| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913_3_hsa_pgi | 2514277 = | NA (NA) | 65 (0.870) | 56/290 | 0.3 | 91.7% | intergenic (+33/‑54) | nupC/insL1 | nucleoside (except guanosine) transporter/IS186 transposase |
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Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
GCTGCGGGTAGCGCAACAAACGTTGGTGTGCAGATCCTGGACAGAACGGGTGCTGCGCTGACGCTGGATGGTGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAACGATGAAAAGGAAGAGATTATTTCTATT > NC_000913_3_hsa_pgi/4543485‑4543781 | gCTGCGGGTAGCGCAACAAACGTTGGTGTGCAGATCCTGGACAGAACGGGTGCTGCGCTGACGCGGGATGGTGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCgg < 2:69139/149‑1 (MQ=255) tagagccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgg < 2:750521‑M2/2‑1 (MQ=255) tagagccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgg < 2:631006‑M2/2‑1 (MQ=255) 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caacaaACGTTGGTGTGCAGATCCTGGACAGAACGGGTGCTGCGCTGACGCTGGATGGTGCGACATTTAGTTCAGAAACACCCCTGAATTACGGAACCACTACCATTCCGGTCCCGGCGCGGGAATGTGCAACCGGGGCAGctccccag > 1:858147/1‑142 (MQ=255) gtaatgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcttaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGCCGCAACCCCggg > 2:947962‑M2/134‑149 (MQ=255) acaaACGTTGGTGTGCAGATCCTGGACAGAACGGGTGCTGCGCTGACGCTGGATGGTGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAACCCataa > 1:409186‑M2/1‑145 (MQ=255) acgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaatacaacaacccttaagttagcgcttatGGGCCGCAACCCCGGGt > 2:385326‑M2/133‑149 (MQ=255) aCGTTGGTGTGCAGATCCTGGACAGAACGGGTGCTGCGCTGACGCTGGATGGTGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAACCCataagcgc < 1:607154‑M2/149‑9 (MQ=255) gtgtGCAGATCCTGGACAGAACGGGTGCTGCGCTGACGCTGGATGGTGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGACCCAATAGCATTCCGTTCCAGGCGCGTTTAGTTGCAGCCTGTGACGCAACCCatacgcgggaactt < 2:590143‑M2/149‑15 (MQ=255) tgtgCAGATCCTGGACAGAACGGGTGCTGCGCTGACGCTGGATGGTGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAACCCataagcgctaactta < 1:936665‑M2/149‑16 (MQ=255) gtgCAGATCCTGGACAGAACGGGTGCTGCGCTGACGCTGGATGGTGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAACCCataagcgctaacttaa > 1:421206‑M2/1‑133 (MQ=255) atccagttcttcgggcgtaccaatatggtccataattgctgaccagttagcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaaaaccacaacccttaagttagcgcttatGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCg < 2:694930‑M2/29‑1 (MQ=255) tccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtgataccacaacccttaagttagcgcttatGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCgg > 1:926360‑M2/120‑149 (MQ=255) 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catcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGAc < 2:1172339‑M2/37‑1 (MQ=255) ttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGAcc > 1:256874‑M2/112‑149 (MQ=255) gggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGCCcttg > 2:511679‑M2/109‑148 (MQ=255) aCAGAACGGTTGCTTCTCTTACGCTGGATTGTGCGACATTTAGTTCTGAAACATCCCTGAATAACGTAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAACCCatatgcgctaacttaagggttgaaccatc > 1:721876‑M2/1‑120 (MQ=255) aCAGAACGGGTGCTGCGCTGACGCTGGATGGTGCGACATTTAGTTCAGAAGCAACCCTGAATATCGGAACCAATACCATTCCGTTGGCGGCGGGTTATTTTGGAGCCGGGGCCGCAACCCatatgcgctaacttaagggatgagcgtta < 2:819787‑M2/149‑30 (MQ=255) 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ttCCGTTCCAGGAGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAACCAataagcgctaacttaatggttgaaccatctgaagaattcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggat > 2:201319‑M2/1‑42 (MQ=255) taccgcaagccttaagttagcgcttatGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAATGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACTGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAAc < 2:595268‑M2/122‑1 (MQ=255) ccacaacccttaagttagcgcttatGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGCTGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAACGa > 2:1170460‑M2/26‑149 (MQ=255) ccacaacccttaagttagcgcttatGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAACGa < 1:552664‑M2/124‑1 (MQ=255) ccacaacccttaagttagcgcttatGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAACGa > 2:454889‑M2/26‑149 (MQ=255) cacaacccttaagttagcgcttatGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTAAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAACGAt > 2:301740‑M2/25‑149 (MQ=255) acaacccttaagttagcgcttatGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTGCAGGGCCGTCATTACGGGCAGGGATGCACACCCTTGTGCGATAAAAATAACGATg > 1:265029‑M2/24‑149 (MQ=255) aacccttaagttagcgctaatGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAACGATGaa < 1:1015637‑M2/128‑1 (MQ=255) cttaagttagcgcttatGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACACTTGTGCGATATAAATAACGATGATAAgg > 1:867273‑M2/18‑149 (MQ=255) ttaagttagcgcttatGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAACGATGAAAAGGa > 2:432736‑M2/17‑149 (MQ=255) ttaagttagcgcttatGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCGTGGGCGATAAAAATAACGATGAAAAGGa > 2:1025264‑M2/17‑149 (MQ=255) cgTTAGTTTGCAACCGGGGCCGCAACCCaaaagagctaacttaaggctttaaacagctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgattcctcgcgttcttcaattgccttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaat > 2:118038‑M2/1‑28 (MQ=255) ttATTTTGCAACCGGGGCCGCAACCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatgg > 2:1244805‑M2/1‑26 (MQ=255) ttATTTTGCAACCGGGGCCGCAACCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgccgcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatgg > 2:1104595‑M2/1‑26 (MQ=255) tcttttgcACCCGGGGCGGCAACCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctggcagggatactgtcccacgaatggc > 2:509529‑M2/3‑25 (MQ=255) ttagcgcttatGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAACGATGAAAAGGAAgaga > 1:745947‑M2/12‑149 (MQ=255) tagcgcttttGGGCCGCAACCCCGGGGGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCGCACCCTTGTGCGATAAAAATAACGATGAAAAGGAAGAGat < 1:385326‑M2/139‑1 (MQ=255) agcgcttatGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAACGATGAAAAGGAAGAGatt > 2:884770‑M2/10‑149 (MQ=255) cttatGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCGACCCAGGTTCAGGGCCGGCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATACCGATGAAAAGGAAGAGAGTAttt > 2:619081‑M2/6‑149 (MQ=255) atGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAACGATGAAAAGGAAGAGATTATTTCTa > 2:816176‑M2/3‑149 (MQ=255) tGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAACGATGAAAAGGAAGAGATTATTTCTAt < 2:436315‑M2/148‑1 (MQ=255) GGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAACGATGAAAAGGAAGAGATTATTTCTAtt > 2:946927‑M2/1‑149 (MQ=255) | GCTGCGGGTAGCGCAACAAACGTTGGTGTGCAGATCCTGGACAGAACGGGTGCTGCGCTGACGCTGGATGGTGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAACGATGAAAAGGAAGAGATTATTTCTATT > NC_000913_3_hsa_pgi/4543485‑4543781 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |