| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 3992759 | 43 (0.760) | coding (1608/2547 nt) | cyaA | adenylate cyclase | |||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
CATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTAACCAGT > NC_000913/3845388‑3845672 | taaactggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctg < 2:1064205‑M1/1‑1 (MQ=255)taaactggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcgcgcacccgtgtgtatattagaggtaacggccttctcgatgtgcctgggttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcgccacttcccgcggcgcttacctg < 1:511677‑M1/1‑1 (MQ=255)cATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCGGGGCAGATGAg > 2:138858/1‑143 (MQ=255)cATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAg > 2:523513/1‑143 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caccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTg < 1:36191‑M1/119‑1 (MQ=255) gTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGACGTTTCTTTCTCTGCCCGtca > 2:1047399/1‑141 (MQ=255) ccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGAC‑CCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATc > 1:672857‑M1/23‑143 (MQ=255) ccatttcccgctgcgcgtacctGCACCGGGACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGAt > 1:77722‑M1/23‑143 (MQ=255) tttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGCGCAGATTATTCAGATGGCATTAGGTCCTCTGCCAGTGATccc < 1:257776‑M1/124‑1 (MQ=255) tttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGACGGCGTTTCCTTCTCTGCCAGTGATccc < 1:257788‑M1/124‑1 (MQ=255) ttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTCCTCCAGATGGCGCCTCCTTCTCTCCCCCTGCTcccc < 1:186896‑M1/125‑1 (MQ=255) ccATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTTAATGCGGCCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATcccc > 2:10248/1‑143 (MQ=255) ggcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTaa > 2:669829‑M1/12‑143 (MQ=255) gggCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGACCCTTATTCGTATGGGGTTTCTTTCGCGGCCAGTGATCCCCCCGCTaca > 2:662913/1‑141 (MQ=255) cgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGCCGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTaaaa > 2:153181‑M1/10‑143 (MQ=255) cgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGGTGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCGCCGCGCTaaaa < 2:960204‑M1/134‑1 (MQ=255) ttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGCTGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTa < 2:1007817‑M1/137‑1 (MQ=255) acgaGCCCCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTAAc < 2:439113/141‑1 (MQ=255) ctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGGTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTAACCa < 1:996888‑M1/141‑1 (MQ=255) ctGCACCGAAACGGCGCAGTCGCTGGCGGAAAAAATTGCCGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTAACCa > 2:2383‑M1/3‑143 (MQ=255) GCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTAGTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGGTCGGCGCGCTAAAACTAACCagg < 2:225437‑M1/143‑2 (MQ=255) | CATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTAACCAGT > NC_000913/3845388‑3845672 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |