| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP016816 | 478,738 | C→A | G301V (GGT→GTT) | JCVSYN2_02210 ← | DNA‑directed RNA polymerase subunit beta' |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP016816 | 478,738 | 0 | C | A | 98.9% | 5612.3 / NA | 1953 | G301V (GGT→GTT) | JCVSYN2_02210 | DNA‑directed RNA polymerase subunit beta' |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (6/16); new base A (1010/906); total (1020/933) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.88e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 2001 total aligned reads displayed.
TGTAACATACGTTTTTCATTATTTACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTACCACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCATCAAAAGTTTCTAAACGTTTTAATAAT > CP016816/478612‑478863 | tGTAACATACGTTTTTCATTATTTACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATTATTCTTCTATATAAATCATTAAGGTCAGAAGTATTAAATCTaca > 1:4075360/1‑127 (MQ=255) tAACATACGTTTTTCATTATTTACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTaacac > 2:1719782/1‑128 (MQ=255) cATACGTTTTTCATTATTTACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCAt < 1:2284538/128‑1 (MQ=255) aatccGTTTTTCATTATTTAATATAATTGTTTGTTGATTCATTTATTTATATTTTTTTAATATTTAT‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTAAGAAGTTGTAAATGTAACACCAt < 1:3014067/124‑1 (MQ=255) tACGTTTTTCATTATTTACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCt < 1:4309759/128‑1 (MQ=255) cGTTTTTCATTATTTACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCATAAGTAGTAAATCTAACACCATCTaa > 2:1372881/1‑128 (MQ=255) tttCATTATTTACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGa < 1:506532/128‑1 (MQ=255) tttCATTATTTACAATAATTGATGGTGCACCAATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAAACATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAAttca > 1:2870183/1‑126 (MQ=255) attTACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTg > 2:114928/1‑128 (MQ=255) attTACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTg < 2:3100909/128‑1 (MQ=255) attTACAAAAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCCAACACCATCTAATTGAATAATTg > 1:1553649/1‑128 (MQ=255) tttACAATAATTGATGGTGTACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTgg < 2:4487067/128‑1 (MQ=255) tttACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATACATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTgg > 1:245260/1‑128 (MQ=255) tttACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTgg > 1:2551687/1‑128 (MQ=255) tttACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTgg > 2:3219220/1‑128 (MQ=255) ttACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGa > 1:3849721/1‑128 (MQ=255) ttACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTAA‑TTTATAATAATCATTCATCTATAAAAATAATTAATTTCATAAATAGTAAATCTAAAAACATCTAATTCaataaattta > 2:439124/1‑123 (MQ=255) ttACAATAATAGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTACAGAAGAAGTAAATCTAACACCATCTAAATGAATAATTGGa > 2:1310470/1‑128 (MQ=255) aCAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACg > 1:3270209/1‑128 (MQ=255) aCAATAAATGAAGGTGCAAACATATCTTTAACTTTTTTTAATATTTCA‑TTTATAAAAATTATTATTATATAAAAATCATTAATTTCAGAATTAGTAAATCTAACCCAATCTAATTGAATAAttctaag > 1:842008/1‑123 (MQ=255) cAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATATATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAAGTGAATAATTGGAAGa > 1:1900552/1‑128 (MQ=255) aataatTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGaa > 1:58980/1‑128 (MQ=255) ttGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCt > 1:1210270/1‑128 (MQ=255) tGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTTAATAATTGGACGAATGTCtg > 2:2830032/1‑128 (MQ=255) aTGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCtggt < 1:3757811/128‑1 (MQ=255) tGGTGCAACCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGTACGAATGTCtggt > 2:629368/1‑128 (MQ=255) gTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGa > 2:2739861/1‑128 (MQ=255) gcaacaaTTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAAt < 1:1624634/122‑1 (MQ=255) aCCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATaa < 2:3319915/128‑1 (MQ=255) aCCCATTTCTTTAAATTTTTTAAATCTTTCT‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGAAAATCAAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATaa < 1:2360994/128‑1 (MQ=255) ccAATTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACt < 2:1100177/128‑1 (MQ=255) acATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACt < 2:1615893/127‑1 (MQ=255) ttCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGaa < 2:3768087/128‑1 (MQ=255) ttCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATGCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGaa < 2:2926727/128‑1 (MQ=255) ttAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGATTTAc > 2:2656153/1‑128 (MQ=255) tAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTAct < 2:2108592/128‑1 (MQ=255) aCTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTActct < 2:3852004/128‑1 (MQ=255) aCTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTActct < 2:1993514/128‑1 (MQ=255) cTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGaata < 2:4532385/89‑1 (MQ=255) cTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACtctc < 2:721283/128‑1 (MQ=255) tttttttAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCa < 2:1253363/128‑1 (MQ=255) tttttttAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCa < 2:3441303/128‑1 (MQ=255) gtggtaagcgttCA‑TTTCTCATAAGTTTTCTGCTATATAAATCATTAATTTCTGAAGTAGTAAAGCAAACACCATCTAATGGAATAATTGGACTAATGGCTGGTGGAATCACTGGAATTACTCTCATa < 1:790497/118‑1 (MQ=255) ttttAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATTACTGGAATTACTCTCATaa > 1:2211853/1‑128 (MQ=255) ttttAATATTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTATATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATGTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTTGAATTACTCTCATaa < 2:3521979/128‑1 (MQ=255) ttttATCTTTGA‑TTTCTAATAATGATTCTTCAATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTATTTGAATAATTGGACGAATGTCTGGCGGAATAACTGGAATTACTCTCATAAc < 1:733885/128‑1 (MQ=255) tAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACca < 2:4085915/128‑1 (MQ=255) tAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACca < 1:66368/128‑1 (MQ=255) tAATCTTTAA‑TTTCTAATATTGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACca < 1:4010160/128‑1 (MQ=255) aaTCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACtctc > 2:4021329/1‑120 (MQ=255) tCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGTTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACcattc > 1:1799234/1‑128 (MQ=255) cTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACcattca < 2:3160660/128‑1 (MQ=255) cTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACcattca > 1:3945378/1‑128 (MQ=255) tttCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACcattcat < 2:3660957/128‑1 (MQ=255) tCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATATAATTGAATATTTGGCCGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCattcattc < 2:1931201/128‑1 (MQ=255) a‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAg < 1:3615155/128‑1 (MQ=255) a‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAg > 1:1126520/1‑128 (MQ=255) a‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAg < 1:1361712/128‑1 (MQ=255) ttCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGa > 2:3933284/1‑128 (MQ=255) taataaTGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGt < 2:1515052/128‑1 (MQ=255) aataatGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGtt > 2:2194636/1‑128 (MQ=255) taatGATTCTTCTATATAAATCATTAAATTCAGAAGTAGTAACTCTAACCCCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTgg < 1:3113205/128‑1 (MQ=255) aatGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGt < 1:3186314/128‑1 (MQ=255) aatGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACCTTGGt > 1:999121/1‑128 (MQ=255) aatGATTCTGCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGt < 1:2780494/128‑1 (MQ=255) atGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTgggt > 2:1440437/1‑126 (MQ=255) atGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGtt > 1:4163994/1‑128 (MQ=255) tGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCa > 1:2007313/1‑102 (MQ=255) tGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTa < 1:1000185/128‑1 (MQ=255) ttcttcTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTCACACCATCTAATTGACTAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGaa < 2:871651/128‑1 (MQ=255) tcttctATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAAc > 2:567435/1‑128 (MQ=255) ttctATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGt < 1:1276915/128‑1 (MQ=255) tctATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGtt < 1:1719782/128‑1 (MQ=255) atataAATCAATAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACAACATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTa < 2:1822724/128‑1 (MQ=255) ataAATCTATAAGTTCAGAAGTAGTAATTCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGTCGAATGTCTGGTGGATTAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTaaa < 1:2120757/128‑1 (MQ=255) ataAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATTACTGGAATTACTCTCATTCCCATTCATACAGGACGATGGTAAGCACGTGTTaac > 1:2941667/1‑127 (MQ=255) ataAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTaaa > 2:2489279/1‑128 (MQ=255) tataTCATTTATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAg < 2:2276996/125‑1 (MQ=255) taAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAg < 1:3674976/128‑1 (MQ=255) tCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAg > 1:3540122/1‑124 (MQ=255) tAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCATCaaaa < 1:4541382/128‑1 (MQ=255) tAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCATCaaaa < 2:4234650/128‑1 (MQ=255) aaTTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCATCAAAAg > 2:358644/1‑128 (MQ=255) aaTTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCATCAAAAg < 1:439126/128‑1 (MQ=255) aTTTGAGAAGTAGTACATCTAACACCATCTAATGGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCATCAAAAGt < 2:2996541/128‑1 (MQ=255) tttCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCATCAAAAGtt > 2:4149003/1‑128 (MQ=255) ttCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCATCAAAAGttt > 2:930121/1‑128 (MQ=255) cAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGAAGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCATCAAAAGTTTCt < 2:2577201/128‑1 (MQ=255) gAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGAATCAAAAGTATCTaa > 1:144226/1‑128 (MQ=255) aaGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGAGGAATAACTGGAATTCCTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGCACGTTTTAAAGCATCAAAAGTTTCTaaa > 1:3461605/1‑128 (MQ=255) tagtaAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCATCAAAAGTATCTAAACGt > 1:4470890/1‑128 (MQ=255) agtaAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCATCAAAAGTTTCTAAACGtt > 2:477026/1‑128 (MQ=255) agtaAATCTAACAACATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCATCAAAAGTTTCTAAACGtt < 2:794664/128‑1 (MQ=255) aaaTCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCATCAAAAGTTTCTAAACGTTTta > 1:933068/1‑128 (MQ=255) aaaTCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCATCAAAAGTTTCTAAACGTTTta > 1:2656768/1‑128 (MQ=255) aagcTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATTTCTGGGGGAATAATTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCATCAAAAGTTTCTAAACGTTTtaa < 1:4231160/125‑1 (MQ=255) ctCTAACACCATCTAAATGAATAAGTGGACGACTGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCCTTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCATCAAAAGTTTCTAAACGTTTtaat < 1:1065619/127‑1 (MQ=255) aTCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCATCAAAAGTTTCTAAACGTTTtaat > 2:4306543/1‑128 (MQ=255) tCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGAGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGACCGATTTAAAGCATCAAAAGTATCTAAACGTATtaata > 1:3357065/1‑128 (MQ=255) cTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTAATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCATCAAAAGATACTAAACTTTTtaataa > 2:2344531/1‑128 (MQ=255) | TGTAACATACGTTTTTCATTATTTACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCA‑TTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTACCACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCATCAAAAGTTTCTAAACGTTTTAATAAT > CP016816/478612‑478863 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |