt < 2:37751/140‑1 (MQ=255) tAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTGTGTATATTAGAGGTAACGGCCTTCTCGATGTGCCTGGGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCGCCACTTCCCGCGGCGCTTACCTg < 1:511677‑M2/143‑2 (MQ=255) cacccggtggcgtggGCATGCTTTAACGGCCTGTTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgc > 1:361744‑M2/6‑141 (MQ=255) aaaCTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgc < 2:699584‑M2/143‑3 (MQ=255) aaCTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTAAATTAAAGGTAACAGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTGCCCGCTGCGCTTACCTgca < 2:180904‑M2/143‑4 (MQ=255) aCTGGTGGCGTGGGCATGGTGTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcac > 2:959436‑M2/1‑139 (MQ=255) tggtggCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAACGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGCGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCCTTTCCCCCTGCGCTTCCCTgcgccg < 1:662571‑M2/143‑7 (MQ=255) gtggCGTGGGCATGATTTATCGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcgccgac < 1:872586‑M2/143‑9 (MQ=255) gCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGGTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgccacg < 1:1032055‑M2/143‑12 (MQ=255) cGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATACTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacgg > 2:327872‑M2/1‑131 (MQ=255) ggCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgca > 2:785556‑M2/1‑127 (MQ=255) gCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgccg < 2:278621‑M2/143‑18 (MQ=255) gCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcag < 2:333390‑M2/143‑18 (MQ=255) aTGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgccgtc < 1:669829‑M2/143‑20 (MQ=255) gTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTATGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGACGACGACGTGTCGCACCATTTCCCGCCGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcacgccct < 1:78382‑M2/143‑23 (MQ=255) tttAACGGCCTGCTGACGTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtagctg < 1:585296‑M2/143‑24 (MQ=255) tttAACGGCCTGCTGACCTCACGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTa > 2:167149/1‑143 (MQ=255) tttAACGGCCTGCGGACCTCGCGCACCCTTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctg > 2:618562‑M2/1‑120 (MQ=255) aCGGCCTGCTGTCCTCGCGCACCCGTCCATATCTTATTGTTTACGGCATTCTCGATTTGCCTCAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGCCGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGc < 2:536743/143‑1 (MQ=255) 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> 1:531694/1‑143 (MQ=255) tCGCGCACCCGATTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTCGCAGGAGACCCCCGCCGGGGTGTCGGACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGGGGTCCg > 2:151114/1‑143 (MQ=255) gcgcACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgcctt < 2:105948‑M2/143‑44 (MQ=255) ccGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTAGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagc < 1:242891‑M2/143‑50 (MQ=255) ccGGTTGTATATGAACGGGGACGGCATTGTCGATTTGCCTATGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATGTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgtgagc > 1:184806‑M2/1‑94 (MQ=255) ggTTTGTAGATTGAGGGTAGCGGCATTGTCGATTGGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCAGTGCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGc < 1:266691/142‑1 (MQ=255) cGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagcc > 1:1064205‑M2/1‑93 (MQ=255) gTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAGGTTGCAGGGGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccg < 2:835275‑M2/143‑52 (MQ=255) gTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCg < 2:849033/143‑1 (MQ=255) gcgatatggaAGGGGACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccg > 1:563421‑M2/4‑89 (MQ=255) atatTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTGGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgccc > 2:603171‑M2/1‑86 (MQ=255) tatTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccg < 2:733384‑M2/143‑59 (MQ=255) ttAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGtt < 2:275633/143‑1 (MQ=255) gtAAAGGTAACGGCAGGGTCGGTGGGCCTAAGGGGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGtt < 2:256186/142‑1 (MQ=255) tAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTGCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgccgccttgaaagccgccgcccgggg < 1:677918‑M2/143‑62 (MQ=255) tAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtga < 1:964013‑M2/143‑62 (MQ=255) 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gCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCGGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGCTTATAGTTAACCTGGAATATGAGCAGAACGCGGCGTTGCGCAATCAGGTGGTGCAtctggtgtacc > 2:215259/1‑133 (MQ=255) gCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTcc < 2:973243/143‑1 (MQ=255) cACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagatggcgtttctttctctgccagtg < 1:36191‑M2/143‑120 (MQ=255) cACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCg > 2:650611/1‑143 (MQ=255) ccATTTCCCGCTGCGCGTACCTgcaccgggacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagatggcgtttctttctctgccagtgat > 1:77722‑M2/1‑22 (MQ=255) tttCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgcgcagattattcagatggcattaggtcctctgccagtgatccc < 1:257776‑M2/143‑125 (MQ=255) tttCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagacggcgtttccttctctgccagtgatccc < 1:257788‑M2/143‑125 (MQ=255) tttCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGGCTGTGGTGTTCCCCAACCAGGCGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGc > 1:748108/1‑143 (MQ=255) ttCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaagaaattgacgccttgaaagccgccgcgcgtgaatgcggtccggtacccgatgagccgtttattcagatggcgtatctttctctgtcagtggtccgc < 2:75074‑M2/143‑126 (MQ=255) gctgCTGTGGTTACCGGCGCCGACACCGAAGGCGGTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATTAGCCGGCAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTgg < 1:456055/140‑1 (MQ=255) cccGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGCCGGCGCGCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGACTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATCTCCGTAAGCTgg > 1:760558/1‑143 (MQ=255) cccGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGCATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGCTTTCCGTAAGCTgg > 2:900079/1‑143 (MQ=255) ccGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTGGa < 1:655317/143‑1 (MQ=255) ggcgctTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagatggcgtttctttctctgccagtgatccccgcgctaa > 2:669829‑M2/2‑11 (MQ=255) cgcTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgccgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagatggcgtttctttctctgccagtgatccccgcgctaaaa > 2:153181‑M2/1‑9 (MQ=255) cgcTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcaggtggcgtttctttctctgccagtgatcgccgcgctaaaa < 2:960204‑M2/143‑135 (MQ=255) ttACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagctggcgtttctttctctgccagtgatccccgcgctaaaacta < 2:1007817‑M2/143‑138 (MQ=255) ttACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTGGATGTCTTCAg > 1:670961/1‑143 (MQ=255) ttcctggaccggcgcggcgcagtcgctgggggcacacattgacgccttgacagccgccgcccgtggatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagatggcgtttctttctctgccagtgatccccgcgctaaaactaa > 1:180904‑M2/3‑5 (MQ=255) cTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccggtacccgatgagccgtttattcagatggcgtttctttctctgccagtgatccccgcgctaaaactaacca < 1:996888‑M2/143‑142 (MQ=255) cTgcaccgaaacggcgcagtcgctggcggaaaaaattgccgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagatggcgtttctttctctgccagtgatccccgcgctaaaactaacca > 2:2383‑M2/1‑2 (MQ=255) tGCACCGGCCCCGGCGGCGGTCTGCCGCCCGGGTGAGATCGGCCATCTGGCGATTATCGTTAGCCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTGCCGCAATCCGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTGGATGTCTTCAGCTTTg < 2:848122/143‑1 (MQ=255) tGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTGGATGTCTTCAGCTTTg < 2:431823/143‑1 (MQ=255) | ATAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTGGATGTCTTCAGCTTTG > NC_000913/3992617‑3992901 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |