| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1893757 = | 119 (1.180) | 12 (0.130) | 9/280 | 9.1 | 9.7% | intergenic (+46/‑376) | yoaB/yoaC | putative reactive intermediate deaminase/DUF1889 family protein |
| ? | NC_000913 | 1893784 = | 111 (1.160) | intergenic (+73/‑349) | yoaB/yoaC | putative reactive intermediate deaminase/DUF1889 family protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
GCTTGGGTTGTCGCGGGTCATGCGCCGGTGCGCTGCACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATGCCGTTGTGTTCGCCCTTTGAT > NC_000913/1893610‑1893904 | gCTTGGGTTGTCGCGGGTCATGCGCCGGTGCGCTGCACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACt > 1:433570/1‑149 (MQ=255) ttGGGTTGTCGCGGGTCATGCGCCGGTGCGCTGCACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGAGGTGTAAGATTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTgg > 2:168568/1‑149 (MQ=255) tGGGTTGTCGCGGGTCATGCGCCGGTGCGCTGCACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGt < 2:800047/149‑1 (MQ=255) gggTTGTCGCGGGTCATGCGCCGGTGCGCTGCACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTc > 2:1619096/1‑149 (MQ=255) gggTTGTCGCGGGTCATGCGCCGGTGCGCTGCACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTc > 2:390890/1‑149 (MQ=255) ggTTGTCGCGGGTCATGCGCCGGTGCGCTGCACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCg > 1:556473/1‑149 (MQ=255) tggTCGCGGGTCATGCGCCGGTGCGCAGAACGGTACAAGCGGGTGGGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATAAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCATTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGt < 2:1511047/147‑1 (MQ=255) tCGCGGGTCATGCGCCGGTGCGCTGCACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGtttt > 1:75632/1‑149 (MQ=255) tGCGCCGGTGCGCTGCACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCg > 1:279365/1‑149 (MQ=255) tGCGCCGGTGCGCTGCACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCg < 1:1206103/149‑1 (MQ=255) gcgcCGGTGCGCTGCACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGa > 1:1224794/1‑149 (MQ=255) gcgcCGGTGCGCTGCACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGa > 2:1473870/1‑149 (MQ=255) cgcCGGTGCGCTGCACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGAc < 1:946928/149‑1 (MQ=255) cgcCGGTGCGCTGCACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGAc > 1:299435/1‑149 (MQ=255) cgcCGGTGCGCTGCACGGTACAAGCGGCTTTGATGAACCAGAAGTAAAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGGGTAAGCGTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGAc < 1:1118339/149‑1 (MQ=255) gcCGGTGCGCTGCACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGAcc > 2:1545003/1‑149 (MQ=255) ccGGTGCGCTGCACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCa < 1:390890/149‑1 (MQ=255) ccGGTGAGCTGCACGGTACAAGCGGCTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGAGTAAGCTATATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCAATAAAACTCGTCGGATTTACATAATTCGACCa > 2:1339923/1‑149 (MQ=255) gcgcTGCACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAACTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGaa < 1:958387/149‑1 (MQ=255) tttcACGGTACAAGCGGGGTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCTGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATaa < 2:52731/146‑1 (MQ=255) cACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGat > 1:509438/1‑149 (MQ=255) cGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGatat > 1:876628/1‑149 (MQ=255) gTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTa < 2:556473/149‑1 (MQ=255) aaGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGt < 2:521047/149‑1 (MQ=255) aaGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGt > 1:960429/1‑149 (MQ=255) aaGCGGGTGTGATTAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGACGCAAAATAAGTCAGACGATATTTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGt < 2:1080465/149‑1 (MQ=255) aaGCGGGTATGATGAACCCGAAGTATATAGTTGAAATTTAGATAGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCATAGAATAAGATATTACTGt > 2:843167/1‑149 (MQ=255) aGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGtt > 2:1276916/1‑149 (MQ=255) gCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTg > 1:1557013/1‑149 (MQ=255) gCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTg > 2:528244/1‑149 (MQ=255) ggtgTTTGATGAACCAGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGa < 2:1381740/146‑1 (MQ=255) gTTTGATGAACCCGAAGTTTAAATTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAATCTTTATAGAAGCAAAATAAGTCAGTCGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGc < 2:1627578/149‑1 (MQ=255) gTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGc > 2:437209/1‑149 (MQ=255) ttGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCtt < 1:1020029/149‑1 (MQ=255) gatgaACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGTTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCt > 2:1032533/1‑149 (MQ=255) gatgaACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCt > 1:1148982/1‑149 (MQ=255) atgaACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTg > 2:115279/1‑149 (MQ=255) tgaACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGc < 2:75632/149‑1 (MQ=255) 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aTCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATGCCGTTGTGTTCg > 1:628381/1‑149 (MQ=255) cgttaataCTGGTCGGTTTTACATAAATCTACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATACACATAAACATGCCGTTGTGGTCGcc < 2:736724/146‑1 (MQ=255) gATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATGCCGTTGTGTTCGccc > 1:654022/1‑149 (MQ=255) ataataCTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATGCCGTTGTGTTCGCCCt > 2:1393302/1‑149 (MQ=255) taataCTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAataaacataaa > 2:430169/1‑128 (MQ=255) taataCTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAataaacataaa < 1:430169/128‑1 (MQ=255) aataCTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATGCCGTTGTGTTCGCCCttt < 1:1545003/149‑1 (MQ=255) aataCTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATGCCGTTGTGTTCGCCCttt < 2:692749/149‑1 (MQ=255) ataCTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATGCCGTTGTGTTCGCCCTTTg < 1:1392489/149‑1 (MQ=255) taCTTGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAAAAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTAATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTACCTATATAAATAAACATAAACATGCCGTTGTGTTCGCCCTTTGa < 2:1124391/149‑1 (MQ=255) aCTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATGCCGTTGTGTTCGCCCTTTGAt < 2:654022/149‑1 (MQ=255) aCTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATGCCGTTGTGTTCGCCCTTTGAt < 1:325283/149‑1 (MQ=255) | GCTTGGGTTGTCGCGGGTCATGCGCCGGTGCGCTGCACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATGCCGTTGTGTTCGCCCTTTGAT > NC_000913/1893610‑1893904 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |