| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP016816 | 113,623 | G→A | R244K (AGA→AAA) | JCVSYN2_00455 → | ABC transporter ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP016816 | 113,623 | 0 | G | A | 99.2% | 6795.8 / NA | 2160 | R244K (AGA→AAA) | JCVSYN2_00455 | ABC transporter ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (1014/1124); minor base T (12/6); total (1029/1131) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.53e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 2203 total aligned reads displayed.
AAGTGTTAAAGTAGAATTACAAGATGCAATTAACAAATATCAAGACTTTGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAGAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCAAAAACTAATTACTCCTCAACTTGAAGATGCTAGTCAT > CP016816/113498‑113747 | aGTGTTAAAGTAGAATTACAAGATGCAATTAACAAATATCAAGACTTTGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAaaaa > 2:402110/1‑128 (MQ=255) gtgtTAAAGTAGAATTACAAGATGCAATTAACAAATATCAAGACTTTGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAat > 2:1619957/1‑128 (MQ=255) tgtTAAAGTAGAATTACAAGATGCAATTAACAAATATCAAGACTTTGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAatg > 2:678618/1‑128 (MQ=255) tgtTAAAGTAGAATTACAAGATGCAATTAACAAATATCAAGACTTTGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAatg > 2:350000/1‑128 (MQ=255) gtTAAAGTAGAATTACAAGATGCAATTAACAAATATCAAGACTTTGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAatga < 1:1002176/128‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGAATTACAAGATGCAATTAACAAATATCAAGACTTTGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAatgat > 2:3040679/1‑128 (MQ=255) ttAAAGTAGAATTACAAGATGCAATTAACAAATATCAAGACTTTGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAatgat < 2:168784/128‑1 (MQ=255) tAAAGTAGAATTACAAGATGCAATTAACAAATATCAAGACTTTGTTCTTGATGCAATTTTAAAAGTTAAAGATGTATAAAATACTATTTAAAATACTTTCCAAGATCTGCTAGCTTTTTAAAatgtag > 1:2080466/1‑125 (MQ=255) tAGAATTACAAGATGCAATTAACAAATATCAAGACTTTGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAAt < 1:3371212/128‑1 (MQ=255) aGAATTACAAGATGCAATTAACAAATATCAAGACTTTGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATg > 2:3239323/1‑128 (MQ=255) gAATTACAAGATGCAATTAACAAATATCAAGACTTTGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGa < 2:1542253/128‑1 (MQ=255) gAATTACAAGATGCAATTAACAAATATCAAGACTTTGATCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGa < 2:3630418/128‑1 (MQ=255) aaTTACAAGATGCAATTAACAAATATCAAGACTTTGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGttaattaa > 2:1977229/1‑128 (MQ=255) aTTACAAGATGCAATTAACAAATATCAAGACTTTGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAg < 1:573366/128‑1 (MQ=255) tACAAGATGCAATTAACAAATATCAAGACTTTGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGt > 1:3914311/1‑128 (MQ=255) aaGATGCATTTAAGAAATATCAAGACTTAGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACATTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTACTGAA‑GTAAat < 1:1641171/128‑1 (MQ=255) tGCAATTAACAAATATCAAGACTTTGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTACTGAAgtatatttac > 2:1415102/1‑119 (MQ=255) gCAATTAACAAATATCAAGACTTTGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATAc > 1:2170429/1‑128 (MQ=255) gCAATTAACAAATATCAAGACTTTGTACATGATTCAATTTAAAAAGTTAAAGATTTAGAACATACTAGTTATAATACTTAAGAAGAAATGATAGCTATAAATTAAGATGTAAATCAAGGTCAAGATAc > 1:2822685/1‑128 (MQ=255) aTTAACAAATATCAAGACTTTGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTc > 2:2747052/1‑128 (MQ=255) ttAACAAATCTCAAGACTTTGTTCATGATTCTATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCa < 1:816051/128‑1 (MQ=255) ttAACAAATATCAAGACTTTGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTATTGAAGGTAAATATACTTCa < 2:2677691/128‑1 (MQ=255) ttAACAAATATCAAGACTTTGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCa < 2:4330853/128‑1 (MQ=255) ttAACAAATATCAAGACTTTGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCa < 1:1080243/128‑1 (MQ=255) tAACAAATATCAAGACTTTGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAg < 1:3071824/128‑1 (MQ=255) tAACAAATATCAAGACTTTGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAg < 2:2201363/128‑1 (MQ=255) tAACAAATATCAAGACTTTGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAg < 1:3681987/128‑1 (MQ=255) cAAATATCAAGACTTTGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTaa > 2:508198/1‑128 (MQ=255) cAAATATCAAGACTTTGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTAAATGAAGGTAAATATACTTCAGTaa > 2:857975/1‑128 (MQ=255) tatCAAGACTTTGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTATCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTaa > 2:588041/1‑128 (MQ=255) tatCAAGACTTTGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTaa < 1:2008343/128‑1 (MQ=255) atCAAGACTTTGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAg > 1:4172882/1‑128 (MQ=255) aCTTTGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGtttttt < 1:4407687/128‑1 (MQ=255) tttGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGa > 1:2528466/1‑128 (MQ=255) ttGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGAt < 1:2979354/128‑1 (MQ=255) tGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTATCTAAGTTTTTTGATc > 1:661044/1‑128 (MQ=255) tGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGAGGTTAAGGAAGGTAAATATTCTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATc > 1:1932652/1‑128 (MQ=255) tGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACAATTTATAATACTTTACATGAAATGCTAACTATTAAAAATGATCTTAATGAATCTATATATACTTCAGTACCTAAGattttttaga > 1:2312944/1‑124 (MQ=255) tGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTTTTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAATTATTCTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATgg > 1:900499/1‑128 (MQ=255) tGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTGAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATgg > 1:1526294/1‑128 (MQ=255) gATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATggg > 1:4114991/1‑128 (MQ=255) gATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATggg < 1:2747052/128‑1 (MQ=255) ttCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTATAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGtt < 1:1464483/128‑1 (MQ=255) tCAATTTTAATAGTTAAAGATTGAGAAAATACTATTTATAATTCTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTc < 2:2298630/128‑1 (MQ=255) aaTTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTa > 1:1303869/1‑128 (MQ=255) ttAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGAtt < 2:3150934/128‑1 (MQ=255) tAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTa > 1:72208/1‑128 (MQ=255) aaaGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTaaa > 1:2631597/1‑128 (MQ=255) aaaGTTAAAGATTTAGAAAATACTATATATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTaaa < 1:2896039/128‑1 (MQ=255) aGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAAt < 2:1128451/128‑1 (MQ=255) gTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAAtt < 1:1240380/128‑1 (MQ=255) gTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAAtt < 2:1332597/128‑1 (MQ=255) tAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAGTACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGCTTTAAATTAg > 1:1743248/1‑128 (MQ=255) tAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAg > 2:4128085/1‑128 (MQ=255) aaaGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGt < 2:4198883/128‑1 (MQ=255) aaaGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGt > 1:3457342/1‑128 (MQ=255) aaGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGtt > 1:3551797/1‑128 (MQ=255) aaGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTATTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGtt > 1:3807227/1‑128 (MQ=255) aGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGtta > 2:4434022/1‑128 (MQ=255) aGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGtta < 1:316885/128‑1 (MQ=255) aGATATAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGtta < 2:371820/128‑1 (MQ=255) aTTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGttatt < 1:1137538/128‑1 (MQ=255) tttAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTATATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGttatta > 1:4613909/1‑128 (MQ=255) ttAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTaa < 2:247619/128‑1 (MQ=255) ttAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTaa < 2:4257868/128‑1 (MQ=255) ttAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTaa < 1:4504542/128‑1 (MQ=255) tAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTaaa > 2:122666/1‑128 (MQ=255) gAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAg > 2:3867499/1‑128 (MQ=255) aaTACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAATGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCa < 2:767798/128‑1 (MQ=255) tATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCAAAAAc < 2:3956857/128‑1 (MQ=255) tATTTATAATACTTTAACTGAAATGATATTTATTTAAATTGATGTTAATGATGGTAAATATACTTCTGTAACTAAGTTTTTTTATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCAAAAAc < 1:2241738/128‑1 (MQ=255) aTTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTATATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCAAAAACt > 1:425155/1‑128 (MQ=255) ttATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCAAAAACTaa < 2:3399382/128‑1 (MQ=255) taataCTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCAAAAACTTAttt > 1:2386258/1‑127 (MQ=255) taataCTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCAAAAACTAATTa > 1:1844943/1‑128 (MQ=255) taCTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCAAAAACTAATTActc > 2:180744/1‑128 (MQ=255) aCTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCAAAAACTAATTActcc < 2:919387/128‑1 (MQ=255) aCTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCAAAAACTAATTActcc < 1:972673/128‑1 (MQ=255) aCTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCAAAAACTAATTActcc < 2:1887435/128‑1 (MQ=255) cTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCAAAAACTAATTActcct < 1:3623802/128‑1 (MQ=255) cTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCAAAAACTAATTActcct < 2:2049093/128‑1 (MQ=255) ttACAAGAACTGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCTGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCAAAAACTAATTACTCCTCa < 2:2409133/128‑1 (MQ=255) ttACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCAAAAACTAATTACTCCTCa < 1:2454796/128‑1 (MQ=255) tACAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAATGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCAAAAACTAATTACTCCTCaa < 1:492336/128‑1 (MQ=255) cAAGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCAAAAACTAATTACTCCTCAACt > 1:1399444/1‑128 (MQ=255) aGAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCAAAAACTAATTACTCCTCAACTTg < 2:1051970/128‑1 (MQ=255) gAAATGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCAAAAACTAATTACTCCTCAACTTGa > 2:1275920/1‑128 (MQ=255) aaaTGCTAGCTATTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCAAAAACTAATTACTCCTCAACTTGaa < 2:148427/128‑1 (MQ=255) aaTGCTTGCTATTAAATATGATGGTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAATATTAGTTATTAAAAGTCAAAAACTAATTACTCCTCAACTTGAAg < 2:2929393/128‑1 (MQ=255) ctagctaTTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCAAAAACTAATTACTCCTCAACTTGAAGATGc < 1:4007367/128‑1 (MQ=255) tagctaTTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCAAAAACTAATTACTCCTCAACTTGAAGATGCt < 2:3551797/128‑1 (MQ=255) tagctaTTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCAAAAACTAATTACTCCTCAACTTGAAGATGCt < 1:3292865/128‑1 (MQ=255) tagctaTTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCAAAAACTAATTACTCCTCAACTTGAAGATGCt < 2:2828190/128‑1 (MQ=255) gctaTTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGTGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCAAAAACTAATTAAACATCAACTTGAatataatag > 2:4639570/1‑123 (MQ=255) gctaTTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCAAAAACTAATTACTCCTCAACTTGAAGATGCTAg > 2:2126459/1‑128 (MQ=255) ctaTTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCAAAAACTAATTACTCCTCAACTTGAAGATGCTAGt < 2:3799533/128‑1 (MQ=255) aTTAAAATTGATGGTAATGAAGTTAAATATACTTCAGTAACTATGTTTTTTGATCAAATGGTTTCTAGATTATAATTAGTTATTAACTGTCTAAAACTAATTACTCCTCTCCTTTAAGATGCTAGTCa < 1:4330043/128‑1 (MQ=255) aTTAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCAAAAACTAATTACTCCTCAACTTGAAGATGCTAGTCa > 2:4530301/1‑128 (MQ=255) ttAAAAATGATTTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATTTGTTATAGATTAAAATTAGTTATTTAAAGTCAAAAACTAATTACTACTCAACTTGAAGATGATAGTCAt > 2:2601858/1‑128 (MQ=255) ttAAAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCAAAAACTAATTACTCCTCAACTTGAAGATGCTAGTCAt > 2:3310445/1‑128 (MQ=255) | AAGTGTTAAAGTAGAATTACAAGATGCAATTAACAAATATCAAGACTTTGTTCATGATTCAATTTTAAAAGTTAAAGATTTAGAAAATACTATTTATAATACTTTACAAGAAATGCTAGCTATTAGAAATGATGTTAATGAAGGTAAATATACTTCAGTAACTAAGTTTTTTGATCAAATGGGTTCTAGATTAAAATTAGTTATTAAAAGTCAAAAACTAATTACTCCTCAACTTGAAGATGCTAGTCAT > CP016816/113498‑113747 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |