| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | = 87902 | 962 (0.610) | 309 (0.180) +TTT |
71/216 | 37.4 | 22.3% | intergenic (+29/‑831) | JCVSYN2_00345/JCVSYN2_00350 | hypothetical protein/50S ribosomal protein L31 |
| ? | CP016816 | 87903 = | 1117 (0.620) | intergenic (+30/‑830) | JCVSYN2_00345/JCVSYN2_00350 | hypothetical protein/50S ribosomal protein L31 | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 399 total aligned reads displayed.
TGTGTAACAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP016816/87776‑87902‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAATATTATTTTA > CP016816/87903‑88029 ||| GTGTAACAAAAGTGGTTTTTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATCAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGAATGTTTAATAATCCATT < 1:3751060/128‑1 TGTAACAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATTGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTTAATATCTGATTTAAATTTATTATTAAACAATCAATat > 1:1456360/1‑126 TGTAACAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATTGATTATAAAACAATCCATTT > 1:2526781/1‑128 TGTAACAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTT > 1:3486037/1‑128 TGTAACAAAAGGGGATATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAAAATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTT < 1:3344986/128‑1 GTAACAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTT > 2:3481564/1‑128 GTAACAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTT > 2:697734/1‑128 TAACAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTT > 2:60301/1‑128 AACAAAAGTGGTTATTGAGTTTCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATAATTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGTATTATTAAACAATCCAATTATT > 2:2194964/1‑128 ACAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCAGTTTTTT > 2:3787582/1‑128 ACAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCAATTTTTTT > 2:2803755/1‑128 CAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTT > 2:1929674/1‑128 AAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAATTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTT > 2:1665095/1‑128 AAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTT > 2:2846131/1‑128 AAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTT > 1:2011650/1‑128 AAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTT > 2:858266/1‑128 AAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTT > 2:101496/1‑128 AAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAAGAGCTGATTTAAATGGAATATTAATCAATCCATTTTTTTTT > 2:2431416/1‑128 AAAAGTGGGTATTGTGTTGCAAGTTAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTTATTGTAATTCAAATGAATTTTTATATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTT < 2:2666042/128‑1 AAAGTGGTTATTGAGTAGCAATTAAAGTGCAAATTGTTAATAAAATTGATATTAATGGTAATTCAAATGAATAATTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTT < 2:2999708/128‑1 AAGTGTTTATTGATTTTCAATTAAAGTTAAAATTGTTAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATTAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAAAAATCCATTTTTTTTTTT < 2:1155274/128‑1 AGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTT > 2:1378350/1‑128 AGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTAATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTT > 1:1203845/1‑128 AGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATATTGAATAGCTGATTTAAATGTATTATTAAACAATACATTTTTTTTTTTT > 1:244535/1‑128 AGTGGTTATTGAGTTGAAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAAAAATCCATTTTATTTTTTT > 1:737310/1‑128 GTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTT > 1:3537799/1‑128 TGGTTATTGTTTTTCAAGTAAAGTTTAAATTTATAATAAAATTGATATTAATGGAAATTAAAATGAATATTTATATTTTTAATAGCTGATTTAAATTGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTT < 2:3588605/128‑1 TGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTTAATAGCTTATTTAAATTGATTATTAAACAATCAATTTTTTTTTTTTTT > 1:1231379/1‑128 TGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTT > 1:3398838/1‑128 TGGTTATTGAGTTGCAAGT‑AAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTATACAATCCATTTTTTTTTTTTTTT > 1:1848037/1‑128 GGTTTTTGAGTTGCATTTAAAGTTCTAATTGATTATAAAATTGATATTAATGGAAAGTAAAATTAATATTTTGATTTTGAATATCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTT < 1:2844077/128‑1 TTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTTAATAGATGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTATTTTTTa > 2:1852809/1‑127 TTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTTTT > 2:1195904/1‑128 TTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTTTT > 1:638171/1‑128 TTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATAGATTATTAAACAAACCATTTTTTTTTTTTTTTTa > 2:2582376/1‑127 TATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAATCAATCCATTTTTTTTTTTTTTTTTT > 2:3881723/1‑128 TATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATATTTTTTTTTTTTTTaa > 1:2232495/1‑126 ATTGCGTGGCAATGAAAGTTAAAATTGTAAATAAAATTGATAATCCTGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGTATATCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTTTaat < 1:2894050/128‑4 ATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTTTaat > 1:2081496/1‑125 ATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTTTaat > 2:1792019/1‑125 ATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTTTaaa > 2:1079694/1‑125 ATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTTTaaa > 2:1492505/1‑125 ATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTTTTaa > 1:1363537/1‑126 ATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATATTTTTTTTTTTTTTatt > 1:3000116/1‑125 TTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATTGATTATTAAAAAATAAATTTTTTTTTTTTTTTTTaat > 1:2870328/1‑125 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AGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATATCTTATTTAAATGTATTATTAAACAATCCA‑TTTTTTTTTTTTTTTTTAATAAA > 1:2763107/1‑128 AGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGCTTTAAAATGATTATTAAACAAACCATTTATTTTTTTTTTTaaataaaa > 1:1016253/1‑120 AGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTTaaataaaa > 1:385967/1‑120 GTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTTTTAAAataa > 1:449126/1‑124 TGCAAGTAAAGTTCAAATTGTTAATAAAATTTATATTCATTGAAAGTAAAATTAATATTTATTTTTTGAATATCTGATTTAAATGGTTTATTAAACAATCCA‑TTTTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAG < 1:2392077/128‑1 TAAATTTCAAATTGATAATAAAATTTATATTCATTGAAAGTCAAAATAATATTTATATTTTTAAAATATGATTTAAATTGATTATTAAACAATCCA‑TTTTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAGACTCAC < 2:1116672/128‑1 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GATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCA‑TTTTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAAAATAAAATAATTAAATAAATTGAGATTATTT > 2:1693985/1‑128 AAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCA‑TTTTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAAAAACACATAAGTTAGTCAATTGAGATTATTTAATTATTAATTATTATT > 1:1294496/1‑128 AATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCA‑TTTTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAAAATCAAAAAATTTAGTCAATTTGTATTATTTATTTATTAATTATTATTT > 1:422518/1‑128 TGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCA‑TTTTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTTTTTATTAATTATACTTTGA > 1:3272708/1‑128 AATATTTAGATTTTTTATATAGTATTTAAATGGTTTATTAAACAATCCA‑TTTTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATG < 1:1962450/128‑1 tttatttttTTTTTAATATCTTATTTAAATTGTTTATAAAACAATTCA‑TTTTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGA < 2:3098343/119‑1 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taaaaaattcaTTTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTA < 2:3331686/117‑1 aaaaaataaaTTTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAA < 1:230691/118‑1 aatattaaaTTTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGTGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAAT < 1:1907602/119‑1 aacattctaTTTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTGAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAAT < 1:3109948/119‑1 aaatatacaTTTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAGAATCACATAAGTGATTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAAT < 2:1985449/119‑1 aaaattaaTTTTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGAGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAAT < 1:863153/120‑1 CAATCCA‑TTTTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAGACACACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTAACTTTATTTAGGTAACTAATTAATTACCTAATt > 1:532991/1‑127 acaatcaaTTTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAATA < 2:1301552/120‑1 atattcTTTTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGAGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAATAT < 1:963416/122‑1 atataaaTTTTTTTTTTTTTTTAAATAAAAAGACTCACATAAGTTAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAATAT < 1:1539638/121‑1 attcaTTTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAATATTA < 2:3802890/123‑1 atacTTTTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAATATTA < 1:1159733/124‑1 tataTTTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAATATTAT < 2:2050395/124‑1 taaaTTTTTTTTTTTTATTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAATATTAT < 1:2493593/124‑1 ccaTTTTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTTTTATTTGATGAAGTATTTACATTTCTTTAGGTAAGTAATTAATTACATAATATTtt > 2:3206268/4‑126 ccaTTTTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAGACACACAAAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTTTAATTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTATTTAATTACAAAAAATTAT > 2:3654197/4‑128 acaTTTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAATATTATT < 1:3637317/125‑1 TTTTTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAGAATCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAATATTATTT < 2:234128/128‑1 TTTTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAGACTCAAATAAGTGAGTCAATTGCGTTTTTTTAATTTTTAATTATTATTTGATGAAATATTTAACTTTCTTTAGTTAAATAATTATTTAACTAATATTATTTT > 1:1735435/1‑128 ||| TGTGTAACAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP016816/87776‑87902‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAATATTATTTTA > CP016816/87903‑88029 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |