| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_pae_pgi | = 227052 | 69 (0.570) | 26 (0.230) | 19/262 | 10.2 | 28.3% | noncoding (1294/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon |
| ? | NC_000913_3_pae_pgi | 2727910 = | NA (NA) | noncoding (1275/2904 nt) | rrlG | 23S ribosomal RNA of rrnG operon | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
CATGCACCGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAGGCGAGGCCGAAAGGCGTAGTCGA > NC_000913_3_pae_pgi/226904‑227136 | cATGCACAGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTc > 2:1326932/1‑150 (MQ=38) tGCACCGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGc > 2:1237576/1‑150 (MQ=39) gCACCGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGcc < 2:595825/150‑1 (MQ=39) gCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAg < 1:1077973/150‑1 (MQ=38) gCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAg > 4:134318/1‑150 (MQ=38) cGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTTGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGATATGCTGGAGTTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACTATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAgg < 1:1063506/150‑1 (MQ=255) cGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAgg > 3:532016/1‑150 (MQ=39) ggCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAggg > 3:396693/1‑150 (MQ=37) gCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGt < 1:550268/150‑1 (MQ=39) gCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGt > 3:258441/1‑147 (MQ=38) gCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGt < 4:258441/147‑1 (MQ=39) gCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTcc > 1:1260522/1‑150 (MQ=39) gCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTcc > 2:737510/1‑150 (MQ=38) aCGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGt > 4:439705/1‑150 (MQ=39) aCGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGt < 3:315914/150‑1 (MQ=38) cGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGATGAAATAAGTAAAGATAAAGCGGGAGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTc > 3:497190/1‑150 (MQ=255) ttATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCaa > 4:360730/1‑150 (MQ=39) ttATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCaa > 2:988699/1‑150 (MQ=39) ttATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCaa < 1:821019/150‑1 (MQ=38) tATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAAc < 2:967137/150‑1 (MQ=38) tGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTc < 1:404855/139‑1 (MQ=39) tGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTc > 2:404855/1‑139 (MQ=38) tGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGt < 1:132476/150‑1 (MQ=38) tGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGt < 2:952414/150‑1 (MQ=38) gCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGtt > 1:749322/1‑150 (MQ=37) gCGTTGGTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCCCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGtt > 1:752952/1‑150 (MQ=25) cGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGACTGCTGACTTAAGTAACGAGAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTGCAACGTTa > 1:1096165/1‑150 (MQ=255) cGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGGAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGTCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTa < 4:804121/150‑1 (MQ=25) gttgttGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTaa > 1:434671/1‑150 (MQ=35) gttgGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCg > 2:879785/1‑150 (MQ=35) ttgGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCgg < 3:523353/150‑1 (MQ=35) ttgGGTAGGGGAGCGTGCTGTAAGACTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCgg < 1:717783/150‑1 (MQ=25) gggAGGGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGGATCAGAAGTGCGAATGGGGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACAAAGTGTTGCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGt > 2:463382/1‑150 (MQ=11) gggAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGt < 1:52617/150‑1 (MQ=35) cGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTc > 2:286237/1‑150 (MQ=35) tCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGAc < 2:1260522/150‑1 (MQ=35) tGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGAccc > 2:1019132/1‑150 (MQ=35) tGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGAccc < 2:434671/150‑1 (MQ=34) tAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCggg > 4:819090/1‑131 (MQ=35) tAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCggg < 3:819090/131‑1 (MQ=37) tAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCt > 2:136282/1‑150 (MQ=35) tAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCt > 1:372278/1‑150 (MQ=35) tAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCt > 3:419219/1‑150 (MQ=35) aGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTaa > 3:744500/1‑150 (MQ=35) aGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTaa > 1:296219/1‑150 (MQ=35) gCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAg < 1:1237576/150‑1 (MQ=35) gCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAg > 1:1023321/1‑150 (MQ=35) ccTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAATGCGGGTGAAAAACCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAgg < 2:655987/150‑1 (MQ=25) ccTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAgg > 4:110939/1‑150 (MQ=35) tgtgAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAGGct < 1:491840/150‑2 (MQ=25) gtgAAGGTGTACTGTGAGGGATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAGGCGa < 2:1023321/150‑1 (MQ=17) tgAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAGGCGAg > 1:674391/1‑150 (MQ=35) tgAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAGGCGAg > 1:2835/1‑150 (MQ=35) aaGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGAGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAGGCGAGGc > 2:820757/1‑150 (MQ=25) gggTGTAATGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCACGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTAGACCCGTAAGGCGAggac > 2:269674/2‑148 (MQ=11) aGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAGGCGAGGcc > 1:114304/1‑150 (MQ=35) ggTGTACGGGGAGGTATGCTGGAGTTACCAAAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTGCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAGGCGAGGCCg < 3:387797/150‑1 (MQ=11) gtACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAGGCGAGGCCGaaa < 1:338719/150‑1 (MQ=34) tgtgAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAGGCGAGGCCGAAAGGCg < 1:1019132/150‑1 (MQ=32) tgAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGaa > 2:714543/1‑79 (MQ=34) tgAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGaa < 1:714543/79‑1 (MQ=35) tgAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAGGCGAGGCCGAAAGGCGTa < 3:32061/150‑1 (MQ=32) tgAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAGGCGAGGCCGAAAGGCGTa < 2:749322/150‑1 (MQ=32) tgAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAGGCGAGGCCGAAAGGCGTa > 1:287627/1‑150 (MQ=32) tgAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAGGCGAGGCCGAAAGGCGTa > 1:202618/1‑150 (MQ=32) gAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAGGCGAGGCCGAAAGGCGTAg > 2:725426/1‑150 (MQ=32) ggTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAGGCGAGGCCGAAAGGCGTAGTc < 1:988699/150‑1 (MQ=32) gTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAGGCGAGGCCGAAAGGCGTAGTCg > 1:100270/1‑150 (MQ=31) tATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGCCCTAGGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCCCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAAGGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAGGCGAGGCCGAAAGGCGTAGTCGa > 3:833349/1‑150 (MQ=11) | CATGCACCGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAGGCGAGGCCGAAAGGCGTAGTCGA > NC_000913_3_pae_pgi/226904‑227136 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |