New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? CP016816 105365 =1161 (0.630)166 (0.100) 91/220 21.7 14.1% intergenic (+860/+66) JCVSYN2_00420/JCVSYN2_00430 translation elongation factor Tu/alanine‑‑tRNA ligase
?CP016816 = 105361 992 (0.610)intergenic (+856/+70) JCVSYN2_00420/JCVSYN2_00430 translation elongation factor Tu/alanine‑‑tRNA ligase
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff.
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold.

Only 100 of 1325 total aligned reads displayed.

AAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTAGTCTCATAAC  >  CP016816/105238‑105492
                                                                                                                                |                                                                                                                               
 aaaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTATCTAAGTATTTATTATTATTGATTAGTTTATTTATCATTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑aaaaa                                                                                                                                >  1:2635660/1‑128 (MQ=255)
 aaaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑aaaaa                                                                                                                                >  2:3485117/1‑128 (MQ=255)
     aaatttttatATTTTTAAAAAAAAAATATAAATTTTAATATAAATTATCTAATTTTTTATTTTGATTTTTTATTTTATTTATCCTTTTAAAATAATTAATTTAATTAAAATATTTTaaa‑aaaaaaaaa                                                                                                                            <  2:3541960/122‑1 (MQ=255)
      aattattaTATTTTTTAATTATAAATATTAATTTTAATATAAATTATCTAATTTTTTATTAGGATTTTTTATTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑aaaaaaaaaa                                                                                                                           <  1:833436/126‑1 (MQ=255)
      aCTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑aaaaaaaaaa                                                                                                                           >  2:263201/1‑128 (MQ=255)
        ttattaTAGTATTAAATAATTAATTTTAATGGTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGCTTGATTATTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑aaaaaaaaaaaa                                                                                                                         <  2:3149579/128‑1 (MQ=255)
         tattatAGTATGAAATAATAAAGATTAATTTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑aaaaaaaaaaaaa                                                                                                                        >  2:3056848/1‑128 (MQ=255)
         tattatAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTAAATATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAAAATAATAAATATAATAAAAATATTTTAAT‑aaaaaaaaaaaaa                                                                                                                        >  2:2501231/1‑128 (MQ=255)
          attatAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑aaaaaaaaaaaaaa                                                                                                                       >  2:3751800/1‑128 (MQ=255)
           ttatAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATAAGGATTTATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATATTaaa‑aaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                                      >  2:1512908/1‑128 (MQ=255)
            tataGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑aaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                                     >  1:3153896/1‑128 (MQ=255)
              taGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑aaaaaaaaaaaaaaacaa                                                                                                                   >  1:414726/1‑128 (MQ=255)
               tttATTAAATAATTAATTTTAATTTTAATATTAATTATCTAATTATTTTTTATGTTTTATTTTTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAaa‑aaaaaaaaaaaaaaaacaa                                                                                                                  <  2:215415/126‑4 (MQ=255)
               aGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑aaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                                  >  2:3199901/1‑127 (MQ=255)
                ttATGAAATATTTAATTTTAATGTTAATATAAATTATTTAAGTTTTTATTATTTTTTATTTTTTTATTTAAACTTTTAATAAAATGTATTTAATTAAAATTTTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACa                                                                                                                 <  2:3367567/127‑1 (MQ=255)
                ggagttaatattaaatattaATGTTATATTAAATTTGTTTAGTATTTATTAGGATTGATTTGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGATTTTAATTAAAATATTTTAAT‑aaaaaaaaaaaaaaaaacaa                                                                                                                 <  2:2094328/122‑4 (MQ=255)
                   ttaaaTAATAAATTTTAATTTTAAATTAAATTTGCTTATTATTTATTAGGATTTTTTAGTTTATTTATCCTTTTAATAAAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGAc                                                                                                             <  2:332519/126‑1 (MQ=255)
                    taaaTAATAAATTTTAATTTTAATATAAATTTGCTAATTATTTATTAGGTTTTATTATTTTATTTATCATTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTA‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCt                                                                                                           <  2:3262578/127‑1 (MQ=255)
                     aaaTAATAAAGATTAATTTTAATATAAATTATCTAATTATTTATTATGATTTTTTATTTTATTTATCATTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGAc                                                                                                             <  1:232587/128‑1 (MQ=255)
                     aaaTAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTATGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑Aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacaaa                                                                                                            >  2:35787/1‑124 (MQ=255)
                     aaaTAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑Aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaat                                                                                                            >  2:3682680/1‑124 (MQ=255)
                     aaaTAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑Aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                            >  2:942956/1‑124 (MQ=255)
                     aaaTAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑Aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                            >  1:3100286/1‑124 (MQ=255)
                      aataatAAATATTAATTTTAATATTAATTATATTATTTTTTATTATTATTTATTATTTTATTTATCATTTTAATATATTTAATTAAATTAAAATTTTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCt                                                                                                           <  1:368542/128‑1 (MQ=255)
                         aataaAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTATGATTGATTATTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑Aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                        >  2:100110/1‑120 (MQ=255)
                          ataaAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑Aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacaaaaaaa                                                                                                       >  2:843169/1‑119 (MQ=255)
                            aaaTATTAATTTTAATATAAAATATCTAATTATTTATTATGTTTTATTATTTTATTTATCATTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTg                                                                                                    <  1:2373099/128‑1 (MQ=255)
                                 ttAATTTTAAAATAAATTAGCTAATTATTTATTAGGTTTTATTAGTTTATTTATCATTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTaa                                                                                                <  1:1834761/128‑1 (MQ=255)
                                       ttaattaaAATTATTTAAGTTTTTATTATGATTTATTATTTTATTTAACATTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACaat                                                                                         <  1:1704268/128‑1 (MQ=255)
                                         aaTATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAAAAAAATATTATTAAAAAAaataa                                                                                       >  2:1252698/1‑126 (MQ=255)
                                          atatAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAGAAATAAAATTTATAAAAAAaataaa                                                                                      >  1:330807/1‑128 (MQ=255)
                                          aaataAATTAGTTAATTTATTATTATTATTTATTATTTTTTTTATTCTTTTAAAATAAATAATTTAATTAAAATTTTTTTAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACaattaa                                                                                      <  1:2573123/126‑1 (MQ=255)
                                           tattAATTATATAATTATTTATTATTATTTATTATTTTTTTTATAATTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTTAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACaattaa                                                                                      <  1:1383589/128‑1 (MQ=255)
                                             ttaattatattaGTATTTTTTATGATTTATTTTTTTATTTTTACTTTTAATATAATGTATTTAATTAAAATAATTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAattaatta                                                                                   <  1:1330992/117‑1 (MQ=255)
                                             taAATTAGATAAGTATTTATTAGGATTTATTATTTTATTTATACTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAg                                                                                 <  2:1602261/128‑1 (MQ=255)
                                             taAATTAACTAATTTTTTTTTAGTTTTTATTATTTTTTTTATCCTTTTAATAAAATTAATTTTATTAAAAAATTTTAAA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACaattaatt                                                                                    <  2:3402107/128‑1 (MQ=255)
                                               aattataaaattatttattTTTATTGATTATTTTATTTATACTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAAttaattaa                                                                                  <  1:521591/117‑1 (MQ=255)
                                                aatatcTAATTATTTATTATGATTGATTATTTTATTTATAATTTTAATAAAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGt                                                                                <  1:653741/123‑1 (MQ=255)
                                                aTTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAACATAAAAATTTTaaaaaaaaaaaaataaaa                                                                                >  2:3867416/1‑118 (MQ=255)
                                                aTTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTc                                                                               <  1:3579241/128‑1 (MQ=255)
                                                   tccTAACTATTTTTTAGTATTTATTATTTTATTTATCAATTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCtt                                                                             <  1:1891417/126‑1 (MQ=255)
                                                   atcaaattttttattATGATTTATTATTTTATTTATCATTTTAAAATAAAGAAATTAATTAAAATATTTTAA‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCtt                                                                             <  2:1048910/119‑1 (MQ=255)
                                                    tcTAATTATTTTTTTTGATTTATTATTTTATTTATAAATTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGa                                                                           <  1:2178882/127‑1 (MQ=255)
                                                     cTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAATATTTTTAAAAAAAAttaataaataatta                                                                            >  1:3942918/1‑122 (MQ=255)
                                                       aaGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATATTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATAAAATTTTAAAAAAAAAtaaattaaataataaa                                                                          >  1:2060350/1‑120 (MQ=255)
                                                        aGTTTTTATTTTGATTGTTTATTTTTTTTATAATTTTAATAAAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGAttt                                                                        <  2:3804473/128‑1 (MQ=255)
                                                        aGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAACATATTATT‑TTAAAAAAAATTAATTTATTatttatttt                                                                       >  2:497235/1‑127 (MQ=255)
                                                         ttattttttAGTATTTATTATTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAAAATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATtta                                                                       <  1:892430/127‑1 (MQ=255)
                                                          tatttattATGATTTATTATTTTATATATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAA‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATttat                                                                      <  1:2280766/128‑1 (MQ=255)
                                                            tttattTTGTTTTATTATTTTATTTATACTTTTAATATAATAAATTTAATTAAAATATTTTAAA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATttatt                                                                     <  2:2322936/128‑1 (MQ=255)
                                                             tttttaGTATTTATTATTTTATTTATACTTTTAAAATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTaa                                                                   <  2:3643415/125‑1 (MQ=255)
                                                              tattaGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATCAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACCAAGCCCTAAATTTTTAAAAAAAAATTAATTATTTGTTAATTAATTaaa                                                                  >  2:296566/1‑128 (MQ=255)
                                                                   ggATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAACATAAAATTTTTAAAAAAAATTAATTAAATATAAATTAATAAAAtatta                                                             >  2:1767131/1‑128 (MQ=255)
                                                                    tttttattattTTATTTATACTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAAtattat                                                            <  1:2734707/123‑1 (MQ=255)
                                                                     attgattAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAAATTTTTAAAAAAAATTAATTAATTATTAATATCTTaaaagattc                                                            >  2:3101365/1‑122 (MQ=255)
                                                                       tgattAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAACATAAAATTTTTAAAAAAAATAAATTAATTATTAATTTATAAAATATTAtttt                                                         >  2:1325023/1‑128 (MQ=255)
                                                                        ttagatcttatttatCCTTTTAAAATAATTAATTAAAATAAAAAATTTAAAT‑‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTa                                                      <  2:711783/121‑1 (MQ=255)
                                                                            aGTTTATTTATCCATTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AACACATAATTTAAATAAAAAAATAAAAATAAGACTTAAATTAATAAAAATAATTTTTTata                                                    >  1:3447183/1‑126 (MQ=255)
                                                                             gTTAATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACaa                                                  <  1:1006804/128‑1 (MQ=255)
                                                                                tatttatCATTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAAt                                                <  1:3478992/128‑1 (MQ=255)
                                                                                  tttatCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATACAAAAAATTATTAAAAAAAAAAAATTAATAAAAAATTTATTAAAAATAAATTTTTaaaaaaat                                               >  1:3533941/1‑126 (MQ=255)
                                                                                  tttatCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAA‑‑AA‑ACAAAAAATTTTTAAAAAAAAATAATTAATTAATTATTAATTAAAAATTATTTTTTAAAAAATTAAc                                            >  1:2000850/1‑128 (MQ=255)
                                                                                  tttatACTTTTAATTAAATTAATTTAATTAAAAATTTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAAttt                                              <  2:4014990/128‑1 (MQ=255)
                                                                                   ttataattttAATATAATTAAATTAATTAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTa                                             <  1:2867888/122‑1 (MQ=255)
                                                                                   ttatCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAAAATAAAATTTTTAAAAAAAAATAATTAAATAATTATTAAAAAAAAATAATTTTTTAAAAAATTTa                                             >  1:1434979/1‑128 (MQ=255)
                                                                                   ttatCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAAAAAAAAATTTTTAAAAAAAATTAATAAAATATTAATATAATAAAAATAATTTTTTAACAAAttaa                                             >  1:4014990/1‑126 (MQ=255)
                                                                                   ttatCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAA‑‑AATAAATAAAATTTTAAAAAAAAATAAATTAATAATTAATTAATAAAATATAATATTTAaaaaaaataaa                                            >  1:2122244/1‑123 (MQ=255)
                                                                                      tcattttAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCt                                          <  1:3190142/125‑1 (MQ=255)
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                                                                                                           aattaaAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATAAAATTTTTAAAAAAAATTAATTAATAATTTATTTATTATAAATTATTTTTTAAAAAATTTACATTTAAATAAATTATCGattaa                      >  2:1143836/1‑126 (MQ=255)
                                                                                                               aaaaTATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTTTTAAAAAAATTTAATTAAGTATTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACATTGAAAAAAAATAGCGTTTCCTCCa                  >  1:1070853/1‑128 (MQ=255)
                                                                                                               aaaaTATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTTTTAAAAAAAATTAATTAATTATTTATTTATAAAATATTATTTATTAACAAATTAACCTTTAGCTAAATAAGCGTTTCATCCAc                 >  2:589579/1‑128 (MQ=255)
                                                                                                                   tatTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGCCCTAATATTGTTAAAAACAATTATTTAAGTATTGATTTATTAAATATTATTTTTTAAAAAATTTACATTGAGCTAAATTAGCTTTTCATCAACAttt             >  2:3917424/1‑128 (MQ=255)
                                                                                                                    tattttAT‑AAAATAAAAAATAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCttt             <  1:2502855/126‑1 (MQ=255)
                                                                                                                    atTTTAAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTAg           <  1:121954/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                      tttAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAGACCTAATATTTTTAAAAAAAATTAATTAATAATTTATTTATTAAATATTATTTTTTAAAAAATTAAAATTGAGAAAAATTAGCTTTtccaacacattaatt          >  1:1531423/1‑116 (MQ=255)
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                                                                                                                       attttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaATAACTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACATTTAg           <  1:1960021/122‑1 (MQ=255)
                                                                                                                            ataaaaaaaaaaaaaaaaaCAAGACATAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTAGTCTCa      <  2:201857/126‑1 (MQ=255)
                                                                                                                             ataaaaaaaaaaaaaaaaCAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTAGTCTCAt     <  1:3819560/126‑1 (MQ=255)
                                                                                                                              aaaaaaaaaaaaataaaCAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTAGTCTCATa    <  1:707174/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                aaaaaaaataaaaaaCAAGATCTAATATTGTTAAAAACTATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTAGTCTCATAAc  <  2:436602/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                aaaaaaaaaaaaaaaaaaTACCTATTATTGTTAAAAAAAATTAATTTATAATTGATTTATTAAATATTATTTTTTAAAAAATTTCCATTAATATAAAATAACGTTACCTACACATATAGTCtaataaa  >  2:2283566/1‑127 (MQ=255)
                                                                                                                                aaaaaaaaaaaaaaaCAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTAGTCTCATAAc  <  1:3661971/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                |                                                                                                                               
AAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTAGTCTCATAAC  >  CP016816/105238‑105492

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.