Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_000913 2,469,686 C→T Q186* (CAA→TAA)  gtrS → serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage

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  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_0009132,469,6860CT100.0% 226.8 / NA 57Q186* (CAA→TAA) gtrSserotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (23/34);  total (23/34)

CTGTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTA  >  NC_000913/2469545‑2469829
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cTGTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTatat                                                                                                                                        >  1:694059/1‑151 (MQ=255)
  gTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTa                                                                                                                                      >  2:1226405/1‑151 (MQ=255)
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     aaTGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAAcc                                                                                                                                   <  1:346146/151‑1 (MQ=255)
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                 atTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAgtg                                                                                                                       >  2:1176870/1‑151 (MQ=255)
                 atTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAgtg                                                                                                                       >  1:375273/1‑151 (MQ=255)
                 atTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAgtg                                                                                                                       >  1:1363878/1‑151 (MQ=255)
                 atTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAgtg                                                                                                                       >  2:504120/1‑151 (MQ=255)
                 atTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAgtg                                                                                                                       <  2:903551/151‑1 (MQ=255)
                      aTCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTAtt                                                                                                                   >  2:294072/1‑150 (MQ=255)
                      aTCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTc                                                                                                                  <  2:17840/151‑1 (MQ=255)
                         aaGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCata                                                                                                               <  1:633089/151‑1 (MQ=255)
                           gagCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCatatt                                                                                                             >  1:227460/1‑151 (MQ=255)
                               aaaTAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCatattatat                                                                                                         <  2:1359150/151‑1 (MQ=255)
                               aaaTAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCatattatat                                                                                                         <  2:86588/151‑1 (MQ=255)
                               aaaTAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCatattatat                                                                                                         <  1:1056980/151‑1 (MQ=255)
                               aaaTAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCatattatat                                                                                                         <  1:187812/151‑1 (MQ=255)
                                   aGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAttttt                                                                                                     >  2:187410/1‑151 (MQ=255)
                                    gTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAtttttt                                                                                                    >  2:1428911/1‑151 (MQ=255)
                                                      tttttGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTaa                                                                                  >  1:959119/1‑151 (MQ=255)
                                                         ttGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAatta                                                                               <  2:102593/151‑1 (MQ=255)
                                                                aTTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATc                                                                        <  1:1146147/151‑1 (MQ=255)
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                                                                                aaaCAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCgtggtg                                                        <  2:745761/151‑1 (MQ=255)
                                                                                   cAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGtgtg                                                      >  1:532082/1‑150 (MQ=255)
                                                                                   cAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGtgc                                                     <  2:1300914/151‑1 (MQ=255)
                                                                                        aaTCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGtgcttg                                                  >  2:852511/1‑149 (MQ=255)
                                                                                         aTCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTgcttgctt                                               >  1:80037/1‑151 (MQ=255)
                                                                                          tCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGcttgcttg                                              <  1:328510/151‑1 (MQ=255)
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                                                                                                        aTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCa                                <  1:1225827/151‑1 (MQ=255)
                                                                                                              ttCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCt                          <  1:196124/151‑1 (MQ=255)
                                                                                                                   tGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTc                     <  2:433936/151‑1 (MQ=255)
                                                                                                                     cTAATAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCaa                   >  2:61590/1‑151 (MQ=255)
                                                                                                                       aataatATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCaaaa                 >  2:388330/1‑151 (MQ=255)
                                                                                                                       aataatATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCaaaa                 >  1:515314/1‑151 (MQ=255)
                                                                                                                       aataatATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCaaaa                 >  2:715828/1‑151 (MQ=255)
                                                                                                                         taataTCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAgg               >  2:203656/1‑151 (MQ=255)
                                                                                                                             atCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGtgtt           >  1:557484/1‑151 (MQ=255)
                                                                                                                                    gCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAAt    >  1:1305398/1‑151 (MQ=255)
                                                                                                                                      tAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTa  <  1:715414/151‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                             |                                                                                                                                               
CTGTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTA  >  NC_000913/2469545‑2469829

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: