BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	CP016816	245,378	A→T	K1669Y (AAA→TAT)	JCVSYN2_01035 →	ABC transporter permease

Read alignment evidence...
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*	CP016816	245,378	0	A	T	99.3%	7641.1 / NA	2376	K1669N (AAA→AAT)	JCVSYN2_01035	ABC transporter permease
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (9/7); new base T (1243/1112); total (1254/1122)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.08e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

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TAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTAAATATGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACAAGTTTAGGTTTTGCAATACCTTAT  >  CP016816/245251‑245501

       tACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCtt                                                                                                                      <  1:1717565/128‑1 (MQ=255)

         cAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCtttt                                                                                                                    <  2:901871/128‑1 (MQ=255)

         cAGTAATTAGTACTTCAGCTATAGTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCtttt                                                                                                                    <  2:3652644/128‑1 (MQ=255)

          aGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTg                                                                                                                   <  1:1511093/128‑1 (MQ=255)

          aGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTg                                                                                                                   <  1:2444164/128‑1 (MQ=255)

           gTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTgg                                                                                                                  >  1:183986/1‑128 (MQ=255)

              attattACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAATATTAGTTATTTTGCTTTTGGAAc                                                                                                               >  1:4859422/1‑128 (MQ=255)

               ttattaCTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACt                                                                                                              >  2:2438828/1‑128 (MQ=255)

                tattaCTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGTAACTg                                                                                                             >  1:4940305/1‑128 (MQ=255)

                tattaCTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTACGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTg                                                                                                             >  2:1003906/1‑128 (MQ=255)

                   taCTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCaa                                                                                                          >  2:3926772/1‑128 (MQ=255)

                   taCATCAGCTTTACTAGTAAAGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCaa                                                                                                          <  2:2248017/128‑1 (MQ=255)

                    aCTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTCGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAAt                                                                                                         <  1:106590/128‑1 (MQ=255)

                    aCTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAAt                                                                                                         <  1:2612527/128‑1 (MQ=255)

                      ttCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATtg                                                                                                       <  2:1195864/128‑1 (MQ=255)

                        cAGCTTTACTATTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATtgtg                                                                                                     <  2:1097994/128‑1 (MQ=255)

                        cAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATtgtg                                                                                                     <  1:64668/128‑1 (MQ=255)

                        cAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATtgtg                                                                                                     >  2:4507390/1‑128 (MQ=255)

                          gCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAATATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTgtt                                                                                                   >  2:5001617/1‑128 (MQ=255)

                          gCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTgtt                                                                                                   <  2:5106181/128‑1 (MQ=255)

                          gCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTgtt                                                                                                   >  1:3890823/1‑128 (MQ=255)

                            tttACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTgttta                                                                                                 >  2:691165/1‑128 (MQ=255)

                            tttAATAGTTATGTTAAATTCATATATTTATGTAACTCAGTATCAACACTTTATGCTTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTgttta                                                                                                 <  1:219224/128‑1 (MQ=255)

                             ttACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTTGAACTGCAATTGTgtttag                                                                                                >  1:4061216/1‑128 (MQ=255)

                             ttACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTgtttag                                                                                                >  1:5040942/1‑128 (MQ=255)

                                   gTAATGTTAATTTCAGATATATATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTATAATGAAAGCATTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGATATTTTGCTTTTGGAACTGCAAGTCTTTTTAGTTTAAt                                                                                          >  1:160783/1‑128 (MQ=255)

                                    taattttaatttCATATATTTATGTATCTCATTATTAACATTTTATTATTTTATTGAAAGATTTAGGATATTCTAATTATAAAATTAGTTTTTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAAtt                                                                                         <  2:1319956/128‑1 (MQ=255)

                                    tAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCTAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAAtt                                                                                         >  2:2808581/1‑128 (MQ=255)

                                     aaTGTTAATTTCAGATCTTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTa                                                                                        <  2:2887540/128‑1 (MQ=255)

                                      aTGTTAATTTAAGATATTTATGTAACTCAGTCTCAACAGTTTATGATTTTAAAGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTTGTTATATTTCTTATGTAACTGCAATTGAGTTTAGTTTAAtttt                                                                                       >  2:2113397/1‑126 (MQ=255)

                                       tGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTAtg                                                                                      <  1:733856/128‑1 (MQ=255)

                                         ttAATTTCAGATATTTATGTAACTCGGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTAtgtg                                                                                    >  2:2040367/1‑128 (MQ=255)

                                         ttAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGaa                                                                                                                >  2:4311852/1‑100 (MQ=255)

                                          taatatattataaTTATGTAACTAAGTATAAACAGTTAATGTTTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTTCAATTGTGTTTAGTTTAATTAtgtta                                                                                   <  2:2710527/119‑3 (MQ=255)

                                          tAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAAGAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGa                                                                                   <  1:4661752/128‑1 (MQ=255)

                                           aaTTTCAGATATTTATGTAAGTCAGTATCACCAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAg                                                                                  <  1:2740602/128‑1 (MQ=255)

                                            aTTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGc                                                                                 <  1:3636272/128‑1 (MQ=255)

                                            aTTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGc                                                                                 <  1:443798/128‑1 (MQ=255)

                                             tttCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCa                                                                                <  2:4100801/128‑1 (MQ=255)

                                              ttCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTTCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCaa                                                                               >  2:3370207/1‑128 (MQ=255)

                                               tCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGTAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAAt                                                                              >  2:4773279/1‑128 (MQ=255)

                                               tCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTTGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAAt                                                                              >  2:1706160/1‑128 (MQ=255)

                                                  gATATTTATGTAACTCAGTATCCACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTc                                                                           <  2:4413580/128‑1 (MQ=255)

                                                      tttATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACt                                                                       <  1:1937281/128‑1 (MQ=255)

                                                       ttATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGATAGATTTAGGATATTCAAATTATAATATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACtt                                                                      <  2:1403953/128‑1 (MQ=255)

                                                       ttATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACtt                                                                      <  1:817868/128‑1 (MQ=255)

                                                        tATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACttt                                                                     >  1:4554127/1‑128 (MQ=255)

                                                          tGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAg                                                                   <  1:1003088/128‑1 (MQ=255)

                                                           gTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGc                                                                  >  2:402317/1‑128 (MQ=255)

                                                            tAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCt                                                                 <  1:4177242/128‑1 (MQ=255)

                                                            tAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCt                                                                 >  2:2326677/1‑128 (MQ=255)

                                                            tAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCt                                                                 <  1:4271538/128‑1 (MQ=255)

                                                            tAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCATTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCt                                                                 <  1:397411/128‑1 (MQ=255)

                                                             aaCTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTa                                                                >  1:3395948/1‑128 (MQ=255)

                                                              aCTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTAc                                                               <  2:1904415/128‑1 (MQ=255)

                                                                tCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTAT‑AAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTATAGATACTTg                                                            >  2:180031/1‑128 (MQ=255)

                                                                 cAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTg                                                            <  2:3862155/128‑1 (MQ=255)

                                                                 cAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTg                                                            <  1:5348714/128‑1 (MQ=255)

                                                                     aTCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTTCTTTAGGAACTGAAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAAtt                                                        >  1:2965321/1‑128 (MQ=255)

                                                                      tCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGTAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTAAACTTTAGCTACTTGAAttt                                                       >  1:1331117/1‑128 (MQ=255)

                                                                      tCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAAttt                                                       <  2:2185083/128‑1 (MQ=255)

                                                                       cAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAAtttt                                                      <  1:3079080/128‑1 (MQ=255)

                                                                       cAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAAtttt                                                      >  2:418629/1‑128 (MQ=255)

                                                                       cAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAAtttt                                                      >  1:544674/1‑128 (MQ=255)

                                                                          cAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAAATAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAAt                                                   >  2:3489342/1‑128 (MQ=255)

                                                                           aGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATc                                                  >  1:3194990/1‑128 (MQ=255)

                                                                             tttATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATcac                                                >  1:2012897/1‑128 (MQ=255)

                                                                             tttATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAAATTTAGCTACTTGAATTTTAATcac                                                >  2:1602637/1‑128 (MQ=255)

                                                                              ttATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATcaca                                               >  1:2521896/1‑128 (MQ=255)

                                                                              ttATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTAAATTATGTGATCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATcaca                                               >  1:885197/1‑128 (MQ=255)

                                                                               tATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACat                                              >  1:557122/1‑128 (MQ=255)

                                                                               tATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACat                                              >  1:2354213/1‑128 (MQ=255)

                                                                                    ttttAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACattaatt                                         >  2:3265243/1‑128 (MQ=255)

                                                                                      ttAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAattat                                       >  2:3196690/1‑128 (MQ=255)

                                                                                         aTGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCa                                    >  2:585548/1‑128 (MQ=255)

                                                                                         aTGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCa                                    >  1:5142619/1‑128 (MQ=255)

                                                                                          tGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCaa                                   <  1:1206838/128‑1 (MQ=255)

                                                                                            aaaGCTTTAGGATATTAAAATAATAAAATTAGGTATTTTGCTTTTGGAACGGCAATTGTGTGTCGTTTAATTATGTGAGCAATTGCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAat                                 <  2:3562361/128‑1 (MQ=255)

                                                                                             aaGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAatt                                >  1:1427432/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                  ttAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGATCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTAc                           <  2:3742051/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                  taaGGATCTTCAAATTATAATATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTAc                           <  2:1495386/126‑1 (MQ=255)

                                                                                                   tAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACa                          >  2:489366/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                   tAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACa                          <  2:811947/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                   tAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACa                          <  2:2993529/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                   tAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACa                          >  1:5230024/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                    aGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACaa                         >  2:2629930/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                    aGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACaa                         >  1:4765271/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                     ggATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATAACATTAATTATTCAAATTATTACAAg                        >  2:2502687/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                       atatTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACAAGtt                      >  1:210055/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                         atTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTAc                           >  1:3754392/1‑121 (MQ=255)

                                                                                                         atTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGAAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTAAGCTAATTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACAAGTTTa                    >  1:3527582/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                          ttCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACAAGTTTAg                   >  2:4685014/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                          ttCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACAAGTTTAg                   >  2:5458628/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                           tCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACAAGttt                     >  1:3296059/1‑125 (MQ=255)

                                                                                                            cataTTATAAAATTAGTTTTTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACAAGTTTAGGt                 <  2:5352899/125‑1 (MQ=255)

                                                                                                             aaaTTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACAAGTTTAGGtt                <  2:3104002/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                              aaTTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACAAGTTTAGGttt               <  2:5209285/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                               tttATAATATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTAAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACAAGTTTAGGtttt              <  2:4610942/127‑1 (MQ=255)

                                                                                                               aTTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACAAGTTTAGTtttt              >  1:2280172/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                 tataAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACAAGTTTAGGTTTTGc            >  1:2856635/1‑128 (MQ=255)

TAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTAAATATGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACAAGTTTAGGTTTTGCAATACCTTAT  >  CP016816/245251‑245501

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 14 ≤` `ATCG/ATCG` `< 21 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 36 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`