| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4165491 = | 123 (1.250) | 5 (0.050) | 5/264 | 11.1 | 4.0% | coding (64/858 nt) | murI | glutamate racemase |
| ? | NC_000913 | 4165527 = | 122 (1.300) | coding (100/858 nt) | murI | glutamate racemase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
GTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCACCGCGGTGCAAGAACGTTA > NC_000913/4165379‑4165675 | gTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGt > 1:103551/1‑149 (MQ=255) ttCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGtt > 3:183029/1‑149 (MQ=255) tGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCATGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCCTGCTGGTGTTTTACTCCCGCGTCGGAGGGTTGTCg > 6:6439/1‑149 (MQ=255) ggTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCgg > 2:114720/1‑149 (MQ=255) tAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTc > 6:240731/1‑149 (MQ=255) tAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTc > 3:5188/1‑149 (MQ=255) aaaaTAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTc > 3:201032/1‑148 (MQ=255) aaTAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTAt > 7:389466/1‑149 (MQ=255) aaTAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTAt < 5:341100/149‑1 (MQ=255) aTAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATg < 8:389466/149‑1 (MQ=255) ccAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTAt > 7:210683/1‑144 (MQ=255) ccAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTAt < 8:210683/144‑1 (MQ=255) ccAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGAc > 4:185034/1‑147 (MQ=255) tGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGTTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCg > 4:146809/1‑149 (MQ=255) ttCGACAAAGATTATGATAACGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGTGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTCTGACGAGATCCgg < 6:208093/148‑1 (MQ=255) ttCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCgg > 3:238777/1‑148 (MQ=255) ttCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCgg > 2:59118/1‑148 (MQ=255) ttCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCg < 2:103551/147‑1 (MQ=255) ccaaGATTATGATCCAGTCAATGGCTACCAACCTGCAGGCCGTGAATACAGCTTGTCTGGCCTCTACCCATTCTGAAACACGTAACACCTTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCTGTGGTTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCAtatc < 1:319820/147‑1 (MQ=255) ctagtttATGAGACTGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGTCGGGAATACTCCTTGGCTGGCAGCGAAACGTTCTGAAGCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGTTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATctct < 5:6439/144‑1 (MQ=255) aaaGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGATTACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATctct > 4:263215/1‑149 (MQ=255) aaaGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTa > 3:64175/1‑129 (MQ=255) aaaGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTa < 4:64175/129‑1 (MQ=255) aaaGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATctct > 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aCAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGAtctc > 8:261144/1‑148 (MQ=255) aCAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTcc < 8:123629/149‑1 (MQ=255) cAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGGGTTTGACTCCGGCGGCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCa < 3:246/149‑1 (MQ=255) aGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCgg < 7:238387/128‑1 (MQ=255) gTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCAtt < 3:185034/149‑1 (MQ=255) tCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCCCCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTa < 1:238536/149‑1 (MQ=255) tATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACa > 5:66861/1‑149 (MQ=255) aTGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACAt > 8:420512/1‑149 (MQ=255) tACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATg > 7:273069/1‑149 (MQ=255) ccAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCt > 5:117980/1‑149 (MQ=255) 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cTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTAt > 5:368813/1‑149 (MQ=255) ttGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATg > 2:177489/1‑149 (MQ=255) gTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTTTCTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATg < 7:128012/147‑1 (MQ=255) gCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGaaa < 7:261144/148‑1 (MQ=255) aGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGaaaaaa < 1:183264/149‑1 (MQ=255) 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6:117980/149‑1 (MQ=255) tCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGc < 8:421561/149‑1 (MQ=255) ccACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTAt < 2:301687/139‑1 (MQ=255) aCCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAgt > 3:312502/1‑149 (MQ=255) tGCTGGTGTTTGACTCCGGCGGCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAgtggtg < 1:418699/149‑1 (MQ=255) tGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACCTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGc > 7:302851/1‑148 (MQ=255) ggTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACAttt < 7:266721/77‑1 (MQ=255) ggTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACAttt > 8:266721/1‑77 (MQ=255) ggTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCaa > 4:241220/1‑149 (MQ=255) ggTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCaa > 2:360856/1‑149 (MQ=255) gtgtTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAAt < 7:172987/149‑1 (MQ=255) gtgtTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAAt > 4:187500/1‑149 (MQ=255) gtgtTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAAt > 6:92301/1‑149 (MQ=255) tgtTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAAtt < 3:241220/149‑1 (MQ=255) tgtTTGACTCCGGCGGCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCAATTACATTTATGCTTTCGATAACGGCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAAtt < 7:306237/149‑1 (MQ=255) tttGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGACGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGt > 2:325390/1‑149 (MQ=255) tCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAAtt > 5:211893/1‑141 (MQ=255) tCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAAtt < 6:211893/141‑1 (MQ=255) tCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCACcgc > 2:174890/1‑149 (MQ=255) cGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCACCGCgg < 7:128999/149‑1 (MQ=255) ggCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCACCGCGGt < 4:304761/149‑1 (MQ=255) ggCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCACCGCGGt < 5:320496/149‑1 (MQ=255) gggTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAg > 4:285305/1‑118 (MQ=255) gTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCACCGCGGTGCAAGAACGtt < 1:148122/149‑1 (MQ=255) | GTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCACCGCGGTGCAAGAACGTTA > NC_000913/4165379‑4165675 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |