New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 4165491 = | 123 (1.250) | 5 (0.050) | 5/264 | 11.1 | 4.0% | coding (64/858 nt) | murI | glutamate racemase |
? | NC_000913 | 4165527 = | 122 (1.300) | coding (100/858 nt) | murI | glutamate racemase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
CGTATCCGGTCACCTCTCACCTGACAGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGC > NC_000913/4165353‑4165638 | cGTATCCGGTCACCTCTCACCTGACAGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCt > 3:94235/1‑149 (MQ=255) gTATCCGGTCACCTCTCACCTGACAGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTg < 4:94235/149‑1 (MQ=255) tATCCGGTCACCTCTCACCTGACAGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCCCCGTGCTgg > 2:238536/1‑149 (MQ=255) tATCCGGTCACCTCTCACCTGACAGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTgg > 7:69361/1‑149 (MQ=255) aTCCGGTCACCTCTCACCTGACAGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGgt > 6:341100/1‑149 (MQ=255) cGGTCACCTCTCACCTGACAGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGtt > 4:246/1‑149 (MQ=255) ggTCACCTCTCACCTGACAGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGttt < 2:266203/149‑1 (MQ=255) gTCACCTCTCACCTGACAGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCa > 3:124653/1‑134 (MQ=255) gTCACCTCTCACCTGACAGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCa < 4:124653/134‑1 (MQ=255) ctctCACCTGACAGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCCCCGTGCTGGTGTTTGACTcc > 8:128999/1‑149 (MQ=255) ctctCACCTGACAGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTcc > 7:146871/1‑149 (MQ=255) ctctCACCTGACAGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTcc > 3:289966/1‑149 (MQ=255) ctcACCTGACAGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGagttatc > 7:413091/1‑143 (MQ=255) tcACCTGACAGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGttt < 6:102512/140‑1 (MQ=255) aCCTGACAGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGt > 8:147907/1‑149 (MQ=255) aCCTGACAGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGAGTTTGACTCCGGCGt < 4:278995/149‑1 (MQ=255) aCAGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTAACAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCgtgg > 7:335776/1‑146 (MQ=255) cAGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACCCCTTCTGATCCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTgg < 3:217485/149‑1 (MQ=255) aGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTggg < 8:146871/149‑1 (MQ=255) 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ccAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGAc > 4:185034/1‑147 (MQ=255) tGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGTTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCg > 4:146809/1‑149 (MQ=255) ttCGACAAAGATTATGATAACGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGTGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTCTGACGAGATCCgg < 6:208093/148‑1 (MQ=255) ttCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCgg > 3:238777/1‑148 (MQ=255) ttCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCgg > 2:59118/1‑148 (MQ=255) 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acacCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAaagcg > 1:31314/1‑148 (MQ=255) cacCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAaagcg < 8:69361/147‑1 (MQ=255) cacCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAaagcg < 7:420512/147‑1 (MQ=255) acCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAaagcgaag > 1:380644/1‑149 (MQ=255) ccTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCTGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGaaaaaa < 1:265754/142‑1 (MQ=255) ccTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAaagcgaagc > 3:304761/1‑149 (MQ=255) ccTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCCGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGaaaaaa > 2:265754/1‑142 (MQ=255) cTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAaagcgaagcg > 2:148122/1‑149 (MQ=255) cTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGtt > 7:421561/1‑148 (MQ=255) cTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGtt < 1:114720/148‑1 (MQ=255) gAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTAt > 3:308236/1‑149 (MQ=255) aaCCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTAtt < 6:66861/149‑1 (MQ=255) cACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTAttgtt < 4:83481/149‑1 (MQ=255) cACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTAttgtt > 8:306237/1‑149 (MQ=255) aCGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTAttgtt > 3:73662/1‑148 (MQ=255) tCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAaagcgaa > 3:118878/1‑133 (MQ=255) tCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGc < 6:117980/149‑1 (MQ=255) tCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGc < 8:421561/149‑1 (MQ=255) | CGTATCCGGTCACCTCTCACCTGACAGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGC > NC_000913/4165353‑4165638 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |