| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | CP009273 | 3,676,833 | Δ3 bp | intergenic (‑26/+155) | dctA ← / ← yhjK | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter/cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3676832 | 3 (0.040) | 70 (0.930) | 62/296 | 0.1 | 95.9% | intergenic (‑25/+158) | dctA/yhjK | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter/cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase |
| ? | CP009273 | 3676836 = | 3 (0.040) | intergenic (‑29/+154) | dctA/yhjK | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter/cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase | |||||
TCGCCAAGCGGTTTCATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTT > CP009273/3676692‑3676981 | ccgtcgccaagcggtttcatttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTa > 2:1107116‑M2/145‑149 (MQ=255) cgtcgccaagcggtttcatttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtggcctttagtaaaaccacagTTGTaa > 1:934059‑M2/144‑149 (MQ=255) gtcgccaagcggtttcatttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaaccgagaggttttcatagggtgtactttagtaaaaccacagTTGtaaa > 1:241609‑M2/143‑148 (MQ=255) gtcgccaagcggtttcatttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAg < 2:1155155‑M2/7‑1 (MQ=255) gtcgccaagcggtttcatttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggtattcataaggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAg > 1:972607‑M2/143‑149 (MQ=255) caagcggtttcatttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTAt > 1:486617‑M2/138‑149 (MQ=255) aagcggtttcatttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcctggaggttcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATg > 2:941601‑M2/137‑149 (MQ=255) aagcagtttcatttgctcgcctatttcaggatggaaatggccaaggtgaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtacaggcttttaaacagagaggtttttataaggggtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATg < 1:243873‑M2/13‑1 (MQ=255) tttcatttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTAc > 1:1199746‑M2/131‑149 (MQ=255) tcgcctatttcaggatagaaatggccaaggcgatcaacaaagtctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCtt > 2:597317‑M2/121‑149 (MQ=255) tcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtgaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCtt > 1:296469‑M2/121‑149 (MQ=255) gcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTaa < 2:1069530‑M2/31‑1 (MQ=255) cctatttcatgagagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTaaa < 1:1064028‑M2/32‑1 (MQ=255) cctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTaaa < 1:1018681‑M2/32‑1 (MQ=255) tattccaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAAt < 2:412514‑M2/34‑1 (MQ=255) tttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATaa > 2:1050335‑M2/114‑149 (MQ=255) aGGATAAAAATGGCCAAGGAGAATAACAATGGCTATCGCTGTAAGGAACTGAAAGTAAAGGCATTTAAACAGAGAGGTTTTCATAAGGTGTCCTTTAGTACAACAACA‑‑‑ATTGTAAGGTCATGGGGTACCCGCGGCATAAAAATaaacca > 1:927151/1‑145 (MQ=255) tcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAaca > 1:784025‑M2/112‑149 (MQ=255) aggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACAcc < 1:927344‑M2/40‑1 (MQ=255) aggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctggcaggacctgaaaggaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACAcc < 1:649009‑M2/40‑1 (MQ=255) gatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCa < 2:836781‑M2/42‑1 (MQ=255) tagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGa > 2:1156014‑M2/106‑149 (MQ=255) aaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGacaa > 1:640698‑M2/103‑149 (MQ=255) aaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGacaa > 1:716209‑M2/103‑149 (MQ=255) atggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAATGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGacaaca < 1:809401‑M2/49‑1 (MQ=255) tggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGGTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACAt > 2:275947‑M2/100‑149 (MQ=255) gccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATca > 1:773462‑M2/98‑149 (MQ=255) ccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATcac > 1:391069‑M2/97‑149 (MQ=255) caaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATcaca > 2:970743‑M2/96‑149 (MQ=255) ggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGaa > 1:758360‑M2/93‑149 (MQ=255) agaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAAt < 2:1116960‑M2/59‑1 (MQ=255) gaataccaatggctatcgctggcgggaccttaaagtaaaggcttttaaacagagagggtttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCGGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATg > 1:596987‑M2/90‑149 (MQ=255) accaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAAAAACAAGACAACATCACAGGAATGTAcc > 1:1146632‑M2/86‑149 (MQ=255) ccaatggttatcgctggcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCt < 1:639280‑M2/65‑1 (MQ=255) caatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTg > 2:985815‑M2/84‑149 (MQ=255) tggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGAt < 1:131707‑M2/69‑1 (MQ=255) tATCGCTGTCAAGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAAGTTTTCATCGGGTGTACTATAGTACCACCAAAG‑‑‑AAGTAAGGTACTGGAGTACCGGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAAAAGCACCGAAATGTCCCTGGATCaaa > 1:314187/1‑147 (MQ=255) tatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATa > 2:98926‑M2/77‑149 (MQ=255) cgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAAtt > 2:1022377‑M2/74‑149 (MQ=255) cgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAAtt < 1:407699‑M2/76‑1 (MQ=255) cgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAAtt < 1:66751‑M2/76‑1 (MQ=255) aggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACaa > 2:707368‑M2/67‑149 (MQ=255) ggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACaaa > 2:1043806‑M2/66‑149 (MQ=255) gacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTGCCTGGATCATAATTGAAACaaaa > 1:930179‑M2/65‑149 (MQ=255) acctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACaaaaa < 2:251029‑M2/86‑1 (MQ=255) cctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcacagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAg < 2:16360‑M2/87‑1 (MQ=255) taaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTaaaaa < 1:325875‑M2/95‑1 (MQ=255) aaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgacctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTAACTGTGGCCGTAAAATAACCCCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGt > 1:353656‑M2/53‑149 (MQ=255) ttttAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGT‑‑‑ACCACACCAGATGCAAGGTTAAGGGGTGACTGCGGTAATAAAAACAGACACAGCCGCCAAAACACATATGGACCTGGATCATACGCTAAACAAAAAGGTAAAAAAGTTTGAg > 1:107075/1‑149 (MQ=255) gcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTg > 2:1219595‑M2/50‑149 (MQ=255) ttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACATCCTCACGGAACGGTCCCTGTATCATAATTGAACCAAAAAGGTTAAAAAGTTTAAg > 1:859272‑M2/48‑149 (MQ=255) cagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTc > 2:544734‑M2/41‑149 (MQ=255) agagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAAACAAAAGAGTAAAGAGTTTGACCTGGcgcg > 1:307769‑M2/40‑149 (MQ=255) agaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGca < 1:1189376‑M2/112‑1 (MQ=255) gttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACATAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCCCGCACaaa < 2:893310‑M2/116‑1 (MQ=255) gttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCAaaaa > 1:604903‑M2/34‑149 (MQ=255) ttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCGAGCCCAAAc > 2:1103245‑M2/33‑149 (MQ=255) ttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAATAGGTTCAAAACTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCa < 2:676057‑M2/119‑1 (MQ=255) ttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCa < 1:54397‑M2/119‑1 (MQ=255) ttatagggtctcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTTGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAACGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAg < 1:864341‑M2/120‑1 (MQ=255) atagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTAGATGCGTCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTAAGCTGACTCGCACAAAccacca > 1:1112307‑M2/28‑149 (MQ=255) atagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCa < 2:1199746‑M2/122‑1 (MQ=255) gtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTAAAACAAAAAGGTTAAAAAGATTGAGCTGGCTCGCACAAACAAGCACtttt > 1:999935‑M2/23‑149 (MQ=255) gtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTa < 2:486617‑M2/129‑1 (MQ=255) gtccttcagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTa < 1:93634‑M2/129‑1 (MQ=255) cctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACCAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTaaa < 2:292941‑M2/131‑1 (MQ=255) tttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTGAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCGCAAACCAGCACTTTTTAAAGt > 2:246324‑M2/17‑149 (MQ=255) agtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGtttt > 2:17606‑M2/14‑149 (MQ=255) agtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTAAAAAAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGtttt < 1:916724‑M2/136‑1 (MQ=255) aaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTa > 2:422949‑M2/11‑149 (MQ=255) cacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAg > 2:832754‑M2/6‑149 (MQ=255) acagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAAAATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGt < 1:942753‑M2/145‑1 (MQ=255) cagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGtt < 1:1107116‑M2/146‑1 (MQ=255) | TCGCCAAGCGGTTTCATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTT > CP009273/3676692‑3676981 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |