| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4260142 | 173 (2.200) | 4 (0.050) | 4/240 | NT | 2.3% | intergenic (‑139/‑179) | zur/yjbL | transcriptional repressor, Zn(II)‑binding/uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | = 4260147 | 179 (2.390) | intergenic (‑144/‑174) | zur/yjbL | transcriptional repressor, Zn(II)‑binding/uncharacterized protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
CATCGGGCACCTCAAAGTGGGGGTTAAGAATGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGTTTAAACGCATACCTGTAGTTCAGAAATTATGAGCGATTTTTGATAGTGACCAGATGGCAAAAGAATTATAAGGAGGACAC > NC_000913/4260001‑4260294 | cATCGGGCACCTCAAAGTGGGGGTTAAGAATGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCTTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACga > 1:30662‑M2/1‑147 (MQ=255)aatCGGGCCCCTCAAAGTGGGGGTTAAGAATGGCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACga > 6:164773‑M2/2‑147 (MQ=255) tCGGGCACCTCAAAGTGGGGGTTAAGAATGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACgata > 6:88500‑M2/1‑145 (MQ=255) gCACCTCAAAGTGGGGGTTAAGAATGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGAtaataa < 5:358771/149‑1 (MQ=255) gCACCTCAAAGTGGGGGTTAAGAATGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGAtaataa < 7:205675/149‑1 (MQ=255) ccTCAAAGTGGGGGTTAAGAATGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGAtaataatta < 2:120191/149‑1 (MQ=255) cTCAAAGTGGGGGTTAAGAATGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGAtaataattaa > 2:9428/1‑149 (MQ=255) cTCAAAGTGGGGGTTAAGAATGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGAtaataattaa > 2:176448/1‑149 (MQ=255) tCAAAGTGGGGGTTAAGAATGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGAtaataa < 2:5641/144‑1 (MQ=255) aaaGTGGGGGTTAAGAATGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGAtaaaaattaat < 6:261654/147‑1 (MQ=255) gTGGGGGTTAAGAATGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATaataattaataatt > 4:12781/1‑148 (MQ=255) ggTTAAGAATGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCACCACGATAATAATTAATAATTCAtttt < 1:220947/149‑1 (MQ=255) gTTAAGAATGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGAtaataa > 5:72229/1‑133 (MQ=255) ttAAGAATGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGGAACGGGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTta < 5:111835/149‑1 (MQ=255) aGAATGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGATATGTTGCCTTGTCGTACCAATATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTtaaat < 3:187579/149‑1 (MQ=255) aGAATGTCCTTACATTACAATGTTACAGGAAAAACACCGAGAAACCTTATTGTAGCCGTAATGTTGAATTTCTGTTTAGAACGTAAGGTGTTATGTAGCATTGTCGTACCATAATCAACACGAtaataattaa > 1:179271/1‑133 (MQ=255) aaTGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTtaaata > 6:69329/1‑148 (MQ=255) aTGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTtaaataaa > 2:137669/1‑149 (MQ=255) aTGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTtaaataaa < 3:12781/149‑1 (MQ=255) tGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTaaataaat > 7:162215/1‑149 (MQ=255) cTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCAttt > 4:279408/1‑135 (MQ=255) cTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCt > 8:266630/1‑149 (MQ=255) cTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCt > 2:286712/1‑149 (MQ=255) cTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCt > 4:72441/1‑149 (MQ=255) aCTTTACCATGTTCCAGGAATAACTCCGAGTCCCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGTTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTAACATTATCATCTCGATAATAATTTATATTTCATTTTTTAATATATTGCTTc < 4:224722/148‑1 (MQ=255) aCTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCtt < 7:100356/147‑1 (MQ=255) cTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCaa < 3:72441/149‑1 (MQ=255) tttACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTtaaa < 3:11917/135‑1 (MQ=255) tttACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAg > 4:52123/1‑149 (MQ=255) tttACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAg > 6:373229/1‑149 (MQ=255) cATGTTCCAGGATAAACACCGATAACAATTATTGTTTCCGTAATGTTGATTTTATGTTTTGTCTGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTAACATTATAAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTaaataaat < 5:254110/135‑1 (MQ=255) cATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAAc > 1:210296/1‑149 (MQ=255) cATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAAc > 3:86414/1‑149 (MQ=255) aGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCtatt < 1:286712/149‑1 (MQ=255) aGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCACtatt > 5:304757/1‑149 (MQ=255) ggAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCtattt < 8:161441/149‑1 (MQ=255) gAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCtattta > 3:196257/1‑149 (MQ=255) acacacCGAGAACCCTTCTTGTTGCAGTAATGTTTATTTTATGTTTTGTAGGTATGGGGTTATGTTGCCTTGTCGTTCCATTATCAAGTCGATAAAATTTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTatttattt < 4:153561/147‑1 (MQ=255) aaaCACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCtatttatt > 5:239146/1‑148 (MQ=255) cGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTgg < 1:9428/149‑1 (MQ=255) agaACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGt > 3:332140/1‑149 (MQ=255) agaACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGt < 8:16424/149‑1 (MQ=255) ccTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGTTTaaa > 8:331369/1‑149 (MQ=255) cTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGTTTAAAc < 4:86414/149‑1 (MQ=255) aTTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGTTTAAACGCa > 1:13644/1‑149 (MQ=255) ccGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGTTTAAACGCATACCTg < 8:369045/148‑1 (MQ=255) cGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGTTTAAACGCATACCTGTa < 4:196257/149‑1 (MQ=255) cGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGTTTAAACGCATACCTGTa < 8:100242/149‑1 (MQ=255) 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ccATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTCCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGTTTAAACGCATACCTGTAGTTCAGAAATTATGa > 5:97871/1‑112 (MQ=255) ccATTATAAACAAGATAATAATTAATAATTAATTTTTAAATAAATCGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGTTTAAACGCATACCTGTAGTTCAGAAATTATGAGCGATTTTTGATAGTGACCAGATGGCAAAAGAATtat < 1:162138/149‑1 (MQ=255) cATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGTTTAAACGCATACCTGTAGtt < 8:20114/99‑1 (MQ=255) cATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGTTTAAACGCATACCTGTAGTTCAGAAATTATGAGCGATTTTTGATAGTGACCAGATGGCAAAAGAATtat > 7:312397/1‑148 (MQ=255) cATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGTTTAAACGCATACCTGTAGTTCAGAAATTATGAGCGATTTTTGATAGTGACCAGATGGCAAAAGAATtat > 4:26336/1‑148 (MQ=255) cATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGTTTAAACGCATACCTGTAGTTCAGAAATTATGAGCGATTTTTGATAGTGACCAGATGGCAAAAGAATtat > 6:220066/1‑148 (MQ=255) aTTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGTTTAAACGCATACCTGTAGTTCAGAAATTATGAGCGATTTTTGATAGTGACCAGATGGCAAAAGaa > 6:139078/1‑143 (MQ=255) aTTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGTTTAAACGCATACCTGTAGTTCAGAAATTATGAGCGATTTTTGATAGTGACCAGATGGCAAAAGAATTATaa < 2:75599/149‑1 (MQ=255) ttATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGt < 8:356079/77‑1 (MQ=255) tCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGTTTAAACGCATACCTGTAGTTCAGAAATTATGAGCGATTTTTGATAGTGACCAGATGGCAAAAGAATTATAaggag < 1:267932/149‑1 (MQ=255) tCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGTTTAAACGCATACCTGTAGTTCAGAAATTATGAGCGATTTTTGATAGTGACCAGATGGCAAAAGAATTATAagga < 2:237524/148‑1 (MQ=255) tCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGTTTAAACGCATACCTGTAGTTCAGAAATTATGAGCGATTTTTGATAGTGACCAGATGGCAAAAGAATTATAagga < 7:173041/148‑1 (MQ=255) tCAAAACTATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGTGTTTAAACGCATACCTGTAGTTCAGAAATTATGAGCGATTTTTGATAGTGACCAGATGGCAAAAGAATTATAagga < 8:268485/148‑1 (MQ=255) acacGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGTTTAAACGCATACCTGTAGTTCAGAAATTATGAGCGATTTTTGATAGTGACCAGATGGCAAAAGAATTATAAggagga > 4:185920/1‑148 (MQ=255) cGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGTTTAAACGCATACCTGTAGTTCAGAAATTATGAGCGATTTTTGATa > 7:82418/1‑113 (MQ=255) cGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGTTTAAACGCATACCTGTAGTTCAGAAATTATGAGCGATTTTTGATa < 8:82418/113‑1 (MQ=255) | CATCGGGCACCTCAAAGTGGGGGTTAAGAATGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGTTTAAACGCATACCTGTAGTTCAGAAATTATGAGCGATTTTTGATAGTGACCAGATGGCAAAAGAATTATAAGGAGGACAC > NC_000913/4260001‑4260294 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |