| Predicted mutation | ||||||
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| JC | CP016816 | 462,630 | Δ57 bp | coding (2164‑2220/2238 nt) | JCVSYN2_02140 → | PTS sugar transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP016816 | 462687 = | 2 (0.000) | coding (2221/2238 nt) | JCVSYN2_02140 | PTS sugar transporter | |||||
Only 100 of 1301 total aligned reads displayed.
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AGTCAACTAGTTCTAAAACTAAAACAACAAAATAATAATTTTTAATTAAAGTACTCAATTTATCTCCCGAACCCCATATTCCGGACTAAAATCCAGGAAATGGGGTTTTTATATAAATCACTCTGTTT > 1:933410/1‑128 GTCAACTAGTTCTAAAACTAAAACAACAAAATAATAATTTTTAATTAAAGTACTCAATTTATCTCCCGAACCCCATATTCCGGACTAAAATCCAGGAAATGGGGTTTTTATATAAATCACTCTTTTTC > 2:1906199/1‑128 TCAACTAGTTCTAAAACTAAAACAACAAAATAATAATTTTTAATTAAAGTACTCAATTTATCTCCCGAACCCCATATTCCGGACTAAAATCCAGGAAATGGGGTTTTTATATAAATCACTCTTTTTCT > 1:422993/1‑128 CAACTAGTTCTAAAACTAAAACAACAAAATAATAATTTTTAATTAAAGTACTCAATTTATCTCCCGAACCCCATATTCCGGACTAAAATCCAGGAAATGGGGTTTTTATATAAATCACTCTTTTTCTA > 2:586807/1‑128 AACTAGTTCTAAAACTAAAACAACAAAATAATAATTTTTAATTAAAGTACTCGATTTATCTCCCGAACCCCATATTCCGGACTAAAATCCAGGAAATGGGGTTTTTATATAAATCACTCTTTTTCTAT < 1:1373066/128‑1 AACTAGTTCTAAAACTAAAACAACAAAATAATAATTTTTAATTAAAGTACTCAATTTATCTCCCGAACCCCATATTCCGGACTAAAATCCAGGAAATGGGGTTTTTATATAAATCACTCTTTTTCTAT < 2:754433/128‑1 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AGAAAAAGTAGTTGATGAAATGAAAGTTGAAAAACCAAAACAAACTAGAACAAAATCAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP016816/462488‑462629‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcaactagttctaaaACTAAAACAACAAAATAATAATTTTTAATTAAAGTACTCAATTTATCTCCCGAACCCCATATTCCGGACTAAAATCCAGGAAATGGGGTTTTTATATAAATCACTCTTTTTCTATTGTTCTATTTAA > CP016816/462687‑462813 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |