BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	CP016816	396,431	G→A	intergenic (‑47/+83)	JCVSYN2_01730 ← / ← JCVSYN2_01735	50S ribosomal protein L13/ABC transporter permease

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	CP016816	396,431	0	G	A	99.6%	7222.8 / NA	2275	intergenic (‑47/+83)	JCVSYN2_01730/JCVSYN2_01735	50S ribosomal protein L13/ABC transporter permease
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (1092/1172); minor base T (1/9); total (1094/1181)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.21e-02
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 2319 total aligned reads displayed.

CCACAGTTTTATTTTCTGCATCAACGATATATCATTTTTTATTGATGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTGATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCTTTTTTTATACATCATTATCTTTTAAAGTTAGAGTTGCATCAGTTTT  >  CP016816/396306‑396555

cctcacttaaaTTATCTGCCTCACCGATAACTCATTTTTTATTGATGGCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAAt                                                                                                                            <  1:3806204/118‑1 (MQ=255)

ccACAGTTTTATTTTCTGCATCAACGATATATCATTTTTTATTGATGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAAt                                                                                                                            <  2:4530115/128‑1 (MQ=255)

  acaGTTTTATTTTCTGAATCATCGATATATAATTTTTTATTGATGTCTTTTGAAGAATTCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGtaataa                                                                                                                          <  1:1096122/128‑1 (MQ=255)

    aGTTTTATTTTCTGCATCAACGATATATCATTTTTTATTGATGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTATAAAGTGTAATAAGc                                                                                                                        >  2:1786170/1‑128 (MQ=255)

     gTTTTATTTTCTGCATCAACGATATATCATTTTTTATTGATGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATATGCa                                                                                                                       >  1:1295442/1‑128 (MQ=255)

      ttttATTTTCTGCATCAACGATATATCATTTTTTATTGATGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCAt                                                                                                                      >  2:317932/1‑128 (MQ=255)

      ttttATTTTCTGCATCAACGATATATCATTTTTTATTGATGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCAt                                                                                                                      >  2:1988636/1‑128 (MQ=255)

              tCTGCATCAACGATATATCATTTTTTATTGATGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTACTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATttat                                                                                                              <  1:3322592/128‑1 (MQ=255)

               cTGCATCAACGATATATCATTTTTTATTGATGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATttatt                                                                                                             <  1:4398469/128‑1 (MQ=255)

               cTGCATCAACGATATATCATTTTTTATTGATGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATttatt                                                                                                             <  1:3041847/128‑1 (MQ=255)

               cTGCATCAACGATATATCATTTTTTATTGATGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATttatt                                                                                                             <  2:2531662/128‑1 (MQ=255)

                tGCATCAACGATATATCATTTTTTATTGATGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATttatta                                                                                                            <  2:1569786/128‑1 (MQ=255)

                    tctaCGATATATCATTTTTTATTGATGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATtatata                                                                                                        <  1:1618563/125‑1 (MQ=255)

                    tCAACGATATATCATTTTTTATTTATGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGATAACTTCCTTTAATTGACTTTTCAGGGGTCTTTAAAGTCTAATAAGCATTAATTTATtatata                                                                                                        >  2:4036886/1‑128 (MQ=255)

                    tCAACGATATATCATTTTTTATTGATGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATtatata                                                                                                        >  2:5074227/1‑128 (MQ=255)

                    tCAACGATATATCATTTTTTATTGATGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATATGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTTTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATtatata                                                                                                        >  2:3524242/1‑128 (MQ=255)

                      aaCGATATATCATTTTTTATTTATGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTAATTTGTGATAACTTACTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATtatatata                                                                                                      <  1:3139831/128‑1 (MQ=255)

                        cGATATCTCATTTTTTATTGATGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAAt                                                                                                    <  1:1696315/128‑1 (MQ=255)

                          atatatCATTTTTTATTGATGTCTTTTGCAGATATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCt                                                                                                  <  2:5166494/128‑1 (MQ=255)

                          atatatCATTTTTTATTGATGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCt                                                                                                  >  1:5414773/1‑128 (MQ=255)

                           tatatCATTTTTTATTGATGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCtt                                                                                                 <  2:4711264/128‑1 (MQ=255)

                           tatatCATTTTTTATTGATGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCtt                                                                                                 >  1:297977/1‑128 (MQ=255)

                                cATTTTTTATTGATGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCt                                                                                            >  1:3418546/1‑128 (MQ=255)

                                cATTTTTTATTGATGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTGCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCt                                                                                            <  1:243181/128‑1 (MQ=255)

                                 aTTTTTTATTGATGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTa                                                                                           <  1:3247113/128‑1 (MQ=255)

                                    ttttATTGATGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTAttt                                                                                        >  2:5389786/1‑128 (MQ=255)

                                    ttttATTGATGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTGTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTAATATATATAATCTTAAGCTAtat                                                                                        >  2:331999/1‑126 (MQ=255)

                                    ttttATTGATGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTAAAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTAAAGCTAttt                                                                                        >  1:997638/1‑128 (MQ=255)

                                        aTTGATGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCa                                                                                    <  2:4615087/128‑1 (MQ=255)

                                        aTTGATGTCTTTTGCAGAAAGCATTGTAGTTCGTTTCATTTGTGATAACTTTCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCa                                                                                    <  2:1703506/128‑1 (MQ=255)

                                          tGATGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAat                                                                                  <  2:3418546/128‑1 (MQ=255)

                                          tGATGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAat                                                                                  <  1:4938305/128‑1 (MQ=255)

                                            aTGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTAGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAatat                                                                                <  2:4434072/128‑1 (MQ=255)

                                             tGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAAtata                                                                               >  1:4332903/1‑128 (MQ=255)

                                                cTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAact                                                                            <  1:5364531/128‑1 (MQ=255)

                                                cTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAact                                                                            >  1:4236145/1‑128 (MQ=255)

                                                  tttGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAactac                                                                          >  1:693755/1‑128 (MQ=255)

                                                  tttGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAactac                                                                          >  1:40274/1‑128 (MQ=255)

                                                   ttGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAactact                                                                         >  1:1179324/1‑128 (MQ=255)

                                                   ttGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAactact                                                                         >  1:2665809/1‑128 (MQ=255)

                                                   ttGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAactact                                                                         <  2:309148/128‑1 (MQ=255)

                                                   ttGCAGAAAGCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGGCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAactact                                                                         <  2:3736922/128‑1 (MQ=255)

                                                      cAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTaaa                                                                      >  1:4749085/1‑128 (MQ=255)

                                                       aGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTaaaa                                                                     >  1:275925/1‑128 (MQ=255)

                                                        gAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTaaaaa                                                                    >  1:810133/1‑128 (MQ=255)

                                                         aaaTCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAAt                                                                   >  1:4119294/1‑128 (MQ=255)

                                                               ttGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAAtt                                                             >  1:568931/1‑128 (MQ=255)

                                                               ttGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAAtt                                                             >  1:214158/1‑128 (MQ=255)

                                                               ttGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAAtt                                                             >  2:2934999/1‑128 (MQ=255)

                                                                tGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTg                                                            >  1:484835/1‑128 (MQ=255)

                                                                 gTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAAATTGCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGa                                                           <  1:5070524/128‑1 (MQ=255)

                                                                  tattttgtttCATTTGTGCTAACTTACTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGAt                                                          <  2:3007584/125‑1 (MQ=255)

                                                                  tAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGAt                                                          <  2:4362368/128‑1 (MQ=255)

                                                                    gtttgtttCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGTGGTCTTTAAAGTGTTATATGCATTAATTTATTAAATATAATCATAAGCTATGTATAAATAATACTACTAAAAATgaatatgaatc                                                        >  2:1496193/1‑118 (MQ=255)

                                                                    gtttgtttCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTc                                                        <  2:483304/128‑1 (MQ=255)

                                                                    gtttgtttCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATAGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTc                                                        <  2:2262029/128‑1 (MQ=255)

                                                                     tttgtttCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCa                                                       >  1:2863304/1‑128 (MQ=255)

                                                                      tttttgcATTTGTTCTAACTTCGTTTATTTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCAt                                                      <  2:2394516/122‑1 (MQ=255)

                                                                      ttgtttCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCATTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTAtt                                                                                         >  1:100114/1‑93 (MQ=255)

                                                                       tgtttCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATa                                                     >  1:4575006/1‑128 (MQ=255)

                                                                       tgtttCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATa                                                     >  2:5509788/1‑128 (MQ=255)

                                                                         tttCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTAATCAATATAACTACTAAAAATGCATATGATTCATACa                                                   >  2:1109745/1‑128 (MQ=255)

                                                                           tcttttGTGCTAACTTCATTTAATTGACTTGTCCGTGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATc                                                 <  2:4903158/125‑1 (MQ=255)

                                                                            cATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCt                                                >  2:3633211/1‑128 (MQ=255)

                                                                             aTTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCtt                                               >  1:1511020/1‑128 (MQ=255)

                                                                             aTTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCtt                                               >  1:1879612/1‑128 (MQ=255)

                                                                              tttGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCttt                                              >  1:2340436/1‑128 (MQ=255)

                                                                                tgttCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCGTTAATGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCttttt                                            <  2:4998302/128‑1 (MQ=255)

                                                                                   gCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTTAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGCTTCATACATCTTTTTTta                                         >  2:2761271/1‑128 (MQ=255)

                                                                                   gCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCTTTTTTta                                         >  1:3690971/1‑128 (MQ=255)

                                                                                      aaCTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCTTTTTTTATAc                                      <  2:1179324/128‑1 (MQ=255)

                                                                                       aCTTCGTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCTTTTTTTATAca                                     <  2:875144/128‑1 (MQ=255)

                                                                                       aCTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCTTTTTTTATAca                                     >  2:1411895/1‑128 (MQ=255)

                                                                                        cTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCTTTTTTTATAcat                                    <  2:4193605/128‑1 (MQ=255)

                                                                                        cTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCTTTTTATATAcat                                    >  2:4115683/1‑128 (MQ=255)

                                                                                            cTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCTTTTTTTATACATCAtt                                <  1:2010746/128‑1 (MQ=255)

                                                                                              ttAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAATTGCAATTGATTCATACATCTTTTTTTATACATCAGTAt                              >  2:1895268/1‑128 (MQ=255)

                                                                                              ttAATGGACTTGTCAGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGGATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCTTTTTTTATACATCATTAt                              <  2:3943444/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                aaTTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCTTTTTTTATACATCATTATCt                            >  2:771358/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                 aTTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCTTTTTTTATACATCATTATCtt                           >  1:4639038/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                 aTTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCTTTTTTTATACATCATTATCtt                           <  2:4251909/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                   tGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCTTTTTTTATACATCATTATCtttt                         <  1:225214/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                         gTCCGGTGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCTTTTTTTATACATCATTATCTTTTAAAGtt                   <  1:1408945/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                         gTCCGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCTTTTTTTATACATCATTATCTTTTAAAGtt                   <  2:2644210/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                           ccGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCTTTTTTTATAcatcat                                 >  1:3890056/1‑112 (MQ=255)

                                                                                                           ccGGGGTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCTTTTTTTATACATCATTATCTTTTAAAGTTag                 >  1:1801208/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                               ggTCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCTTTTTTTATACATCATTATCTTTTAAAGTTAGAGtt             >  1:5135615/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                 tCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAAGTACTAAAAATGCATTTGATTCATTCATCTTTTTTTATACATCATTATCTTTTAAAGTTAGCGTTGc           >  1:3545611/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                 tCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCTTTTTTTATACATCATTATCTTTTAAAGTTAGAGt              <  1:890408/125‑1 (MQ=255)

                                                                                                                 tCTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCTTTTTTTATACATCATTATCTTTTAAAGTTAGAGTTGc           >  2:679906/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                  cTTTAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAActacta                                                                        >  2:3810138/1‑66 (MQ=255)

                                                                                                                   tttAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCTTTTTTTATACATCATTATCTTTTAAAGTTAGAGTTGCAt         <  2:2844076/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                   tttAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCTTTTTTTATACATCATTATCTTTTAAAGTTAGAGTTGCAt         <  2:5303680/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                   tttAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCTTTTTTTATACATCATTATCTTTTAAAGTTAGAGTTGCAt         >  2:219732/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                    ttAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCTTTTTTTATACATCATTATCTTTTAAAGTTAGAGTTGCATc        >  1:5247531/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                     tAAAGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCTTTTTTTATACATCATTATCTTTTAAAGTTAGAGTTGCATCa       <  2:599887/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                      aaaGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCTTTTTTTATACATCATTATCTTTTAAAGTTAGAGTTGCATCAg      <  2:2105022/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                       aaGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCTTTTTTTATACATCATTATCTTTTAAAGTTAGAGTTGCATCAGt     <  1:256158/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                       aaGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCTTTTTTTATACATCATTATCTTTTAAAGTTAGAGTTGCATCAGt     <  2:1289672/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                        aGTGTAATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCTTTTTTTATACATCATTATCTTTTAAAGTTAGAGTTGCATCAGtt    >  1:4476668/1‑128 (MQ=255)

CCACAGTTTTATTTTCTGCATCAACGATATATCATTTTTTATTGATGTCTTTTGCAGAAATCATTGTAGTTTGTTTCATTTGTGCTAACTTCCTTTAATTGACTTGTCCGGGGTCTTTAAAGTGTGATAAGCATTAATTTATTATATATAATCTTAAGCTATTTATCAATATAACTACTAAAAATGCAATTGATTCATACATCTTTTTTTATACATCATTATCTTTTAAAGTTAGAGTTGCATCAGTTTT  >  CP016816/396306‑396555

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 14 ≤` `ATCG/ATCG` `< 21 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 36 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`