| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3229847 | 100 (1.100) | 3 (0.030) | 3/232 | NT | 3.1% | coding (960/2352 nt) | ygjK | alpha‑glucosidase |
| ? | NC_000913 | = 3229881 | 95 (1.100) | coding (994/2352 nt) | ygjK | alpha‑glucosidase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
AACGCTGGGAAGAATACCTGAAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATACCTGGAAGCAGGCGTTTGCGATGGCGCATTTCAATCCGGACATCGCCAAAGAGAATATCCGCGCGGTCTTCTCCTGGCAGATCCAGCCTGGCGATAGCG > NC_000913/3229735‑3230028 | aaCGCTGGGAAGAATACCTGCAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTc > 1:120375‑M2/1‑147 (MQ=255) aCGCTGGGAAGAATACCTGAAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTcg > 3:395027‑M2/1‑146 (MQ=255) aCGCTGGGAAGAATACCTGAAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTcg > 5:51195‑M2/1‑146 (MQ=255) cTGGGAAGAATACCTGAAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGGCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTcggtg > 2:301791‑M2/1‑143 (MQ=255) aagaaTACCTGAAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCgg > 3:161331/1‑148 (MQ=255) tcccTGAAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCTCGTCGCGGGGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCt < 1:92101/146‑1 (MQ=255) ccTGAAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTg < 8:164173/147‑1 (MQ=255) tGAAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTgggt > 3:402061/1‑146 (MQ=255) tGAAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGtt > 3:175752/1‑148 (MQ=255) gaagaaAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGt > 8:202690/1‑128 (MQ=255) gaagaaAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGt < 7:202690/128‑1 (MQ=255) gaagaaAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTtc > 2:149399/1‑148 (MQ=255) aagaaAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTtct > 7:56735/1‑148 (MQ=255) ttAACCAATCCGGATGTGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTgg < 5:362978/135‑1 (MQ=255) ttAACCAATCCGGATGTGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTgg > 6:362978/1‑135 (MQ=255) ttAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATc < 1:149399/148‑1 (MQ=255) ttAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGAGCGAAACGCTCACCGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATc < 1:297704/148‑1 (MQ=255) ttaCCTATCCGGATGCGACGCCGCCACAGCCGCGCGTCTCCGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGAAACTCGCGCTCACAGGGCGGTCCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCTGAGACCGGGCCCTGGTTCTCCGGCAATCa > 7:178914/3‑148 (MQ=255) tAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAAt > 8:123570/1‑146 (MQ=255) tAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGCTAACTCGCGCTCACCGCGCGGTGCGGAGAAATATTACACAGATACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCaaa > 7:282648/1‑145 (MQ=255) aCCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGa < 4:234855/148‑1 (MQ=255) cAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACAGGGCGGTGCGGTGAAATATAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGAGCTGGTTCTCCGGCAATCAGAcc > 5:91162/1‑148 (MQ=255) aaTCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCt > 4:1599/1‑148 (MQ=255) tCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTgg > 2:282580/1‑148 (MQ=255) tCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTgg > 3:118843/1‑148 (MQ=255) ccGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGc > 4:338914/1‑148 (MQ=255) ggATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCg < 5:55872/148‑1 (MQ=255) aTGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGt < 2:202496/147‑1 (MQ=255) aTGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGt > 1:202496/1‑147 (MQ=255) aTGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTg < 4:140287/148‑1 (MQ=255) aTGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTg < 1:282580/148‑1 (MQ=255) cGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCTATCGAAACGCTCTACGGTAAGTGGCGCTCACGGGGCGGTGCGGTGAAATTTAAGTCCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGGTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGa < 8:178914/148‑1 (MQ=255) aCGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGt > 8:383293/1‑118 (MQ=255) aCGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGt < 7:383293/118‑1 (MQ=255) aCGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATa < 4:175752/148‑1 (MQ=255) aCGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATa < 5:161634/148‑1 (MQ=255) aCGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATa > 5:215945/1‑148 (MQ=255) aCGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATa > 2:32650/1‑148 (MQ=255) aaCAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATACCTgg > 4:20514/1‑146 (MQ=255) cAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATACCTGGAAGc < 3:20514/148‑1 (MQ=255) 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tGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTcggtgagcgccagttaccgttgagcgtttcgatcgctttcaccgcgacgcgcgtctgttccggcgtcgcatccggattg < 5:290136‑M2/125‑80 (MQ=255) tGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATACCTGGAAGCAGGCGTTTGCGATGGCGCATTTCAATCCGGACATCGCCAAagag > 4:132109/1‑147 (MQ=255) ggCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCTTGGGATACCTGGAAGCATGCGTTTGCGATGGCGCATTTCAATCCGGACATCGCCAAAgaga > 8:292220/1‑147 (MQ=255) ggCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGCCCGTGGGATACCTGGAAGCAGGCGTTTGCGATGGCGCAATTCAATCCGGACATCGCCAAAgaga > 2:241082/1‑147 (MQ=255) cTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATACCTg > 5:355428/1‑93 (MQ=255) cTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATACCTg < 6:355428/93‑1 (MQ=255) 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tgAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATGAGACCTGGCCGTGGGATACCTGGAAGCAGGCGTTTGCGATGGCGCATTTCAATCCGGACATCGCCAAAGAGAATATCcgcgc > 5:402939/1‑136 (MQ=255) tgAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATGAGACCTGGCCGTGGGATACCTGGAAGCAGGCGTTTGCGATGGCGCATTTCAATCCGGACATCGCCAAAGAGAATATCcgcgc < 6:402939/136‑1 (MQ=255) tgAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATACCTGGAAGCAGGCGTTTGCGATGGCGCATTTCAATCCGGACATCGCCAAAGAGAATATCCGCGCGGTCTTCTCCTg < 8:81702/148‑1 (MQ=255) aaTTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATACCTGGAAGCAGGCGTTTGCGATGGCGCATTTCAATCCGGACATCGCCAAAGAGAATATCCGCGCGGTCTTCTCCTgg > 5:163058/1‑146 (MQ=255) aTTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATACCTGGAAGCAGGCGTTTGCGATGGCGCATTTCAATCCGGACATCGCCAAAGAGAATATCCGCGCGGTCTTCTCCTGGCAg < 3:395230/148‑1 (MQ=255) tttAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATACCTGGAAGCAGGCGTTTGCGATGGCGCATTTCAATCCGGACATCGCCAAAGAGAATATCCGCGCGGTCTTCTCCTgg > 7:425546/1‑144 (MQ=255) tttAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATACCTGGAAGCAGGCGTTTGCGATGGCGCATTTCAATCCGGACATCGCCAAAGAGAATATCCGCGCGGTCTTCTCCTGGCAGa < 3:273902/148‑1 (MQ=255) ttAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATACCTGGAAGCAGGCGTTTGCGATGGCGCATTTCAATCCGGACATCGCCAAAGAGAATATCCGCGCGGTCTTCTCCTgg > 3:162522/1‑143 (MQ=255) cacCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGTGATACCTGTAAGCAGGCGTTTGCGATGGCGAATTTCAATCCGGACATCTCCAAAGAGAATATCCGCGCGGTCTTCTCCTGGCAGATCCAg < 6:91162/148‑1 (MQ=255) cacCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATACCTGGAAGCAGGCGTTTGCGATGGCGCATTTCAATCCGGACATCGCCAAAGAGAATATCCGCGCGGTCTTCTCCTGGCAGATCCAg < 4:162522/148‑1 (MQ=255) ccGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTCGGCGTGGGATACCTGGAAGCAGGCGTTTGCGATGGCGCATTTCAATCCGGACAGCGACAAAGAGAATATCCGCGCGGTCTTCTCCTGGCTGATCCAGcc < 8:282648/148‑1 (MQ=255) tCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATACCTGGAAGCAGGCGTTTGCGATGGCGCATTTCAATCCGGACATCGCCAAAGAGAATATCCGCGCGGTCTTCTCCTGGCAGATCCAGCCTGGCGATAgcg < 2:388799/148‑1 (MQ=255) | AACGCTGGGAAGAATACCTGAAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATACCTGGAAGCAGGCGTTTGCGATGGCGCATTTCAATCCGGACATCGCCAAAGAGAATATCCGCGCGGTCTTCTCCTGGCAGATCCAGCCTGGCGATAGCG > NC_000913/3229735‑3230028 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |