| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 3229847 | 100 (1.100) | 3 (0.030) | 3/232 | NT | 3.1% | coding (960/2352 nt) | ygjK | alpha‑glucosidase |
| ? | NC_000913 | = 3229881 | 95 (1.100) | coding (994/2352 nt) | ygjK | alpha‑glucosidase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
TCCGGCGTTTTATCTCACCGCCTCGCAGCAACGCTGGGAAGAATACCTGAAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATACCTGGAAGCAGGCGTTTGCGATGGCGCATTTCAATCCGGACATCGCCAAAGAGAATATCCGCGCG > NC_000913/3229706‑3229994 | tCCGGCGTTTTATCTCACCGCCTCGCAGCAACGCTGGGAAGAATACCTGAAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGgcggt < 6:353994/148‑1 (MQ=255) ggCGTTTTATCTCACCGCCTCGCAGCAACGCTGGGAAGAATACCTGAAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGgcggtgcg > 3:140287/1‑148 (MQ=255) tttATCTCACCGCCTCGCAGCAACGCTGGGAAGAATACCTGAAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGCCGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGa > 6:292857/1‑147 (MQ=255) aTCTCACCGCCTCGCAGCAACGCTGGGAAGAATACCTGAAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAAt < 1:214427/147‑1 (MQ=255) aCCGCCTCGCAGCAACGCTGGGAAGAATACCTGAAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTa < 1:78368/145‑1 (MQ=255) gCCTCGCAGCAACGCTGGGAAGAATACCTGAAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCg < 7:329798/148‑1 (MQ=255) gcagcaACGCTGGGAAGAATACCTGAAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTaca < 1:350161/148‑1 (MQ=255) aaCGCTGGGAAGAATACCTGCAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTc > 1:120375‑M2/1‑147 (MQ=255) aCGCTGGGAAGAATACCTGAAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTcg > 5:51195‑M2/1‑146 (MQ=255) aCGCTGGGAAGAATACCTGAAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTcg > 3:395027‑M2/1‑146 (MQ=255) cTGGGAAGAATACCTGAAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGACAGCGCTCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGacggtgtaacggtgttaaatttcaccgcaccgcccggtg < 1:413683‑M1/148‑40 (MQ=255) cTGGGAAGAATACCTGAAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGGCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTcggtg > 2:301791‑M2/1‑143 (MQ=255) gaagaaTACCTGAAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAacac < 1:135212/128‑1 (MQ=255) gaagaaTACCTGAAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAacac > 2:135212/1‑128 (MQ=255) aagaaTACCTGAAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCgg > 3:161331/1‑148 (MQ=255) tcccTGAAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCTCGTCGCGGGGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCt < 1:92101/146‑1 (MQ=255) ccTGAAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTg < 8:164173/147‑1 (MQ=255) tGAAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTgggt > 3:402061/1‑146 (MQ=255) tGAAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGtt > 3:175752/1‑148 (MQ=255) gaagaaAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAaca > 8:86192/1‑116 (MQ=255) gaagaaAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGt < 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ttAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGAGCGAAACGCTCACCGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATc < 1:297704/148‑1 (MQ=255) ttaCCTATCCGGATGCGACGCCGCCACAGCCGCGCGTCTCCGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGAAACTCGCGCTCACAGGGCGGTCCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCTGAGACCGGGCCCTGGTTCTCCGGCAATCa > 7:178914/3‑148 (MQ=255) tAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAAt > 8:123570/1‑146 (MQ=255) tAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGCTAACTCGCGCTCACCGCGCGGTGCGGAGAAATATTACACAGATACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCaaa > 7:282648/1‑145 (MQ=255) aCCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGa < 4:234855/148‑1 (MQ=255) cAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGacggtgtaacggtgttaaatttcaccgcaccgcccggtgagcgcca > 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cGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTa < 8:279402/50‑1 (MQ=255) cGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATACCTGGAAGCAGGCGTTTGCGATGGCGCATTTCAAt > 7:240032/1‑148 (MQ=255) aaaCGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATACCTGGAAGCAGGCGTTTGCGATGGCGCATTTCAATcc > 6:2867/1‑148 (MQ=255) aaCGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTg < 2:293052/105‑1 (MQ=255) aaCGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTg > 1:293052/1‑105 (MQ=255) aaCGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATACCTGGAAGCAGGCGTTTGCGATGGCGCATTTCAATCCg > 1:388799/1‑148 (MQ=255) aCGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATACCTGGAAGCAGGCGTTTGCGATGGCGCATTTCAATCCg > 7:176285/1‑147 (MQ=255) cTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATACCTGGAAGCAGGCGTTTGCGATGGCGCATTTCAATCCGGACa > 6:127366/1‑148 (MQ=255) cTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATACCTGGAAGCAGGCGTTTGCGATGGCGCATTTCAATCCGGACa < 8:176285/148‑1 (MQ=255) aCGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGgcg > 2:140831/1‑67 (MQ=255) aCGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGgcg < 1:140831/67‑1 (MQ=255) aCGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGa < 7:91016/87‑1 (MQ=255) tAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTg > 7:71753/1‑93 (MQ=255) tAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTg < 8:71753/93‑1 (MQ=255) aCTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATACCTGGAAGCAGGCGTTTGCGATGGCGCATTTCAATCCGGACATCGCCAAaga < 5:2867/148‑1 (MQ=255) cTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATACCTGGAAGCAGGCGTTTGCGATGGCGCATTTCAATCCGGACATCGCCAAagag < 5:127366/148‑1 (MQ=255) tGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTcggtgagcgccagttaccgttgagcgtttcgatcgctttcaccgcgacgcgcgtctgttccggcgtcgcatccggattg < 5:290136‑M2/125‑80 (MQ=255) tGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATACCTGGAAGCAGGCGTTTGCGATGGCGCATTTCAATCCGGACATCGCCAAagag > 4:132109/1‑147 (MQ=255) ggCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCTTGGGATACCTGGAAGCATGCGTTTGCGATGGCGCATTTCAATCCGGACATCGCCAAAgaga > 8:292220/1‑147 (MQ=255) ggCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGCCCGTGGGATACCTGGAAGCAGGCGTTTGCGATGGCGCAATTCAATCCGGACATCGCCAAAgaga > 2:241082/1‑147 (MQ=255) cTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATACCTg < 6:355428/93‑1 (MQ=255) cTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATACCTg > 5:355428/1‑93 (MQ=255) cTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATACCTGGAAGCAGGCGTTTGCGATGGCGCATTTCAATCCGGACATCGCCAAAGAGAATATc < 5:75415/148‑1 (MQ=255) cACCGacggtgtaacggtgttaaatttcaccgcaccgcccggtgagcgccagttaccgttgagcgtttcgatcgctttcaccgcgccgcgcgtctgttccggcgtcgcatccggattggttaaccctttcttcaggtattcttcccag > 2:301791‑M1/1‑5 (MQ=255) cACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTg > 5:389162/1‑82 (MQ=255) cACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTg < 6:389162/82‑1 (MQ=255) cGacggtgtaacggtgttaaatttcaccgcaccgcccggtgagcgccagttaccgttgagcgtttcgatcgctttcaccgcgacgcgcgtctgttccggcgtcgcatccggattggttaaccctttcttcaggtattcttcccagcgt > 5:51195‑M1/1‑2 (MQ=255) cGacggtgtaacggtgttaaatttcaccgcaccgcccggtgagcgccagttaccgttgagcgtttcgatcgctttcaccgcgacgcgcgtctgttccggcgtcgcatccggattggttaaccctttcttcaggtattcttcccagcgt > 3:395027‑M1/1‑2 (MQ=255) gacggtgtaacggtgttaaatttcaccgcaccgcccggtgagcgccagttaccgttgagcgtttcgatcgctttcaccgcgacgcgcgtctgttccggcgtcgcatccggattggttaaccctttctgcaggtattcttcccagcgtt > 1:120375‑M1/1‑1 (MQ=255) | TCCGGCGTTTTATCTCACCGCCTCGCAGCAACGCTGGGAAGAATACCTGAAGAAAGGGTTAACCAATCCGGATGCGACGCCGGAACAGACGCGCGTCGCGGTGAAAGCGATCGAAACGCTCAACGGTAACTGGCGCTCACCGGGCGGTGCGGTGAAATTTAACACCGTTACACCGTCGGTGACCGGGCGCTGGTTCTCCGGCAATCAGACCTGGCCGTGGGATACCTGGAAGCAGGCGTTTGCGATGGCGCATTTCAATCCGGACATCGCCAAAGAGAATATCCGCGCG > NC_000913/3229706‑3229994 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |