| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | = 311148 | 176 (0.250) | 194 (0.220) +TATA |
67/190 | 22.8 | 46.0% | intergenic (‑71/‑243) | JCVSYN2_01300/JCVSYN2_01305 | hypothetical protein/30S ribosomal protein S21 |
| ? | CP016816 | 311149 = | 248 (0.270) | intergenic (‑72/‑242) | JCVSYN2_01300/JCVSYN2_01305 | hypothetical protein/30S ribosomal protein S21 | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
GTACCAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP016816/311022‑311148‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACTAATAAAATCTATTTTTATTTA > CP016816/311149‑311275 |||||| GTACCAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAAGATACATTCAT‑‑T > 1:808298/1‑128GTACCAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACACCTTATTAAAAAATAAAATACTTTTTACATACGATTCAAACCATATATAAGATACATTCAT‑‑T > 1:125830/1‑128 TACCAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATAAATTCAT‑‑TA > 2:1407803/1‑128 ACCAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACAAACATTCAT‑‑TAT > 2:1946776/1‑128 CAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATAT > 1:246080/1‑128 AGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATA > 2:867311/1‑128 GTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATAT < 2:779332/128‑1 TTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATA > 2:1173355/1‑128 TTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATA > 1:39897/1‑128 TTGTAATAACTAAACCAAATGAACTTAAAAATGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTAGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATA > 2:1059132/1‑128 TGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTAAATACGATTCAAAACATATAAAACATACAATCAT‑‑TATATATAT > 2:546167/1‑128 GTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATA > 1:1542338/1‑128 TAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATAT > 2:155955/1‑128 AATAACTAATACAAATGAACTTAAAATTGTAATTAAATTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATA < 1:1849339/128‑1 ATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATAT > 1:1497219/1‑128 aAACTAATCAAAAAGAACTTAAAATTGTAATAAACATTTTAATTTTACACACACATTATTAAAAAATAAAATATTTGTTACATACGATTAAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATA < 1:1090809/127‑1 aaataataaAAATGAAATTAAAATTTTAATTAACTTTTTAATTTTACACACAAATTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATAT < 1:1763440/119‑1 AACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATAT > 1:339009/1‑128 ACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATA > 1:38840/1‑128 ACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATA > 1:1571726/1‑128 ataataaAAATTAAATTAAAATTTTAATTAAATTTTTCATTTTAAACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTAAATACGATTCAAAACATATATAACATACTTTCAT‑‑TATATATATATATATAT < 1:854247/121‑1 CTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATTCTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATAT > 2:332616/1‑128 CTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATAT > 2:1484213/1‑128 CTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATAT > 2:1503324/1‑128 TAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATA > 1:1713984/1‑128 TAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGAATCAAAACATATAAAACATACATTCAT‑‑TATATTTATATATATATA > 1:1677042/1‑128 TAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAAAAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACAATCAT‑‑TAAATATATATATATATA > 1:455787/1‑128 TAATACAAATTAAATTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAAAATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATA < 1:651149/128‑1 AATCCAAATGAACTTAAAATTTTAATTAACTTTTTCATTTTACAAAAACCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATAAATTCAT‑‑TATATATATATATATATAT < 1:1407803/128‑1 AATACAAATTAAATTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACACATTATTAAAAAATAAAATAATTTTTAAATAATATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATAT < 2:284445/128‑1 aaaCAAATTAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATATTAAACACCCCATATAAAAAAATAAAATACTTGTTACATAAGATTCAAAACAAATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATATA < 2:1227914/125‑1 ATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATATA > 2:179719/1‑128 TCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTTAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATATCATACATTAAT‑‑TATATATATATATATATATAT > 2:1736782/1‑128 TCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATATAa > 2:1603498/1‑127 TCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATATAT < 1:1660492/128‑1 TCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATATAT > 1:47448/1‑128 CCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATATAat < 1:1431348/128‑3 CCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATATATA > 2:49994/1‑128 CAAATTAAATTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTAATAAAAAATAAAAAACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATAatgaatgta < 2:34199/128‑10 AATTAACTTAAAATTGTAATTAAATTTTTAATTATAGACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATAAGATTAAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATATATATAT < 1:733721/128‑1 AATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATATATATAT > 2:712043/1‑128 AATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATAAATATATttca > 1:159637/1‑124 ATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATATAatgaaa > 2:962389/1‑122 TGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTTTTACATACGATTCAAAACAATTATAACATACATTAAT‑‑TATATATATATATATATATATATATAT > 1:801144/1‑128 TGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATA < 2:579892/119‑1 TGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATA > 1:579892/1‑119 ACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATATATATATATAaa > 2:1321789/1‑126 CTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATAATTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATATAatgcaatatgt < 2:296110/128‑12 TAAAAATTTAATTAACTTTTTCATTATACAAACACCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATAAAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATATATAatgcaatatgt < 1:546167/128‑12 AATTTTATTTAAATTTTTAATTTTACACACACCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATATATATATATATAATGCAA < 1:179719/128‑1 ATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATATATATATATATAAATCAAT > 2:1963950/1‑128 ttTAATTAAATTTTTCATTTTACACACACCTTATTAAAAAATAAAATACTTTTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATATATATATATATAATGCAATAT < 1:681361/126‑1 AACTTTTTAATATTACACACCCAATATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACTCTTCAAAACATATATAACATACAATCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAA < 1:826827/128‑1 aTTTTTAATTTTACAAACAACTTATTAAAAAATAAAATAATTGTTACATACGATTAAAAACATATATAAAATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAA < 1:1322319/127‑1 TTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATTTAAATTAAAATATGTTATA > 1:1074348/1‑128 ttaaacaaaCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAA < 2:1630801/119‑1 agACACACCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTAAATAAGATTCAAAACATATATAACATAAATTCATTATATATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTAT < 1:1968213/126‑1 ACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACAAACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATATATATATATAT‑‑TCCAATATGTAAATGAAAATATTGTATTATA > 1:489249/1‑128 cacacaaaTTATTTAAAAATAAAATAATTGTTTCATAATATTCAAAAAATATATAAAATACATTATT‑‑TATATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAAT < 1:1140340/120‑1 CACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATATATATATATATAATGAAATATTTAATTTAAAATATTTTATAATAt > 1:1204593/1‑127 CACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATATAATTCAATATTTAAATTAAAATATTGTATAATAGaa > 1:925411/1‑126 CACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATATAATTAAATATCTAAATGAAAATATATTATAATAGCA > 2:442189/1‑128 CACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGATATAATAGac > 1:1472019/1‑126 CACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATATAATAAAATATATAAATAAAAATATTTTATAATATCA > 1:591770/1‑128 TTAAAAAATAAAATACTTTTTACATAAGATTAAAAAAATATATAAGATAAATTAAT‑‑TATATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTT < 1:1003182/128‑1 TAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATATATATATATATAAATAAATATATAAATTAAAATATTATATAATAGCAcaatttta > 1:1838795/1‑120 AAAAAAAATAATTTTTACATAAGATTCAAAAAATATATAAAATAAATTAAT‑‑TATATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAA < 2:1838795/128‑1 AATAAAATACTTGTTACATACGAATCAAAAAATATATAAAATACAATCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTA < 2:1528335/128‑1 ATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATATATATATATATTAATAAATATATAAATTAAAATATTTTATAATAGAAACCTTTTATAAAat > 1:864743/1‑126 ATATTTGTTACATACTATTCAAAAAATATATAACATAAATTAAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAA < 1:442189/128‑1 ATAATTTTTACATAATATTCAAAAAATATATAACATAAATTAAT‑‑TATATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAA < 1:712043/128‑1 TACTTGTTATATACTATTCAAAACATATATATCATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAA < 2:6674/128‑1 TTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATATAATGAAATATGTAAATGAAAATATGTTATAATATCAACAGTTTATAAATAAAAAAAATAGT > 2:69357/1‑128 ttTTATATACGATTCAAAAAATATATAACATAAATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTA < 1:1153175/126‑1 TGTTACATACGATTCAAACCATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATATAATGAAATATTAAAATGAAAATATTTTATAATAGCAAAATTTTATAAAGAAAAAAAATAGTA > 1:1818890/1‑128 TGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCATTATATATATATATATATATATATATATATATAATTCAATATGTAAATAAAAATATTATATAATATAAAACTTTTATAAATTAAAAAAAT > 2:139171/1‑128 TGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATATATATATATATAATTAAATATTTAAATTAAAATATGTTATAATAGCAAACTTTTATAAATTAAAAATATAt > 1:689069/1‑127 TGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATCTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTATATAAAGTAAAAAAATAG > 2:1888004/1‑128 gtttaATACGATTAAAAAAATATATAACATACATT‑‑T‑‑TTTATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAA < 1:1936580/123‑1 GTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑AAT‑AAATATTTAAATGAAAATATTGTATAATAGCAACAGTTTATAAATTAAAAAAATAGTAA > 1:742415/1‑128 aatATTCAAAAAATATATAAAATAAATTCATTATATATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATA < 2:1915910/125‑1 atATTCAAAACATATATAAAATAGAATAAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTA < 2:591770/126‑1 tattaatAACATATATAACATACATTAAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTAC < 1:1173355/121‑1 ttAAAAAATATATAAAATAAATTAAT‑‑TATATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACT < 1:1209047/126‑1 TCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATATATATATATATAATTCAATATTTAAATTAAAATATGTTATAATATCAAAATTTTATAAATTAAAAAAATAGTAAATATACTACT > 2:1866769/1‑128 AAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATT > 2:39157/1‑128 AAAAAATATATAAAATAAATTAAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATTGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATT < 1:1971534/128‑1 AAACATATATAAAATAAAT‑‑AT‑‑ATTATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTT < 2:171153/128‑1 AACATATAAAAAATAAATTAAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTA < 1:970986/128‑1 aATATATAAAATAAATTAAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACT < 1:1619993/127‑1 CATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACT < 2:1415158/128‑1 ATATAACATACATTCAT‑‑TATATATATATATATATATATATATATATAAATCAATATTTAAATTAAAATATTTTATAATATCAAACTTTTATAAAGTAAAAAAATAATAAATATACTAATTATTTAATA > 2:1184865/1‑128 ATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACTAATAA < 2:753462/128‑1 ATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATATAAATGAAAATATTGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACTAATAAAATCT > 2:1911175/1‑128 TACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACAGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTAATTATTTAATAATAATATCTA > 2:270111/1‑128 aaatttatTATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACTAATAAAATCTAT < 1:1879363/120‑1 ttcatTATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATTTAAATGAAAATATTGTATAATAGCAACCTTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATAATACTTATTAACTAATAAAATATATTTT > 1:30930/6‑128 ttcatTATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACTAATAAAATCTATTTT < 2:1542338/123‑1 TATATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACTAATAAAATCTATTTTTAT < 2:1130/128‑1 tTATATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACTAATAAAATCTATTTTTATT < 1:1359411/127‑1 |||||| GTACCAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP016816/311022‑311148‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACTAATAAAATCTATTTTTATTTA > CP016816/311149‑311275 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |