| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | = 165049 | 1851 (1.020) | 92 (0.060) | 49/222 | 61.0 | 5.4% | intergenic (+13/‑529) | JCVSYN2_00665/JCVSYN2_00670 | tRNA N6‑adenosine(37)‑N6‑threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit TsaB/tRNA‑Ser |
| ? | CP016816 | = 165050 | 1621 (1.010) | intergenic (+14/‑528) | JCVSYN2_00665/JCVSYN2_00670 | tRNA N6‑adenosine(37)‑N6‑threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit TsaB/tRNA‑Ser | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1885 total aligned reads displayed.
ATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAA > CP016816/164923‑165177 | ataaATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCtt < 2:710338/128‑1 (MQ=255)ataaATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAAATGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCtt > 1:2364132/1‑128 (MQ=255) taaATGATTATCTATTTGTTTATTTAAAAAATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTa < 2:2106092/128‑1 (MQ=255) taaATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAATAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTa < 2:512872/128‑1 (MQ=255) taaATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTa < 1:3655786/128‑1 (MQ=255) taaATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTa < 1:2087358/128‑1 (MQ=255) taaATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTa < 1:2755623/128‑1 (MQ=255) taaATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTa < 1:514556/128‑1 (MQ=255) taaATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTa < 1:3504347/128‑1 (MQ=255) aaaTGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAg < 2:2304850/128‑1 (MQ=255) aaTGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGa < 2:2353648/128‑1 (MQ=255) cAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCtttt > 2:1042411/1‑128 (MQ=255) cAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCtttt < 2:3249215/128‑1 (MQ=255) aaTTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCttttt < 2:1111349/128‑1 (MQ=255) ttGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTg > 2:1894831/1‑128 (MQ=255) gATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTa < 1:3576429/128‑1 (MQ=255) gATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTa < 1:2166747/128‑1 (MQ=255) tattTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTatta < 2:240691/128‑1 (MQ=255) attTAAAACATTATTTAGATTTAAATAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTattaa < 2:305683/128‑1 (MQ=255) attTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTattaa > 2:2711923/1‑128 (MQ=255) attTAAAAAATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTattaa < 2:3742108/128‑1 (MQ=255) tttAAAACATTATATAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTattaat < 2:3773553/128‑1 (MQ=255) tAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTattaatta < 1:1313876/128‑1 (MQ=255) aaaCATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAattatt > 1:662724/1‑128 (MQ=255) aCATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAAttattta > 2:1178395/1‑128 (MQ=255) cATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAattat > 1:3059319/1‑124 (MQ=255) cATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGAATTAAttatttat > 2:840906/1‑128 (MQ=255) attattTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTtata < 1:568000/128‑1 (MQ=255) ttattTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTatat < 2:1969265/128‑1 (MQ=255) ttattTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTatat < 2:2911074/128‑1 (MQ=255) tattTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATAtc < 2:428180/128‑1 (MQ=255) attTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTtata > 2:1257111/1‑125 (MQ=255) aGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATACTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCtt < 2:1516603/128‑1 (MQ=255) taTTTATAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATTATATTAAATTAAATAATTTATATATTATAAGTTTTATTTATAAAATTACTTTCTTAGATATTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCttt < 2:2991507/127‑1 (MQ=255) gATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCttt < 1:2428467/128‑1 (MQ=255) gATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCttt > 1:3880004/1‑128 (MQ=255) gATTTAAAAAAAAATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCttt < 1:3976313/128‑1 (MQ=255) aTTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTc > 1:1063092/1‑128 (MQ=255) aTTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTc > 1:1686437/1‑128 (MQ=255) tttAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCt > 2:3516754/1‑128 (MQ=255) tAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTAt < 1:2624340/128‑1 (MQ=255) aaaaaaaCATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTAtt < 1:1462923/128‑1 (MQ=255) aaaaaaaCATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTAtt > 2:1645903/1‑128 (MQ=255) aaaaCATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTAc < 1:370697/128‑1 (MQ=255) aaaCATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACt > 1:1390493/1‑128 (MQ=255) aCATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACttt > 1:3453032/1‑128 (MQ=255) cATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTa < 2:1450252/128‑1 (MQ=255) aTTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTaa > 2:1574427/1‑128 (MQ=255) ttttttTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAAt < 2:2039466/128‑1 (MQ=255) ttttATTAAAATTGATTATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAAt < 2:2521623/128‑1 (MQ=255) tttATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAAtt > 1:1823435/1‑128 (MQ=255) tttATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAAtt > 1:1000250/1‑128 (MQ=255) tattaAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGt < 1:2894101/128‑1 (MQ=255) attaAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTa > 1:3762101/1‑128 (MQ=255) aaaaTTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTCGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTAtta > 2:904782/1‑128 (MQ=255) aaaTTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTTTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTAttac > 1:1161052/1‑128 (MQ=255) attgtatatgatAATAAATTATATCCTTTATATATAAATAGTTTTATTTATAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTAttactt < 1:901676/121‑1 (MQ=255) aTTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTAttactt < 1:2983554/128‑1 (MQ=255) ttGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTAttacttt < 1:2832328/128‑1 (MQ=255) tatgatgatAATAAATTAAATACTTTATATATAAAAATTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTAACTTTAATTGTAttactttac < 2:2868369/127‑1 (MQ=255) gatgatgatAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTAttactttac < 1:3351260/128‑1 (MQ=255) gatgatgatAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTAttactttac < 1:3275274/128‑1 (MQ=255) gatgatgatAATAAATTAAATCATTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTAttactttac < 1:741680/128‑1 (MQ=255) atgatgatAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTAttactttact < 1:965216/128‑1 (MQ=255) gatgatAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAg < 2:266204/128‑1 (MQ=255) ataataAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGa > 2:645919/1‑128 (MQ=255) aataaATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGata > 2:3299209/1‑128 (MQ=255) aataaATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTAAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGata < 2:2594333/128‑1 (MQ=255) ataaATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGataa < 1:176634/128‑1 (MQ=255) ataaATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGataa > 2:1386482/1‑128 (MQ=255) taaattaaatCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGataat > 1:813925/1‑128 (MQ=255) attaaatCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATAtt < 2:361368/128‑1 (MQ=255) ttaaatCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATAttt < 2:3907262/128‑1 (MQ=255) agtcttttttTAAATAAAACTTTTTATATAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAg < 1:2688373/122‑1 (MQ=38) aaatCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGACAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAg < 2:1735160/128‑1 (MQ=255) aaatCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAg < 1:3212525/128‑1 (MQ=255) aaatCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTAAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAg < 2:2783365/128‑1 (MQ=255) atCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGtt < 2:2254675/128‑1 (MQ=255) atCCTTTATATATAAAAAGTTATATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGtt < 1:224348/128‑1 (MQ=255) atCCTTAAGATATAAAAAGTTTTATTAACAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTCTTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGtt < 2:3675795/128‑1 (MQ=255) tCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTTTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGttt > 2:3363200/1‑128 (MQ=255) tCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAtttt > 1:1886973/1‑128 (MQ=255) tttATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCAt > 2:2159136/1‑128 (MQ=255) ttATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCAtt > 1:3818709/1‑128 (MQ=255) tatatataAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTa > 1:1603002/1‑128 (MQ=255) tatatataAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTa > 2:1312417/1‑128 (MQ=255) atataAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATAAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATAGTATTACTTTACTAGTTGATAATAGTTAGTTTCATTAAtt > 1:1224096/1‑128 (MQ=255) aaGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCa > 2:3830906/1‑128 (MQ=255) ttatttaAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGAACTTGt > 2:790306/1‑128 (MQ=255) tatttaAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTa < 1:2032299/128‑1 (MQ=255) ttaAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGa > 2:571569/1‑128 (MQ=255) aaaaaaaGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAAt > 1:196339/1‑128 (MQ=255) aaaaaGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTa > 1:3148237/1‑128 (MQ=255) aaGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTa < 2:1813149/128‑1 (MQ=255) aGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTTATATTTATTTATATATCATATCTATTTAATTTAAATGTATTACTTTACTATTTTATAATAATTAGATTCATTAATATATCACAATTGTATGAATTAGTaa > 1:2308308/1‑128 (MQ=255) gtcTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAg < 1:2505021/126‑1 (MQ=255) cTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGaa < 2:3202426/128‑1 (MQ=255) ttAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGaaactaa < 2:3125176/128‑1 (MQ=255) tAGATAGTCTTTTTTTGTATTTATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGaaactaaa < 1:150569/128‑1 (MQ=255) tAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGaaactaaa > 2:3447260/1‑128 (MQ=255) | ATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAA > CP016816/164923‑165177 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |